Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,461,938 | IS150 (–) +4 bp | coding (1046‑1049/1206 nt) | paaJ → | beta‑ketoadipyl‑CoA thiolase |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1461938 = | 0 (0.000) | 74 (0.710) | 53/594 | 0.6 | 100% | coding (1046/1206 nt) | paaJ | beta‑ketoadipyl‑CoA thiolase |
? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1461941 | 0 (0.000) | 85 (0.810) | 57/598 | 0.5 | 100% | coding (1049/1206 nt) | paaJ | beta‑ketoadipyl‑CoA thiolase |
? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
GGCAATGCTTCCGGGGTGAATGACGGAGCCGCTGCGTTGATTATTGCCAGTGAACAGATGGCAGCAGCGCAAGGACTGACACCGCGGGCGCGTATCGTAGCCATGGCAACCGCCGGGGTGGAACCGCGCCTGATGGGGCTTGGTCCGGTGCCTGCAACTCGCCGGGTGCTGGAACGCGCAGGGCTGAGTATTCACGATATGGACGTGATTGAACTGAACGAAGCGTTCGCGGCCCAGGCGTTGGGTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1461643‑1461941 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < NC_000913/3722075‑3721779 GGCAATGCTTCCGGGGTGAATGACGGAGCCGCTGCGTTGATTATTGCCAGTGAACAGATGGCAGCAGCGCAAGGACTGACACCGCGGGCGCGTATCGTAGCCATGGCAACCGCCGGGGTGGAACCGCGCCTGATGGGGCTTGGTCCGGTGCCTGCAACTCGCCGGGTGCTGGAACGCGCAGGGCTGAGTATTCACGATATGGACGTGATTGAACTGAACGAAGCGTTCGCGGCCCAGGCGTTGGGTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGT > 1:767185/1‑300 ATGCTTCCGGGGTGAATGACGGAGCCGCTGCGTTGATTATTGCCAGTGAACAGATGGCAGCAGCGCAAGGACTGACGCCACGTGCGCGTATCGTAGCCATGGCAACCTCCGGGGTGGAACCGCGCCTGATGGGGCTTGGTCCGGTGCCTGCAACTCGCCGGGTGCTGGAACGCGCAGGGCTGAGTATGCACGATATGGACTTGATTGAACTGAACGAAGCGTTCGCGGCCCAGGCGTTGGTTGTACTACTCGAATTTGTGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGTGTAC < 2:424436/300‑1 ATGCTTCCGGGGTGAATGACGGAGCCGCTGCGTTGATTATTGCCAGTGAACAGATGGCAGCAGCGCAAGGACTGACACCGCGGGCGCGTATCGTAGCCATGGCAACCGCCGGGGTGGAACCGCGCCTGATGGGGCTTGGTCCGGTGCCTGCAACTCGCCGGGTGCTGGAACGCGCAGGGCTGAGTATTCACGATATGGACGTGATTGAACTGAACGAAGCGTTCGCGGCCCAGGCGTTGGGTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGTGTAC < 1:126921/300‑1 GCTTCCGGTGTGAATGACGGAGCCGCTGCGTTGATTATTGCCAGTGAACAGATGGCAGCAGCGCAAGGACTGACACCGCGGGCGCGTATCGTAGCCATGGCAACCGCCGGGGTGGAACCGCGCCTAATGGGGCTTGGTCCGGTGCCTGCAACTCGCCGGGTGCTGGAACGCGCAGGGCTGAGTATTCACGATATGGACGTGACTGAACTGAACGAAGCGTTCGCGGCCCAGGCGTTGGGTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGTGTACTG < 2:416944/300‑1 GCTTCCGGGGTGAATGACGTAGCCGCTGCGTTGATTATTGCCAGTGAACAGATGGCAGCAGCGCAAGGACTGACACCGCGGGCGCGTATCGTAGCCATGGCAACCGCCGGGGTGGAACCGCGCCTGATGGGGCTTGGTCCGGTGCCTGCAACTCGCCGGGTGCTGGAACGCGCAGGGCTGAGTATTCACGATATGGACGTGATTGAACTGAACTAAGCGTTCGCGGCCCAGGCGTTGGGTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGTGTACTG < 2:218007/300‑1 GCTTCCGGGGTGAATGACGGAGCCGCTGCGTTGATTATTGCCAGTGAACAGATGGCAGCAGCGCAAGGACTGACACCGCGGGCGCGTATCGTAGCCATGGCAACCGCCGGGGTGGAACCGCGCCTGATGGGGCTTGGTCCGGTGCCTGCAACTCGCCGGGTGCTGGAACGCGCAGGGCTGAGTATTCACGATATGGACGTGATTGAACTGAACGAAGCGTTCGCGGCCCAGGCGTTGGGTGTACTACGCGAATTTGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGTGTACTG < 1:264062/300‑1 cgTCCGGGGTGAATGACGGAGCCGCTGCGTTGATTATTGCCAGTGAACAGATGGCAGCAGCGCAAGGACTGACACCGCGGGCGCGTATCGTAGCCATGGCAACCGCCGGGGTGGAACCGCGCCTGATGGGGCTTGGTCCGGTGCCTGCAACTCGCCGGGTGCTGGAACGCGCAGGGCTGAGTATTCACGATATGGACGTGATTGAACTGAACGAAGCGTTCGCGGCCCAGGCGTTGGGTGTACTACGCGAATTGGTGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGTGTACTGA < 2:106876/298‑1 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GGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATAC < 1:188406/300‑1 GGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATGGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATAC < 1:235367/300‑1 GCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGT > 1:113210/1‑300 GCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTAAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGT > 1:245913/1‑300 GATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTT > 1:740622/1‑300 CCCCACATGTTAACCCCAACGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGAT > 1:51102/1‑300 CCCCACATGTTAACCCCAACGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGAGTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGAT > 1:131253/1‑300 CCCACATGTTAACCCCAACGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATA > 1:392547/1‑300 GTTAACCCCAACGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGAT < 2:22704/300‑1 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < NC_000913/3722075‑3721779 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |