Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 1,655,849 | IS2 (–) +5 bp | coding (42‑46/342 nt) | ynfB → | DUF1283 domain‑containing protein YnfB |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 84 (0.830) | 56/594 | 0.5 | 100% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1655853 | 0 (0.000) | coding (46/342 nt) | ynfB | DUF1283 domain‑containing protein YnfB |
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
GTGAAATCCCCGCCGGAAGCAACAGCCAGATACTGGCGTTTCGTTTTAACCACAACCAGGGCAGAAAGCATCCAATAATTTCACACAGCGCAGTAGCAAAAAATAGTAACGTTGTTTTAATCATCTTTGTCTCTTATTGACATCATGTATAGTTATAGGGCGACATAATATCATCAATATAAACACCCTCCTGGTACGTTTTGCGTCCGCAGTGGATGGTGTAGAATCACCTTTAATCATTCATACAGGGAATGAATTATGAAAATCACTCTCAGCAAACGAATCGGCCTGCTCGCTATTCTGCTGCCTTGCGCACTGGCATTGAGCACAACTGTTCATGCCGAAACTAACAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCACGCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCC > NC_000913/1655550‑1656144 | gTGAAATCCCCGCCGGAAGCAACAGCCAGATACTGGCGTTTCGTTTTAACCACAACCAGGGCAGAAAGCATCCAATAATTTCACACAGCGCAGTAGCAAAAAATAGTAACGTTGTTTTAATCATCTTTGTCTCTTATTGACATCATGTATAGTTATAGGGCGACATAATATCATCAATATAAACACCCTCCTGGTACGTTTTGCGTCCGCAGTGGATGGTGTAGAATCACCTTTAATCATTCATACAGGGAATGAATTATGAAAATCACTCTCAGCAAACGAATCGGCCTGCTCGCTAtt > 1:491597/1‑300 (MQ=255) 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ctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTCTGCTGCCtt > 1:107479‑M2/290‑300 (MQ=255) gccgGAAGCAACAGCCAGATACTGGCGTTTCGTTTTAACCACAACCAGGGCAGAAAGCATCCAATAATTTCACACAGCGCAGTAGCAAAAAATAGTAACGTTGTTTTAATCATCTTTGTCTCTTATTGACATCATGTATAGTTATAGGGCGACATAATATCATCAATATAAACACCCTCCTGGTACGTTTTGCGTCCGCAGTGGATGGTGTAGAATCACCTTTAATCATTCATACAGGGAATGAATTATGAAAATCACTCTCAGCAAACGAATCGGCCTGCTCGCTATTCTGCtggattt < 1:438708‑M2/300‑8 (MQ=255) ggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTCTGCTGCCTTGCGCACTGGCAt > 1:513819‑M2/278‑300 (MQ=255) 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tcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgngcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggngccagtctaTCTGCTGCCTTGCGCACTGGCATTGAGCACAACTGTTCatgcaga > 2:741486‑M2/256‑297 (MQ=255) tggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactactattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTCTGCTGCCTTGCGCACTGGCATTGAGCACAACTGTTCATGCCGAAAc > 1:134640‑M2/253‑300 (MQ=255) aaCCACAACCAGGGCAGAAAGCATCCAATAATTTCACACAGCGCAGTAGCAAAAAATAGTAACGTTGTTTTAATCATCTTTGTCTCTTATTGACATCATGTATAGTTATAGGGCGACATAATATCATCAATATAAACACCCTCCTGGTACGTTTTGCGTCCGCAGTGGATGGTGTNGAATCACCTTTAATCATTCATACAGGGAATGAATTATGAAAATCACTCTCAGCAAACGAATCGGCCTGCTCGCTATTCTGCtggatttgcccntatatttccagacatctgttatcacttaacc > 2:591009‑M2/1‑257 (MQ=255) 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atcacttatttaagggatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTCTGCTGCCTTGCGCACTGGCAGTGAGCACAACTGTTCATGCCGAAACTAACAANCTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCACGCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGcc < 2:709667‑M2/249‑1 (MQ=255) tatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTCTGCTGCCTTGCGCACTGGCATTGAGCACAACTGTTCATGCCGAAACTAACAAACTGTTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCACGCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATAc < 1:22418‑M2/255‑1 (MQ=255) tttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTCTGCTGCCTTGCGCACTGGCATTGAGCACAACTGTTCATGCCGAAACTAACAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCACGCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACtt < 1:125803‑M2/257‑1 (MQ=255) aaaTCACTCTCAGCAAACGAATCGGCCTGCTCGCTATTCTGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttc < 1:784341‑M2/300‑259 (MQ=255) gttgtctggagattcagggggccagtctaTCTGCTGCCTTGCGCACTGGCATTGAGCACAACTGTTCATGCCGAAACTAACAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCACGCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGAc > 2:452918‑M2/30‑300 (MQ=255) ttgtctggagattcagggggccagtctaTCTGCTGCCTTGCGCACGGGCATTGAGCACAACTGTTCAGGCCGAAACTAACAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCACGTCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCTAATATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGAcc < 1:101733‑M2/272‑1 (MQ=255) 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GTGAAATCCCCGCCGGAAGCAACAGCCAGATACTGGCGTTTCGTTTTAACCACAACCAGGGCAGAAAGCATCCAATAATTTCACACAGCGCAGTAGCAAAAAATAGTAACGTTGTTTTAATCATCTTTGTCTCTTATTGACATCATGTATAGTTATAGGGCGACATAATATCATCAATATAAACACCCTCCTGGTACGTTTTGCGTCCGCAGTGGATGGTGTAGAATCACCTTTAATCATTCATACAGGGAATGAATTATGAAAATCACTCTCAGCAAACGAATCGGCCTGCTCGCTATTCTGCTGCCTTGCGCACTGGCATTGAGCACAACTGTTCATGCCGAAACTAACAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCACGCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCC > NC_000913/1655550‑1656144 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |