| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 568,449 | IS2 (–) +5 bp | coding (135‑139/333 nt) | emrE → | multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 568449 = | 0 (0.000) | 8 (0.800) | 6/322 | 0.3 | 100% | coding (135/333 nt) | emrE | multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 568453 | 0 (0.000) | 12 (1.210) | 9/320 | 0.1 | 100% | coding (139/333 nt) | emrE | multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
GTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAG > NC_000913/568215‑568680 | gTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTTATGAAGTTTTCAGAATGTTTTATACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccc < 1:151909‑M1/251‑13 (MQ=255) 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(MQ=255) tACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtn < 1:62093‑M1/250‑192 (MQ=255) cacGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatc > 1:165979‑M1/1‑57 (MQ=255) gTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatgtgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtgtctagctataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgcccttatcccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttc < 1:209697‑M1/247‑208 (MQ=255) tACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcacgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgct > 1:98919‑M1/1‑35 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |