| New junction evidence | |||||||||||
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ctgcgagatgtgtataagagaaaggatactggagctcgcgatgatgtccagcgccccggatatggagtccggtcactactttggtactgactcatccggtcgcgacctgcttgtgcgcgttgcgattggggggcgtatctcactcatggtcggtgttgctgcggcactggtggctgtggtcgtcgggacactttatggttcgctttccggttatctgggaggtaaagtggattcggtaatgatgcgtctgctggaaatcctcaactccttcccatccatgttcttcgtcattttgctggt > 2:181589‑M1/25‑47 (MQ=255) cGAAAAGCCGTTACTGATACTGGAGCTCGCGATGATGTccagcgccccggatatggagtccggtcactactttggtactgactcatccggtcgcgacctgcttgtgcgcgttgcgattggcgggcgtatctcactcatggtcggtgttgctgcggcactggtggctgtggtcggcgggacactttatggttcgctttccggttatctgggcggtaaagtggattcggtaatgatgcgtctgctggaaatcctcaactccttcacattcatgttcttcgtcattttgctgttgaccttttt < 2:649271‑M1/300‑263 (MQ=255) aTACTGGAGCTCGCGATGATGTccagcgccccggatatggagtccggtcactactttggtactgactcatccggtcgcgacctgcttgtgcgcgttgcgattggcgggcgtatctcactcatggtcggtgttgctgcggcactggtggctgtggtcgtcgggacactttatggttcgctttccggttatctgggcggtaaagtggattcggtaatgatgcgtctgctggaaatcctcaactccttcccattcatgttcttcgtcattttgctggtgacctttttcggtcaaaacatcctg > 1:131321‑M1/1‑22 (MQ=255) atgatgTTAAGTAAGAAAAACAGCGAGACGCTGGAAAATTTCAGTGAAAAGCTGGAGGTCGAAGGGCGCAGCTTGTGGCAGGACGCACGTCGACGTTTTATGCATAACCGTGCGGCGGTTGCCAGTCTGATAGTGCTGGTGCTGATCGCGTTATTTGTAATCCTGGCACCGATGCTTTCCCAGTTTGCCTATGACGATACTGACTGGGCGATGATGTCCAGCGCCCCGGATATGGAGTCCGGTCACTACTTTGGTACTGACTCATCCGGTCGCGACCTGCTTGTGCGCGTTGCGATTggc < 1:367490/300‑1 (MQ=255) gatgTTAAGTAAGAAAAACAGCGAGACGCTGGAAAATTTCAGTGAAAAGCTGGAGGTCGAAGGGCGCAGCTTGTGGCAGGACGCACGTCGACGTTTTATGCATAACCGTGCGGCGGTTGCCAGTCTGATAGTGCTGGTGCTGATCGCGTTATTTGTAATCCTGGCACCGATGCTTTCCCAGTTTGCCTATGACGATACTGACTGGGCGATGATGTCCAGCGCCCCGGATATGGAGTCCGGTCACTACTTTGGTACTGACTCATCCGGTCGCGACCTGCTTGTGCGCGTTGCGATTggcgg > 1:54916/1‑300 (MQ=255) atgTTAAGTAAGAAAAACAGCGAGACGCTGGAAAATTTCAGTGAAAAGCTGGAGGTCGAAGGGCGCAGCTTGTGGCAGGACGCACGTCGACGTTTTATGCATAACCGTGCGGCGGTTGCCAGTCTGATAGTGCTGGTGCTGATCGCGTTATTTGTAATCCTGGCACCGATGCTTTCCCAGTTTGCCTATGACGATACTGACTGGGCGATGATGTCCAGCGCCCCGGATATGGAGTCCGGTCACTACTTTGGTACTGACTCATCCGGTCGCGACCTGCTTGTGCGCGTTGCGATTggcggg > 1:426745/1‑300 (MQ=255) | CCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCTGGTTGGTGCTTTAACCATTTTGTTTAATGCCATTGTCGATGTGCTATATGCGGTTATCGACCCGAAAATCCGTTACTGATACTGGAGCTCGCGATGATGTTAAGTAAGAAAAACAGCGAGACGCTGGAAAATTTCAGTGAAAAGCTGGAGGTCGAAGGGCGCAGCTTGTGGCAGGACGCACGTCGACGTTTTATGCATAACCGTGCGGCGGTTGCCAGTCTGATAGTGCTGGTGCTGATCGCGTTATTTGTAATCCTGGCACCGATGCTTTCCCAGTTTGCCTATGACGATACTGACTGGGCGATGATGTCCAGCGCCCCGGATATGGAGTCCGGTCACTACTTTGGTACTGACTCATCCGGTCGCGACCTGCTTGTGCGCGTTGCGATTGGCGGG > NC_000913/1303541‑1304136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |