| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 1303840 | 38 (0.370) | 65 (0.660) | 44/578 | 1.1 | 64.4% | coding (7/909 nt) | oppC | murein tripeptide ABC transporter/oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppC |
| ? | NC_000913 | 1304051 = | 35 (0.350) | coding (218/909 nt) | oppC | murein tripeptide ABC transporter/oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppC | |||||
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AACCATTTTGTTTAATGCCATTGTCGATGTGCTATATGCGGTTATCGACCCGAAAATCCGTTACTGATACTGGAGCTCGCGATGATGTTAAGTAAGAAAAACAGCGAGACGCTGGAAAATTTCAGTGAAAAGCTGGAGGTCGAAGGGCGCAGCTTGTGGCAGGACGCACGTCGACGTTTTATGCATAACCGTGCGGCGGTTGCCAGTCTGATAGTGCTGGTGCTGATCGCGTTATTTGTAATCCTGGCACCGATGCTTTCCCAGTTTGCCTATGACGATACTGACTGGGCGATGATGTCCAGCGCCCCGGATATGGAGTCCGGTCACTACTTTGGTACTGACTCATCCGGTCGCGACCTGCTTGTGCGCGTTGCGATTGGCGGGCGTATCTCACTCATGGTCGGTGTTGCTGCGGCACTGGTGGCTGTGGTCGTCGGGACACTTTATGGTTCGCTTTCCGGTTATCTGGGCGGTAAAGTGGATTCGGTAATGATGCGTCTGCTGGAAATCCTCAACTCCTTCCCATTCATGTTCTTCGTCATTTTGCTGGTGACCTTTTTCGGTCAAAACATCCTGCTGATTTTCGTGGCGATAGG > NC_000913/1303753‑1304348 | tatgcggcggatcattttacgtcacgcattaaaacctgctctgttacccgtgctctcttatatgggccccgcatttgtcggcattattaccggttctatggttatcgaaaccatttatggtttgccggggattggacaactgttcgttaatggcgcattgaaccgtgactattccttagtgttaagcctgaccatcctggttggtgctttaaccattttgtttaatgccattgtcgatgtgctatatgcggttatcgacccgaaaatccgttactgatactggagctcgcgatgatgtcc < 1:674503‑M2/2‑1 (MQ=255)aaCCATTTTGTTTAATGCCATTGTCGATGTGCTATATGCGGTTATCGACCCGAAAATCCGTTACTGATACTGGAGCTCGCGATGATGTTAAGTAAGAAAAACAGCGAGACGCTGGAAAATTTCAGTGAAAAGCTGGAGGTCGAAGGGCGCAGCTTGTGGCAGGACGCACGTCGACGTTTTATGCATAACCGTGCGGCGGTTGCCAGTCTGATAGTGCTGGTGCTGATCGCGTTATTTGTAATCCTGGCACCGATGCTTTCCCAGTTTGCCTATGACGATACTGACTGGGCGATGATGTcc > 2:496719/1‑300 (MQ=255) ggcggatcattttacgtcacgcattaaaatctgctctgttacccgtgctctcttatatgggccccgcatttgtcggcattattaccggttctatggttatcgaaaccatttatggtttgccggggattggacaactgttcgttaatggcgcattgaaccgtgactattccttagtgttaagcctgaccatcctggttggtgctttaaccattttgtttaatgccattgtcgatgtgctatatgcggttatcgacccgaaaatccgttactgatactggagctcgcgatgatgtCCAgcgc < 2:356381‑M2/7‑1 (MQ=255) ggcggatcattttacgtcacgcattaaaacctgctctgttacccgtgctctcttatatgggccccgcatttgtcggcattattaccggttctatggttatcgaaaccatttatggtttgccggggattggacaactgttcgttaatggcgcattgaaccgtgactattccttagtgttaagcctgaccatcctggttggtgctttaaccattttgtttaatgccattgtcgatgtgctatatgcggttatcgacccgaaaatccgttactgatactggagctcgcgatgatgtCCAgcgc < 2:490904‑M2/7‑1 (MQ=255) gaaTGCCATTGTCGATGTGCTATATGCGGTTATCGACCCGAAAATCCGCTACTGATACTGGAGCTCGCGATGATGTTAAGTAAGAAAAACAGCGAGACGCTGGAAAATTTCAGNGAAAAGCTGGAGGTCGAAGGGCGCAGCTTGTGGCCGGACGCACGTCGACGTTTTATGCATANCCGTGCGGCGGTTGCCAGTCTGATAGTGCTGGTGCTGATCGCGTTATTTGTAATCCTGGCACCGATGCTTTCCCAGTTTGCCTATGACGATACTGACTGGGCGATGATGTCCAGCGCCCCGGat < 2:673604/299‑1 (MQ=255) attttacgtcacgcattaaaacctgctctgttacccgtgctctcttatatgggccccgcatttgtcggcattattaccggttctatggttatcgaaaccatttatggtttgccggggattggacaactgttcgttaatggcgcattgaaccgtgactattccttagtgttaagcctgaccatcctggttggtgctttaaccattttgtttaatgccattgtcgatgtgctatatgcggttatcgacccgaaaatccgttactgatactggagctcgcgatgatgtCCAGCGCCCCGGata > 1:663817‑M2/286‑300 (MQ=255) atttganttcacgcattaaaacctgctctgttacccgtgctctcttatatgggcnccgcatttgtcggcattattaccggttctatggttatcgaaaccatttatggtttgccggggattggacaactgttcgttaatggcgcattgaaccgtgactattccttagtgttaagcctgaccatcctggttggtgctttaaccattttgtttaatgccattgtcgatgtgctatatgcggttatcgacccgaaaatccgttactgatactggagctcgcgatgatgtCCAGCGCCCCGGata < 2:691500‑M2/15‑1 (MQ=255) ttacgtcacgcattaaaacctgctctgttacccgtgctctcttatatgggccccgcatttgtcggcattattaccggttctatggttatcgaaaccatttatggtttgcnggggattggacaactgttcgttaatggcgcattgaaccgtgactattccttagtgttaagcctgaccatcctggttggtgctttaaccattttgtttaatgccattgtcgatgtgctatatgcggttatcgacccgaaaatccgttactgatactggagctcgcgatgatgtCCAGCGCCCCGGATATgg < 1:594157‑M2/18‑1 (MQ=255) ttacgtcacgcattaaaacctgctctgttacccgtgctctcttatatgggccccgcatttgtcggcattattaccggttctatggttatcgaaaccatttatggtttgccggggattggacaactgttcgttaatggcgcattgaaccgtgactattccttagtgttaagcctgaccatcctggttggtgctttaaccattttgtttaatgccattgtcgatgtgctatatgcggttatcgacccgaaaatccgttactgatactggagctcgcgatgatgtCCAGCGCCCCGGATATgg < 1:175263‑M2/18‑1 (MQ=255) acgtcacgcattaaaacctgctctgctacccgtgctctcttatatgggccccacatttgtcggtattattaccggttctatggttatcgaaaccatttatggtttgccggggattggacaactgttcgttaatggcgcattgaaccgtgactattccttagtgttaagcccgaccatcctggttggtgctttaaccattttgtttaatgccattgtcgatgtgctatatgcggttatcgacccgaaaatccgttactgatactggagctcgcgatgatgtCCAGCGCCCCGGATATGGAg < 1:281323‑M2/20‑1 (MQ=255) 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ctgcgagatgtgtataagagaaaggatactggagctcgcgatgatgtCCAGCGCCCCGGATATGGAGTCCGGTCACTACTTTGGTACTGACTCATCCGGTCGCGACCTGCTTGTGCGCGTTGCGATTGGGGGGCGTATCTCACTCATGGTCGGTGTTGCTGCGGCACTGGTGGCTGTGGTCGTCGGGACACTTTATGGTTCGCTTTCCGGTTATCTGGGAGGTAAAGTGGATTCGGTAATGATGCGTCTGCTGGAAATCCTCAACTCCTTCCCATCCATGTTCTTCGTCATTTTGCTGGt > 2:181589‑M2/48‑300 (MQ=255) cgaaaagccgttactgatactggagctcgcgatgatgtCCAGCGCCCCGGATATGGAGTCCGGTCACTACTTTGGTACTGACTCATCCGGTCGCGACCTGCTTGTGCGCGTTGCGATTGGCGGGCGTATCTCACTCATGGTCGGTGTTGCTGCGGCACTGGTGGCTGTGGTCGGCGGGACACTTTATGGTTCGCTTTCCGGTTATCTGGGCGGTAAAGTGGATTCGGTAATGATGCGTCTGCTGGAAATCCTCAACTCCTTCACATTCATGTTCTTCGTCATTTTGCTGTTGACCttttt < 2:649271‑M2/262‑1 (MQ=255) gCCTATGACGATACTGACTGGGCGATGATGTCCAGCGCCCCGGATATGGAGTCCGGTCACTACTTTGGTACTGACTCATCCGGTCGCGACCTGCTTGTGCGCGTTGCGATTGGCGGGCGTATCTCACTCATGGTCGGTGTTGCTGCGGCACTGGTGGCTGTGGTCGTCGGGACACTTTATGGTTCGCTTTCCGGTTATCTGGGCGGTAAAGTGGATTCGGTAATGATGCGTCTGCTGGAAATCCTCAACTCCTTCCCATTCATGTTCTTCGTCATTTTGCTGGTGACCTTTTTCGGTCaa > 2:794104/1‑300 (MQ=255) gATACTGACTGGGCGATGATGTCCAGCGCCCCGGATATGGAGTCCGGTCACTACTTTGGTACTGACTCATCCGGTCGCGACCTGCTTGTGCGCGTTGCGATTGGCGGGCGTATCTCACTCATGGTCGGTGTTGCTGCGGCACTGGTGGCTGTGGTCGTCGGGACACTTTATGGTTCGCTTTCCGGTTATCTGGGCGGTAAAGTGGATTCGGTAATGATGCGTCTGCTGGAAATCCTCAACTCCTTCCCATTCATGTTCTTCGTCATTTTGCTGGTGACCTTTTTCGGTCAAAACATCctg > 2:278132/1‑300 (MQ=255) atactggagctcgcgatgatgtCCAGCGCCCCGGATATGGAGTCCGGTCACTACTTTGGTACTGACTCATCCGGTCGCGACCTGCTTGTGCGCGTTGCGATTGGCGGGCGTATCTCACTCATGGTCGGTGTTGCTGCGGCACTGGTGGCTGTGGTCGTCGGGACACTTTATGGTTCGCTTTCCGGTTATCTGGGCGGTAAAGTGGATTCGGTAATGATGCGTCTGCTGGAAATCCTCAACTCCTTCCCATTCATGTTCTTCGTCATTTTGCTGGTGACCTTTTTCGGTCAAAACATCctg > 1:131321‑M2/23‑300 (MQ=255) gTCCAGCGCCCCGGATATGGAGTCCGGTCACTACTTTGGTACTGACTCATCCGGTCGCGACCTGCTTGTGCGCGTTGCGATTGGCGGGCGTATCTCACTCATGGTCGGTGTTGCTGCGGCACTGGTGGCTGTGGTCGTCGGGACACTTTATGGTTCGCTTTCCGGTTATCTGGGCGGTAAAGTGGATTCGGTAATGATGCGTCTGCTGGAAATCCTCAACTCCTTCCCATTCATGTTCTTCGTCATTTTGCTGGTGACCTTTTTCGGTCAAAACATCCTGCTGATTTTCGTGGCGATAgg > 2:373283/1‑300 (MQ=255) | AACCATTTTGTTTAATGCCATTGTCGATGTGCTATATGCGGTTATCGACCCGAAAATCCGTTACTGATACTGGAGCTCGCGATGATGTTAAGTAAGAAAAACAGCGAGACGCTGGAAAATTTCAGTGAAAAGCTGGAGGTCGAAGGGCGCAGCTTGTGGCAGGACGCACGTCGACGTTTTATGCATAACCGTGCGGCGGTTGCCAGTCTGATAGTGCTGGTGCTGATCGCGTTATTTGTAATCCTGGCACCGATGCTTTCCCAGTTTGCCTATGACGATACTGACTGGGCGATGATGTCCAGCGCCCCGGATATGGAGTCCGGTCACTACTTTGGTACTGACTCATCCGGTCGCGACCTGCTTGTGCGCGTTGCGATTGGCGGGCGTATCTCACTCATGGTCGGTGTTGCTGCGGCACTGGTGGCTGTGGTCGTCGGGACACTTTATGGTTCGCTTTCCGGTTATCTGGGCGGTAAAGTGGATTCGGTAATGATGCGTCTGCTGGAAATCCTCAACTCCTTCCCATTCATGTTCTTCGTCATTTTGCTGGTGACCTTTTTCGGTCAAAACATCCTGCTGATTTTCGTGGCGATAGG > NC_000913/1303753‑1304348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |