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Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
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aGCAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttgaaaagcgccttgaagtcgtgaatcactacttcacaactgatgatggttacaggatcatctcggcacgttttggtgtcccccgaacccaggtcaggacatgggttgccctctatgaaaaacatggagaaaaaggtttaattcccaaacctaaaggcgttagtgctgatccagagttgcgtattaaggtcgtgaaagctgtgatcgagcagcacatgtccattaat > 1:341519‑M1/1‑4 (MQ=255) gCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCATTTTTCACTGATGCCAGATCGACCAGAATACAATCTTTCGGTAAAGGCGGTAATTTGCCAATAACTTGCTCAGTAACGTGGATTGGCACACTAACAATCACCATTCCGGCATCGGCAACAATATCAGCCGCTCGATCCCAGTCATGTTGCTCCAGAATCCGCACCTGATAACCCGAGAGGGTCAGCATCTTCTCGAACAGGCGTCCCATCTGACCGCCACCGCCGACGATAACCACCGGACGCAGTGACGGACaaa > 2:562540/1‑300 (MQ=255) aCCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCATTTTTCACTGATGCCAGATCGACCAGAATACAATCTTTCGGTAAAGGCGGTAATTTGCCAATAACTTGCTCAGTAACGTGGATTGGCACACTAACAATCACCATTCCGGCATCGGCAACAATATCAGCCGCTCGATCCCAGTCATGTTGCTCCAGAATCCGCACCTGATAACCCGAGAGGGTCAGCATCTTCTCGAACAGGCGTCCCATCTGACCGCCACCGCCGACGATAACCACCGGACGCAGTGACGGACAAAgt < 1:158889/300‑1 (MQ=255) | CGACCATCGCCAGCTCAAGGCGGTAAATCGGCGAAGAGAGCGCCAGAAGTTGCTCAAGCTGAACATTTTCTTCTGCCAGGTGCAGCCCGTAAGCAAAAGTAGCAAAGTGGCGCAGTGCCTGAATAAACGCCATATTCTGATCGTGCTCGACGGCGCTAATACGATGCAGCCGAGCGCCCCAGACCTGAATTTGCTCCAGAAACCATTGGTATGCTTCCGGTTTACGTCCATCACACCAGACCACAACTTGCTTTGCCAGGCTACCGCTGTCCGGACCGAACATCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCATTTTTCACTGATGCCAGATCGACCAGAATACAATCTTTCGGTAAAGGCGGTAATTTGCCAATAACTTGCTCAGTAACGTGGATTGGCACACTAACAATCACCATTCCGGCATCGGCAACAATATCAGCCGCTCGATCCCAGTCATGTTGCTCCAGAATCCGCACCTGATAACCCGAGAGGGTCAGCATCTTCTCGAACAGGCGTCCCATCTGACCGCCACCGCCGACGATAACCACCGGACGCAGTGACGGACAAAGT > NC_000913/2739193‑2739791 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |