| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1596409 | 103 (1.010) | 35 (0.340) | 31/598 | 2.4 | 25.4% | intergenic (‑3967/+2208) | hipB/lsrK | antitoxin/DNA‑binding transcriptional repressor HipB/autoinducer‑2 kinase |
| ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
GGTGATAAATCCGGCATCTGCCGCCGCCTCACCGTGAGCAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCGCTTGCTTTATCGCCCAAAAAAGTAATATTTTGCGATACGAACTTACCGCCATCGCTAATAT > NC_000913/1596110‑1596705 | gttGATAAATCCGGCATCTGCCGCCGCCTCACCGTGAGCAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATac < 2:282997/298‑1 (MQ=255) 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tAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGCCGCATCCATAAGGTTCAGTGTGCCGATACCGCTTGCTTTATCGCACAAAAAAGTAATATTTTGCGATACGAACTTACCGCCATCGCTAat > 2:100304/1‑300 (MQ=255) aTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtccaaacatccgggcgaactggcgtgt > 2:307324‑M1/1‑4 (MQ=255) aTACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCGCTTGCTTTATCGCCCAAAAAAGTAATATTTTGCGATACGAACTTACCGCCATCGCTAatat < 1:495577/300‑1 (MQ=255) | GGTGATAAATCCGGCATCTGCCGCCGCCTCACCGTGAGCAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCGCTTGCTTTATCGCCCAAAAAAGTAATATTTTGCGATACGAACTTACCGCCATCGCTAATAT > NC_000913/1596110‑1596705 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |