| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1287463 | 0 (0.000) | 17 (0.190) | 13/586 | 4.7 | 100% | intergenic (‑135/+75) | tyrV/tyrT | tRNA‑Tyr/tRNA‑Tyr |
| ? | NC_000913 | 1287574 = | 0 (0.000) | noncoding (49/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
AAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1287166‑1287463‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agtcgaTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAGTGTTACGTTGA > NC_000913/1287574‑1287712 AAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTTGANAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCGTGGGCAGCTCGGGAAACCCACAAGGGGTAGTGCAAGTTGTGGGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGNGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGATG < 2:685560/300‑1 TCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGATGACGGC > 2:662277/1‑300 ATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGATGACGGCAGAT > 1:115573/1‑300 TTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGNGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGATGACGGCAGATTTAa > 1:528790/1‑299 CCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGATGACGGCAGATTTAAAGTC < 1:667239/300‑1 atatggaatgGCGGATTCT‑TTGGGAAGTGCATGGAATTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGACCCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCATGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTGGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGATGACGGCAGATTTAAAGTCTGCTCCCTTTGGC < 2:367559/290‑1 ATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCCTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGATGACGGCAGATTTAAAGTCTGCTCCCTTTGGCCG > 1:751496/1‑300 G‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAACTTTTGAGGTCATGCTTGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTAGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCATGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGACTCGAACCTTAGTCGATGACGGCAGATTTAAAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA > 1:733002/1‑300 G‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGATGACGGCAGATTTAAAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA > 1:91705/1‑300 G‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCAACAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTATCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTANTCGATGACGGCAGATTTAAAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA > 2:554023/1‑300 TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGCGGTTGGGTAAGGATTCGAACTGGAGAGGTCGACGACGGCAGATTTAAAGTCTGCTCCCTTGGGCCGATCGGGAACCCCATCAGGGGTGATGCAAATTTTGAGGTAATGATGGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAGTCGAACCTTAGTCGATGACGGCAGATTTAAAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAC < 1:412186/300‑1 AAGTTCAGGGCTTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGACAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGTGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCTCTCGAATCGAACCTTAGTCGATGACGGCAGATTTAAAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGT < 2:324204/300‑1 GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAACTTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCATGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGCCGATGACGGCAAATTTAAAGTCTGCTCCCTTTGGCCACTCGGGAACCCCACCACGGGGTAA > 2:450816/1‑300 GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGATGACGGCAGATTTAAAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAA > 1:671706/1‑300 catGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGATGACGGCAGATTTAAAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGC < 1:315007/297‑1 CAGGGACTTTTGAAAGTGATGTTGGTTGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCATCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGATGACGGCAGATTTAAAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGC < 1:311173/300‑1 CCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTCATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTCGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACTCCACCACGGGGTGATGCTTTTTACTAGCCTGCTCCCTTATCCGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATTACGCGCCGCTGTAAAGTGTTACGTTGA > 2:17331/1‑300 AAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1287166‑1287463‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agtcgaTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAGTGTTACGTTGA > NC_000913/1287574‑1287712 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |