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Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
CCGACCATCGCCAGCTCAAGGCGGTAAATCGGCGAAGAGAGCGCCAGAAGTTGCTCAAGCTGAACATTTTCTTCTGCCAGGTGCAGCCCGTAAGCAAAAGTAGCAAAGTGGCGCAGTGCCTGAATAAACGCCATATTCTGATCGTGCTCGACGGCGCTAATACGATGCAGCCGAGCGCCCCAGACCTGAATTTGCTCCAGAAACCATTGGTATGCTTCCGGTTTACGTCCATCACACCAGACCACAACTTGCTTTGCCAGGCTACCGCTGTCCGGACCGAACATCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCATTTTTCACTGATGCCAGATCGACCAGAATACAATCTTTCGGTAAAGGCGGTAATTTGCCAATAACTTGCTCAGTAACGTGGATTGGCACACTAACAATCACCATTCCGGCATCGGCAACAATATCAGCCGCTCGATCCCAGTCATGTTGCTCCAGAATCCGCACCTGATAACCCGAGAGGGTCAGCATCTTCTCGAACAGGCGTCCCATCTGACCGCCACCGCCGACGATAACCACCGGACGCAGTGACGGACAAA > NC_000913/2739192‑2739789 | gtatgagaagatatcaaaatatccttaaagaacatggtattaaacaaagcatgtccagaaaaggcaattgtctggataatgctgtggtggagtgttgctttggaaccttaaagtcggagtgtttttatcttgatgagttcagtaatataagcgaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGc > 1:60646‑M1/299‑300 (MQ=255) 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aGCAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttgaaaagcgccttgaagtcgtgaatcactacttcacaactgatgatggttacaggatcatctcggcacgttttggtgtcccccgaacccaggtcaggacatgggttgccctctatgaaaaacatggagaaaaaggtttaattcccaaacctaaaggcgttagtgctgatccagagttgcgtattaaggtcgtgaaagctgtgatcgagcagcacatgtcccttaat > 1:601876‑M1/1‑4 (MQ=255) gCAtgtactgcacccattttattggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaaacaaaaatacccttttgaaaagcgccttgaaatcgtgaatcactacttcacaactgatgatggttacaggatcatctcggcacgttttggtgtcccccgaaccaagatcaggaaatgggttgccctctatgaaaaacatggagaaaagggtttaattcccaaacctaaaagcgctagtactgatccagagttgcgtcttaagatcgtgaaagctgtgatcgagcagcacatgtcccttaatc > 2:101779‑M1/1‑3 (MQ=255) gCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCATTTTTCACTGATGCCAGATCGACCAGAATACAATCTTTCGGTAAAGGCGGTAATTTGCCAATAACTTGCTCAGTAACGTGGATTGGCACACTAACAATCACCATTCCGGCATCGGCAACAATATCAGCCGCTCGATCCCAGTCATGTTGCTCCAGAATCCGCACCTGATAACCCGAGAGGGTCAGCATCTTCTCGAACAGGCGTCCCATCTGACCGCCACCGCCGACGATAACCACCGGACGCAGTGACGGACaaa > 2:562540/1‑300 (MQ=255) | CCGACCATCGCCAGCTCAAGGCGGTAAATCGGCGAAGAGAGCGCCAGAAGTTGCTCAAGCTGAACATTTTCTTCTGCCAGGTGCAGCCCGTAAGCAAAAGTAGCAAAGTGGCGCAGTGCCTGAATAAACGCCATATTCTGATCGTGCTCGACGGCGCTAATACGATGCAGCCGAGCGCCCCAGACCTGAATTTGCTCCAGAAACCATTGGTATGCTTCCGGTTTACGTCCATCACACCAGACCACAACTTGCTTTGCCAGGCTACCGCTGTCCGGACCGAACATCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCATTTTTCACTGATGCCAGATCGACCAGAATACAATCTTTCGGTAAAGGCGGTAATTTGCCAATAACTTGCTCAGTAACGTGGATTGGCACACTAACAATCACCATTCCGGCATCGGCAACAATATCAGCCGCTCGATCCCAGTCATGTTGCTCCAGAATCCGCACCTGATAACCCGAGAGGGTCAGCATCTTCTCGAACAGGCGTCCCATCTGACCGCCACCGCCGACGATAACCACCGGACGCAGTGACGGACAAA > NC_000913/2739192‑2739789 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |