| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,655,849 | IS2 (–) +5 bp | coding (42‑46/342 nt) | ynfB → | DUF1283 domain‑containing protein YnfB |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 71 (0.690) | 53/598 | 0.7 | 98.6% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1655849 = | 1 (0.010) | coding (42/342 nt) | ynfB | DUF1283 domain‑containing protein YnfB | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 84 (0.830) | 56/594 | 0.5 | 100% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1655853 | 0 (0.000) | coding (46/342 nt) | ynfB | DUF1283 domain‑containing protein YnfB | |||||
GTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1651261‑1651548‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCCTGGTTGTGGTTAAAACGAAACGCCAGTATCTGGCTGTTGCTTCCGGC < NC_000913/1655853‑1655561 GTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGA < 1:122349/300‑1 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GCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTA > 2:419532/1‑300 GCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGAAAAAGATGATTAAAACAACGTTA > 1:191041/1‑300 GCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATNCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACNCCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGCTGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTA > 2:643081/1‑300 GCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTT > 1:720478/1‑300 TATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTACTG < 1:492520/300‑1 CGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTACTGCGC < 1:666006/300‑1 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GGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAAT < 1:806205/300‑1 GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTCATGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCC > 2:492333/1‑300 GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCC < 1:203741/300‑1 GGCTTGGAATGGGTGAAGTGATAACAGATGTCTGTAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCATGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAAGAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACTTTACTATTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCC < 1:226424/300‑1 CTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCCTG > 1:295156/1‑300 GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTTTGGAAATATATGGGCAAATACAGCAGAATAGCGAGCATGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGAGTTTCATAATTCATTCCCTGTATAAACGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACACAGATGATGAAAACAACGTTACTATTTTTTGCGACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCCTGGTT < 1:55349/300‑1 GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCCTGGTT < 1:54769/300‑1 GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTNACTATTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCNCTGGTT > 2:667693/1‑300 GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATNGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTNTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCTTGGTTGTGGT > 2:571604/1‑300 GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCCTGGTTGTGGT > 2:635028/1‑300 GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCCTGGTTGTGGT < 1:747385/300‑1 GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTAGTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCCTGGTTGTGGT > 2:763324/1‑300 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ATAGGGGCAAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCCTGGTTGTGGTTAAAACGAAACGCCAGTATCTGGCTGTTG < 1:197423/300‑1 AAATCCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCCTGGTTGTGGTTAAAACGAAACGCCAGTATCTGGCTGTTGCTTCCGGC < 1:438708/300‑1 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NC_000913/1651261‑1651548‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTACTGCGCTGTGTGAAATTATTGGATGCTTTCTGCCCTGGTTGTGGTTAAAACGAAACGCCAGTATCTGGCTGTTGCTTCCGGC < NC_000913/1655853‑1655561 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |