Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,652,518 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (+2533/+206) | ydfD → / ← ynfP | lysis protein/protein YnfP |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 104 (1.110) | 70/596 | 0.1 | 99.0% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1652522 | 1 (0.010) | intergenic (+2537/+206) | ydfD/ynfP | lysis protein/protein YnfP | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 79 (0.840) | 59/598 | 0.3 | 98.7% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | 1652518 = | 1 (0.010) | intergenic (+2533/+210) | ydfD/ynfP | lysis protein/protein YnfP |
TTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1651262‑1651548 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGT > NC_000913/1652518‑1652811 TTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTANCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGAC < 1:491027/300‑1 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CATCAGTATCATGCACAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATG > 1:566255/1‑300 GTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAG > 1:709582/1‑300 ATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGT < 1:156507/300‑1 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gcgagatgtgtataagagacagTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACA > 1:626753/23‑300 GGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAG > 1:413227/1‑300 GTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGT > 1:540597/1‑300 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GAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATTGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCC < 1:623951/300‑1 TCGAGCATTATAACAAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAAC < 2:27726/300‑1 GAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGA < 1:721824/300‑1 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CGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAAACATGCACCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAAT > 2:423222/1‑300 GCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATA > 1:175403/1‑300 ATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATT > 2:427324/1‑300 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GGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCCTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCA > 2:661856/1‑300 gTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATATGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGC < 1:98630/299‑1 TTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATTGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGC < 1:151058/300‑1 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TAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCC < 1:12356/300‑1 aatTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGACAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATGTTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCA < 2:95658/297‑1 AGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATCAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCAT > 2:86006/1‑300 GTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATC > 1:425325/1‑300 GATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCC > 1:387868/1‑300 CAGATGTCTGGAAATATATGGGCAAATCCAGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATAC < 1:40003/300‑1 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGT > NC_000913/1652518‑1652811 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |