| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,890,892 | IS1 (+) +9 bp | coding (657‑665/1248 nt) | tnaB → | tryptophan:H(+) symporter TnaB |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 116 (1.070) | 77/598 | 0.2 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3890892 = | 0 (0.000) | coding (657/1248 nt) | tnaB | tryptophan:H(+) symporter TnaB | |||||
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ACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGCAAAGATAAGTTAATCAAAAGCGTGGTATTTGGTTCGCTGCTGGCGCTGGTGATTTATCTCTTCTGGCTCTATTGCACCATGGGGAATATTCCGCGAGAAAGCTTTAAGGCGATTATCTCCTCAGGCGGCAACGTTGATTCGCTGGTGAAATCGTTCCTCGGCACCAAACAGCACGGCATTATCGAGTTTTGCCTGCTGGTGTTCTCTAACTTAGCTGTTGCCAGTTCGTTCTTTGGTGTCACGCTGGGGTTGTTCGATTATCTGGCGGACCTGTTTAAGATTGATAACTCCCACGG > NC_000913/3890603‑3891197 | aCGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGgg > 2:40250‑M2/1‑298 (MQ=255) 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ttCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccgca < 1:58166‑M2/300‑270 (MQ=255) caataagttggagtcattaccTGGAAAACGCAAAGATAAGTTAATCAAAAGCGTGGTATTTGGTTCGCTGCTGGCGCTGGTGATTTATCTCTTCTGGCTCTATTGCACCATGGGGAATATTCCGCGAGAAAGCTTTAAGGCGATTATCTCCTCAGGCGGCAACGTTGATTCGCTGGTGAAATCGTTCCTCGGCACCAAACAGCACGGCATTATCGAGTTTTGCCTGCTGGTGTTCTCTAACTTAGCTGTTGCCAGTTCGTTCTTTGGTGTCACGCTGGGGTTGTTCGATTATCTGGCGGa > 1:798155‑M2/22‑300 (MQ=255) ccTGATTATTTACTATGGGAAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatggg > 2:130694‑M2/1‑24 (MQ=255) gtcattaccTGGAAAACGCAAAGATAAGTTAATCAAAAGCGTGGTATTTGGTTCGCTGCTGGCGCTGGTGATTTATCTCTTCTGGCTCTATTGCACCATGGGGAATATTCCGCGAGAAAGCTTTAAGGCGATTATCTCCTCAGGCGGCAACGTTGATTCGCTGGTGAAATCGTTCCTCGGCACCAAACAGCACGGCATTATCGAGTTTTGCCTGCTGGTGTTCTCTAACTTAGCTGTTGCCAGTTNGTTCTTTGGTGTCACGCTGGGGTTGTTCGATTATCTGGCGGACCTGTTTAAGAt > 2:631536‑M2/10‑300 (MQ=255) gtcattaccTGGAAAACGCAAAGATAAGTTAATCAAAAGCGTGGTATTTGGTTCGCTGCTGGCGCTGGTGATTTATCTCTTCTGGCTCTATTGCACCATGGGGAATATTCCGCGAGAAAGCTTTAAGGCGATTATCTCCTCAGGCGGCAACGTTGATTCGCTGGTGAAATCGTTCCTCGGCACCAAACAGCACGGCATTATCGAGTTTTGCCTGCTGGTGTTCTCTAACTTAGCTGTTGCCAGTTCGTTCTTTGGTGTCACGCTGGGGTTGTTCGATTATCTGGCGGACCTGTTTAAGAt < 1:129286‑M2/291‑1 (MQ=255) gtcattaccTGGAAAACGCAAAGATAAGGTAATCAAAATCGTGGTATTTGGTTCGCTGCTGGCGCTGTTGATTTATCTCTTCTTGCTCTATTGCACCATTGGGAATATTCCGCGAGAAAGCTTTAAGGCGATTATCTCCTCAGGCGGCAACGTTGATTCGCTGGTGAAATCGTTCCTCGGCACCAAACAGCACGGCATTATCGAGTTTTGCCTGCTGGTGTTCTCTAACTTAGCTGTTGCCAGTTCGTTCTGTGGTGTCACGCTGGGGTTGTTCGATTATCTGGCGGACCTGTTTAAGAt < 1:20162‑M2/291‑1 (MQ=255) | ACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGCAAAGATAAGTTAATCAAAAGCGTGGTATTTGGTTCGCTGCTGGCGCTGGTGATTTATCTCTTCTGGCTCTATTGCACCATGGGGAATATTCCGCGAGAAAGCTTTAAGGCGATTATCTCCTCAGGCGGCAACGTTGATTCGCTGGTGAAATCGTTCCTCGGCACCAAACAGCACGGCATTATCGAGTTTTGCCTGCTGGTGTTCTCTAACTTAGCTGTTGCCAGTTCGTTCTTTGGTGTCACGCTGGGGTTGTTCGATTATCTGGCGGACCTGTTTAAGATTGATAACTCCCACGG > NC_000913/3890603‑3891197 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |