| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,652,518 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (+2533/+206) | ydfD → / ← ynfP | lysis protein/protein YnfP |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 104 (1.110) | 70/596 | 0.1 | 99.0% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
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| * | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 79 (0.840) | 59/598 | 0.3 | 98.7% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1652518 = | 1 (0.010) | intergenic (+2533/+210) | ydfD/ynfP | lysis protein/protein YnfP | |||||
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GGCGGGAACCAATCGGGTCATTCATCTTATTAAGCCAGCAATCGACGCTCTCCGGAGTCAGATGACATTAACGAGACTGAGCAAAGAGCATATCATTGATGTTCACTTCAGAGAGTATGGCAGAACAGAAAAACAAAAATGCACCTTTGTTTTTCAACCTGAAGTGTCAGCGAGAGTAAAAAATTATGGTGACCATTTTACCGTTGACTCAATAAGGCAGATGTGGGACGCAGCGATAAAACGTGCCGGACTCCGCCATCGAAAATCATATCAGTCGAGACATACTTATGCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGT > NC_000913/1652225‑1652811 | ggCGGGAACCAATCGGGTCATTCATCTTATTAAGCCAGCAATCGACGCTCTCCGGAGTCAGATGACATTAACGAGACTGAGCAAAGAGCATATCATTGATGTTCACCTCAGAGAGTATGGCAGAACAGAAAAACAAAAATGCACCTTTGTTTTTCAACCTGAAGTGTCAGCGAGAGTAAAAAATTATGGTGACCATTTTACCGTTGACTCAATAAGGCAGATGTGGGACGCAGCGATAAAACGTGCCGGACTCCGCCATCGAAAATCATATCAGTCGAGACATACTTATGCCTGCTGGta < 1:721259‑M2/300‑3 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aTCGAAAATCATATCAGTCGAGACATACTTATGCCTGCTGGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaagga < 2:430749‑M2/300‑260 (MQ=255) gataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATccc > 1:387868‑M2/36‑300 (MQ=255) agaCATACTTATGCCTGCTGGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgc < 2:402706‑M2/300‑280 (MQ=255) tACTTATGCCTGCTGGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggag < 1:184307‑M2/300‑285 (MQ=255) tACTTATGCCTGCTGGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcaattaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggag < 1:444891‑M2/300‑285 (MQ=255) aCTTATGCCTGCTGGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcgttggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgcaggaga < 2:122424‑M2/300‑286 (MQ=255) aCTTATGCCTGCTGGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccgnggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggaga < 1:509464‑M2/300‑286 (MQ=255) aatccaGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAANTTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATNCTTAGt > 2:600615‑M2/7‑300 (MQ=255) aatccaGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGt < 2:3155‑M2/294‑1 (MQ=255) | GGCGGGAACCAATCGGGTCATTCATCTTATTAAGCCAGCAATCGACGCTCTCCGGAGTCAGATGACATTAACGAGACTGAGCAAAGAGCATATCATTGATGTTCACTTCAGAGAGTATGGCAGAACAGAAAAACAAAAATGCACCTTTGTTTTTCAACCTGAAGTGTCAGCGAGAGTAAAAAATTATGGTGACCATTTTACCGTTGACTCAATAAGGCAGATGTGGGACGCAGCGATAAAACGTGCCGGACTCCGCCATCGAAAATCATATCAGTCGAGACATACTTATGCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGT > NC_000913/1652225‑1652811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |