| New junction evidence | |||||||||||
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AATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGCAAAGATA > NC_000913/3890425‑3890908 | aaTTTAAATTATCCCGTCGTCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTTCGTTAGg > 1:256063‑M2/1‑250 (MQ=255) 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tcagggacttgttcgcgccttccTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTTTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGaaa < 1:203060‑M2/227‑1 (MQ=255) cagggacttgttcgccccttccTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTGGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAAc < 2:196429‑M2/229‑1 (MQ=255) gacttgttcgcaccttccTTAGCCGCAAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCACGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCTGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGCa > 2:204912‑M2/19‑250 (MQ=255) tgttcgccccttccTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGCAAAg < 2:59932‑M2/235‑1 (MQ=255) tgGTTAAGTTCGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttagtgagatctctcccactgacgtatcatttggtccgcccgaaacaggttggccagcgtgaataacatcgccagttggttatagttt > 2:341448‑M2/1‑16 (MQ=255) | AATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGCAAAGATA > NC_000913/3890425‑3890908 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |