| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
TCGTTGTTTTTGGTGTGATTCAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGC‑AAAAAAACGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGTGATGAAAGTGAAACACTTACCCGTAGAAATGACGCTATCTTCGGCAACCACGTATGGC‑AAACATTTGCGCAATACTTCCCGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGACAACGCCATCCGGAGAAGCCGAATGACGTTGTCGGAGTAAGCGCTGGTTAAGGTGTGGGTTGTGCCTCTTTGGTTGAGGGTTGCGTCGTTGCTGACTTAACGGTCGG > NC_000913/1245146‑1245738 | tCGTTGTTTTTGGTGTGATTCAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGC‑AAAAAAACGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAgg < 1:173277/300‑1 (MQ=255) ttttGGTGTGATTCAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGC‑AAAAAAACGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGGTAGCAAt < 1:422484/300‑1 (MQ=255) ttGGTGTGATTCAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGC‑AAAAAAACGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGtggatttgcc < 1:510634‑M1/300‑11 (MQ=255) cAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGTCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTNCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGC‑AAAAAAACGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTtatat < 2:778748/300‑1 (MQ=255) 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ccGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGTGATGAAAGTGAAACACTTACCCGTAGAAATGACGCTATCTTCGGCAACCACGTATGGC‑AAACATTTGCGCAATACTTCCCGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGACAACGCCATCCGGAGAAGCCGAATGACGTTGTCGGAGTAAGCGCTGGTTAAGGTGTGGGTTGTGCCTCTTTGTTTTAGGGTTGCGTCGTTGCTGACt > 2:865036/1‑300 (MQ=255) ccGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGTGATGAAAGTGAAACACTTACCCGTAGAAATGACGCTATCTTCGGCAACCACGTATGGC‑AAACATTTGCGCAATACTTCCCGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGACAACGCCATCCGGAGAAGCCGAATGACGTTGTCGGAGTAAGCGCTGGTTAAGGTGTGGGTTGTGCCTCTTTGGTTGAGGGtctgtctcttatacaca > 1:264510/1‑284 (MQ=255) ccGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGTGATGAAAGTGAAACACTTACCCGTAGAAATGACGCTATCTTCGGCAACCACGTATGGC‑AAACATTTGCGCAATACTTCCCGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGACAACGCCATCCGGAGAAGCCGAATGACGTTGTCGGAGTAAGCGCTGGTTAAGGTGTGGGTTGTGCCTCTTTGGTTGAGGGTTGCGTCGTTGCTGACt > 1:394705/1‑300 (MQ=255) 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TCGTTGTTTTTGGTGTGATTCAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGC‑AAAAAAACGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGTGATGAAAGTGAAACACTTACCCGTAGAAATGACGCTATCTTCGGCAACCACGTATGGC‑AAACATTTGCGCAATACTTCCCGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGACAACGCCATCCGGAGAAGCCGAATGACGTTGTCGGAGTAAGCGCTGGTTAAGGTGTGGGTTGTGCCTCTTTGGTTGAGGGTTGCGTCGTTGCTGACTTAACGGTCGG > NC_000913/1245146‑1245738 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |