New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_000913 = 12874630 (0.000)17 (0.190) 13/586 4.7 100% intergenic (‑135/+75) tyrV/tyrT tRNA‑Tyr/tRNA‑Tyr
?NC_000913 1287574 = 0 (0.000)noncoding (49/85 nt) tyrT tRNA‑Tyr
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.

TGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAGTGTTACGTTGAGAAAAATGAACTGGTTGCGTAATTTTCATCCGTAACGGATTAAAGGTAACCAGTTATTTTTGCTGGCGATTAAAGAATAATCGTTCGATTACCGTAAACAAAGACGCGCTGTGCCAGTACTTTGTATAGTGCACGACTTAAGACGTTTTTCTCGAC  >  NC_000913/1287526‑1287868
                                                |                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
tgtataagagacaggtggtgggggaaggattcgaACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggggtaattcaaattttgaggtaatgcttgagatggtggtgggggaaggattattcgtcgcttcgctcctcacccttcgggccgttgcctgtggcaacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttac                                             >  2:387055‑M2/14‑98 (MQ=255)
        gtgatggTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAAAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCAACAggggtaattcaacttttgaggtagtgcttgagatggtggtgggggaaggattattcgtcgcttcgctcctcacccttcgggccgttgcctgtggcaacgttctctagctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccattttgccgctagggaaccccaccacagggtagtactttttactgacctgc                                     <  2:372599‑M2/297‑211 (MQ=255)
              gtggtggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggggtaattcaaattttgaggtaatgcttgagatggtggtgggggaaggattattcgtcgcttcgctcctcacccttcgggccgttgcctgtggcaacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttacctgtctcttataca                               <  1:391318‑M2/300‑217 (MQ=255)
                ggtggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggggtaattcaaattttgaggtaatgcttgagatggtggtgggggaaggattattcgtcgcttcgctcctcacccttagggccgttgcctgtggcaacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtcatgctttttactggcctgctcccttat                             <  2:404757‑M2/300‑219 (MQ=255)
                 gtggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggggtaattcaaattttgaggtaatgcttgagatggtggtgggggaaggattattcgtcgcttcgctcctcacccttcgggccgttgcctgtggcaacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatc                            <  1:232211‑M2/300‑220 (MQ=255)
                  tggtggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGTCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACTAggggtaattcaaattttgaggtaatgcttgagagggtggtggtggaaggattattcgtcgcttcgctcctcacccttcgggccgttgcctgtggcaacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcg                           >  2:450678‑M2/1‑80 (MQ=255)
                  tggtggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggggtaattcaaattttgaggtaatgcttnagatggtggtgggggaaggattattcgtcgcttcgctcctcacccttcgggccgttgcctgtggcaacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcg                           >  1:498713‑M2/1‑80 (MQ=255)
                  tggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggggtaattcaaattgtgaggtaatgcttgagatggtggtgggggaaggattattcgtcgcttcgctcctcacccttcgggccgttgcctgtggcaacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcg                           >  2:450334‑M2/1‑80 (MQ=255)
                       gAAGGATGCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTTGCCGCTCGGGAACCCCACCAggggtaattcaaattttgaggtaatgcttgagatggtggtgggggaaggattattcgncgcttcgctcctcacccttcgggtcgttgcctgtggcaacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccctttggccactcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaag                      >  2:169566‑M2/1‑75 (MQ=255)
                          ggAGTCGAACCTTCTAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggggtaattcaaatttttaggtaatgcttgagatggtgttgggggaaggattattcgtcgcttcgctcctcaccctncgggccgttgcctgtggcaacgttctntcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctcccttttgccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcgg                   >  2:499293‑M2/1‑72 (MQ=255)
                           gATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggggtaattcaaattttgaggtaatgcttgagatggtggtggggaaaggattattcgtcgcttcgctcctcacccttcgggccgttgcctgtggcaacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacagggtaatgccttttactggcctgctcccttatcgggcagcggg                  <  1:204545‑M2/300‑230 (MQ=255)
                            aTTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggggtaattcaaattttgaggtaatgcttgagatggtggtgggggaaggattattcgtcgcttcgctcctcacccttcgggccgttgcctgtggcaacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcgggg                 <  1:242542‑M2/300‑231 (MQ=255)
                                    cTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggggtaattcaaattttgaggtaatgcttgagatggtggtgggggaaggattattcgtcgcttcgctcctcacccttagggccgttgcctgtggcaacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcat         <  2:620832‑M2/300‑239 (MQ=255)
                                       cGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggggtaattcaaatttttaggtaatgcttgagatggtggtgggggaaggattattcgtcgcttcgctcctcacccttcgggccgttgcctgtggcaacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatc      >  2:713102‑M2/1‑59 (MQ=255)
                                           gTCGATGACTGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggggtaattcaaatttttaggtaatgctttagatggtggtggtggaaggattattcgtcgcttcgctcctcacccttcgggccgttgcctgtggcaacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgatgacggcagatttaaagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaat  >  1:175126‑M2/1‑55 (MQ=255)
                                                |                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
TGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAGTGTTACGTTGAGAAAAATGAACTGGTTGCGTAATTTTCATCCGTAACGGATTAAAGGTAACCAGTTATTTTTGCTGGCGATTAAAGAATAATCGTTCGATTACCGTAAACAAAGACGCGCTGTGCCAGTACTTTGTATAGTGCACGACTTAAGACGTTTTTCTCGAC  >  NC_000913/1287526‑1287868

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.