| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,461,938 | IS150 (–) +4 bp | coding (1046‑1049/1206 nt) | paaJ → | beta‑ketoadipyl‑CoA thiolase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1461941 | 0 (0.000) | 85 (0.810) | 57/598 | 0.5 | 100% | coding (1049/1206 nt) | paaJ | beta‑ketoadipyl‑CoA thiolase |
| ? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
GCAGGCAATGCTTCCGGGGTGAATGACGGAGCCGCTGCGTTGATTATTGCCAGTGAACAGATGGCAGCAGCGCAAGGACTGACACCGCGGGCGCGTATCGTAGCCATGGCAACCGCCGGGGTGGAACCGCGCCTGATGGGGCTTGGTCCGGTGCCTGCAACTCGCCGGGTGCTGGAACGCGCAGGGCTGAGTATTCACGATATGGACGTGATTGAACTGAACGAAGCGTTCGCGGCCCAGGCGTTGGGTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTTGATGAGTTACAGGCGTTGCAAACACAGCGTCTGAAATGGACGCTCAAACACGCGTATGAAAATGTGCC > NC_000913/1461640‑1462237 | tgattaatgtacatgtgctgctcgatcacagctttcacgaccttaatacgcaactctggatcagcactaacgcctttaggtttgggaattaaacctttttctccatgtttttcatagagggcaacccatgtcctgacctgggttcgggggacaccaaaacgtgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaAc > 2:17458‑M1/299‑300 (MQ=255)tgattaagggacatgtgctgctcgatcacagctttcacgaccttaatacgcaactctggatcagcactaacgcctttaggtttgggaattaaacctttttctccatgtttttcatagagggcaacccatgtcctgacctgggttcgggggacaccaaaacgtgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaAc > 1:799812‑M1/299‑300 (MQ=255) gattaagggacatgtgctgctcgatcacagctttcacgaccttaatacgcaactctggatcagcactaacgcctttaggtttgggaattaaacctttttctcaatgtttttcatagagggcaacccatgtcctgacctgggttcgggggacaccaaaacgtgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgctttttaaaagggtattttggctttgaaatattaggggctattccatttaatcgtacaacaaaatgggtgcagtacaACg < 2:239729‑M1/3‑1 (MQ=255) attaagggacatgtgctgctcgatcacagctttcacgaccttaatacgcaactctggatcagcactaacgcctttaggtttgggaattaaacctttttctccatgtttttcatagagggcaacccatgtcctgacctgggttcgggggacaccaaaacgtgccgagatgatcctgtaaccatcatcagttgtgaagtagtgattcacgacttcaaggcgcttttcaaaagggtattttggctttgacatattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaACgg > 1:276652‑M1/297‑300 (MQ=255) 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gCTTCCGGGGTGAATGACGGAGCCGCTGCGTTGATTATTGCCAGTGAACAGATGGCAGCAGCGCAAGGACTGACACCGCGGGCGCGTATCGTAGCCATGGCAACCGCCGGGGTGGAACCGCGCCTGATGGGGCTTGGTCCGGTGCCTGCAACTCGCCGGGTGCTGGAACGCGCAGGGCTGAGTATTCACGATATGGACGTGATTGAACTGAACGAAGCGTTCGCGGCCCAGGCGTTGGGTGTACTACGCGAATTTGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGtgtactg < 1:264062‑M1/300‑8 (MQ=255) cgtccGGGGTGAATGACGGAGCCGCTGCGTTGATTATTGCCAGTGAACAGATGGCAGCAGCGCAAGGACTGACACCGCGGGCGCGTATCGTAGCCATGGCAACCGCCGGGGTGGAACCGCGCCTGATGGGGCTTGGTCCGGTGCCTGCAACTCGCCGGGTGCTGGAACGCGCAGGGCTGAGTATTCACGATATGGACGTGATTGAACTGAACGAAGCGTTCGCGGCCCAGGCGTTGGGTGTACTACGCGAATTGGTGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGtgtactga < 2:106876‑M1/298‑9 (MQ=255) ttCCGGGGTGAATGACGGAGCCGCTGCGTTGATTATTGCCAGTGAACAGATGGCAGCAGCGCAAGGACTGACACCGCGGGCGCGTATCGTAGCCATGGCAACCGCCGGGGTGGAACCGCGCCTGATGGGGCTTGGTCCGGTGCCTGCAACTCGCCGGGTGCTGGAACGCGCAGGGCTGAGTATTCACGATATGGACGTGATTGAACTGAACGAAGCGTTCGCGGCCCAGGCGTTGGGTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGtgtactgac < 1:531834‑M1/300‑10 (MQ=255) 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GCAGGCAATGCTTCCGGGGTGAATGACGGAGCCGCTGCGTTGATTATTGCCAGTGAACAGATGGCAGCAGCGCAAGGACTGACACCGCGGGCGCGTATCGTAGCCATGGCAACCGCCGGGGTGGAACCGCGCCTGATGGGGCTTGGTCCGGTGCCTGCAACTCGCCGGGTGCTGGAACGCGCAGGGCTGAGTATTCACGATATGGACGTGATTGAACTGAACGAAGCGTTCGCGGCCCAGGCGTTGGGTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTTGATGAGTTACAGGCGTTGCAAACACAGCGTCTGAAATGGACGCTCAAACACGCGTATGAAAATGTGCC > NC_000913/1461640‑1462237 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |