New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 3654624 = | 67 (0.630) | intergenic (+97/‑59) | slp/dctR | starvation lipoprotein/putative DNA‑binding transcriptional regulator DctR |
GAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3186391‑3186096 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAATTTTCTCACTCAAATTGAACGATTAAAACCTGTCCATGTCATTATTTTCTCCCCCTTTAATATTAAACGC > NC_000913/3654624‑3654919 GAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAATTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTG < 2:263914/300‑1 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TCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTT > 1:343089/1‑300 GGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCATTCGTaa > 2:264415/1‑298 GGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACAAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCA > 2:55512/1‑300 CTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAACTACTATTCTAGAAACGAGTATTAAGACTATCACTTATTTAATTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGACTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCAATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTAT < 2:390576/300‑1 GACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGAT > 1:366768/1‑300 TCAATCATATGTTCTACAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACAT < 1:837452/300‑1 CATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATG > 1:773406/1‑300 CATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAACTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTAACCGCNATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATG > 2:748463/1‑300 CTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAAT < 1:272334/300‑1 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CTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGT < 1:798806/300‑1 CCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGNCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGANGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTAT > 2:670428/1‑300 GTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAA > 1:841842/1‑300 GTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAATTTTCTCACTCA > 1:270629/1‑300 TTAAGACTATCACTTATTTAATTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAATTTTCTCACTCAAAT < 2:817559/300‑1 GACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCAAGTCTACCTGTTACTTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGGTCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATGCATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAATTCTCTAACTCAAcctgaa > 2:235865/1‑294 GACTATCAATTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAATTTTCTCACTCAAATTGAA > 1:357750/1‑300 ATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAATTTTCTCACTCAAATTGAACGAT > 1:766470/1‑300 ATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGTTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAATTTTCTCACTCAAATTGAACGATTAAAACC < 2:481850/300‑1 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GGGCCAGTCTACCTGTTAATTACCTGTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGTTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAATTTTCTCACTCAAATTGAACGATTAAAACCTGTCCATGTCATTATTTTCTCCCCCTTTAATAT < 1:210165/300‑1 CAGTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAATTTTCTCACTCAAATTGAACGATTAAAACCTGTCCATGTCATTATTTTCTCCCCCTTTAATATTAAA < 2:659756/300‑1 AGTCTACCTGTTAACTACCTTTGGCAAACTGAGTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCATGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAATTTTCTCACTCAAATTGAACGATTAAAACCTGTCCATGTCATTATTTTCTCCCCCTTTAATATTAAAC < 2:526787/300‑1 GTCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAATTTTCTCACTCAAATTGAACGATTAAAACCTGTCCATGTCATTATTTTCTCCCCCTTTAATATTAAACG > 1:385025/1‑300 TCTACCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAATTTTCTCACTCAAATTGAACGATTAAAACCTGTCCATGTCATTATTTTCTCCCCCTTTAATATTAAACGC < 1:768939/300‑1 GAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3186391‑3186096 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGTTAATTACCTTTGGCAAACTGATTATAAAGTTAATGTCCGCACCAGGAGTCGGTTATGTTTCTTATAATTACCAGGGATACGATGTTCTTCACCGCGATGAAAAACATTCTGAGTAAAGGTAATGTCGTTCATATACAGAACGAAGAAGAGATCGACGTAATGTTGCATCAGAATGCCTTCGTCATTATTGATACATTAATGAATAATGTATTTCATTCTAATTTTCTCACTCAAATTGAACGATTAAAACCTGTCCATGTCATTATTTTCTCCCCCTTTAATATTAAACGC > NC_000913/3654624‑3654919 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |