| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1596409 | 103 (1.010) | 35 (0.340) | 31/598 | 2.4 | 25.4% | intergenic (‑3967/+2208) | hipB/lsrK | antitoxin/DNA‑binding transcriptional repressor HipB/autoinducer‑2 kinase |
| ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region | |||||
GCCTCACCGTGAGCAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1596135‑1596409‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAACTGGCGTGT < NC_000913/1651548‑1651253 GCCTCACCGTGAGCAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACANCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATCCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC < 2:627165/300‑1 GTGAGCAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTA < 2:490286/300‑1 CAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 1:137544/300‑1 TGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT < 1:115848/300‑1 CTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTACACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCATACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGACCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTG > 2:293454/1‑300 AACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGCGCGATAA > 1:33060/1‑300 CACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGNCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTNGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGC < 2:652589/300‑1 CAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGC < 1:303302/300‑1 ATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAA < 2:509620/300‑1 GGGTTAACTTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAA > 1:38115/1‑300 GGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCATACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAA > 1:383000/1‑300 AACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCT > 1:316498/1‑300 CCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACTTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAA < 1:118769/300‑1 CCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAA < 1:102084/300‑1 CCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTATGCAA > 1:638683/1‑300 GTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGT > 1:267182/1‑300 TACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGGTATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTATGCAAGGTT > 2:136637/1‑300 GTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTG > 1:513043/1‑300 TTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACNAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTNCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGC < 2:601701/300‑1 AGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAATGCCTATGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGAT > 2:280263/1‑300 GTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATG > 2:524742/1‑300 CTGCCCATCCACCCCCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATGACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAG < 2:287341/300‑1 CCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTAT > 1:634553/1‑300 TGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGC < 1:359608/300‑1 TTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGTTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCNCTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTC < 1:563767/300‑1 CTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTACGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAATTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCAATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGACATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCC > 2:242262/1‑300 GTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGG > 2:453258/1‑300 GTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGG > 1:818773/1‑300 GTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTATGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGG > 1:160248/1‑300 ATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGTTGGGAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTC < 2:382025/300‑1 CGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACC > 1:326993/1‑300 AACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTG > 1:57713/1‑300 TATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTCGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAA > 1:144206/1‑300 CAGTTCACCCGTGCCTAATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTATGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATC > 1:675447/1‑300 ATACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCAAACATCCGGGCGAACTGGCGTGT > 2:307324/1‑300 GCCTCACCGTGAGCAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1596135‑1596409‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAACTGGCGTGT < NC_000913/1651548‑1651253 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |