Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 3,890,892 | IS1 (+) +9 bp | coding (657‑665/1248 nt) | tnaB → | tryptophan:H(+) symporter TnaB |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 116 (1.070) | 77/598 | 0.2 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 3890892 = | 0 (0.000) | coding (657/1248 nt) | tnaB | tryptophan:H(+) symporter TnaB |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
GGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGCAAAGATAAGTTAATCAAAAGCGTGGTATTTGGTTCGCTGCTGGCGCTGGTGATTTATCTCTTCTGGCTCTATTGCACCATGGGGAATATTCCGCGAGAAAGCTTTAAGGCGATTATCTCCTCAGGCGGCAACGTTGATTCGCTGGTGAAATCGTTCCTCGGCACCAAACAGCACGGCATTATCGAGTTTTGCCTGCTGGTGTTCTCTAACTTAGCTGTTGCCAGTTCGTTCTTTGGTGTCACGCTGGGGTTGTTCGATTATCTGGCGGACCTGTTTAAGATTGATAACTC > NC_000913/3890595‑3891191 | gggTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATgg > 2:491480/1‑300 (MQ=255) 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GGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGCAAAGATAAGTTAATCAAAAGCGTGGTATTTGGTTCGCTGCTGGCGCTGGTGATTTATCTCTTCTGGCTCTATTGCACCATGGGGAATATTCCGCGAGAAAGCTTTAAGGCGATTATCTCCTCAGGCGGCAACGTTGATTCGCTGGTGAAATCGTTCCTCGGCACCAAACAGCACGGCATTATCGAGTTTTGCCTGCTGGTGTTCTCTAACTTAGCTGTTGCCAGTTCGTTCTTTGGTGTCACGCTGGGGTTGTTCGATTATCTGGCGGACCTGTTTAAGATTGATAACTC > NC_000913/3890595‑3891191 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |