New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1245444 | 97 (0.910) | 60 (0.570) | 40/598 | 1.6 | 38.2% | coding (285/441 nt) | ycgY | uncharacterized protein YcgY |
? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
TCGTTGTTTTTGGTGTGATTCAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1245146‑1245444 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAACTGGCGT > NC_000913/1467910‑1468203 TCGTTGTTTTTGGGGTGAGTCAGAAAATAAATATTGTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTTAGGCGGTTTTGGCTGCACTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGT < 2:98352/300‑1 TTGGTGTGATTCAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCC < 1:510634/300‑1 AGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 1:740900/300‑1 GTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACC < 1:32095/300‑1 TAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCC < 1:698363/300‑1 AGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCA > 1:492211/1‑300 AGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGATGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC < 1:44477/300‑1 AGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC < 1:41898/300‑1 CAGGCGGTAAAAATGGGGCGAACAGTGAGGCGGTTTTGGCGGCGCTTATTGAACATTGAGAATTGATCAATCCGGCTGGCAGATGAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG < 2:346382/300‑1 GGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCNTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCC < 1:647927/300‑1 GTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAC‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC > 1:845241/1‑300 GTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC > 1:274586/1‑300 AAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCGCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCACTGC < 2:264615/300‑1 GGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATA > 1:283165/1‑300 CGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGC > 1:731848/1‑300 GGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAANTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTCTATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCG > 2:216515/1‑300 GTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGA > 1:818668/1‑300 TGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAAC < 1:395380/300‑1 gcgGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCC < 2:56525/297‑1 GCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCC < 1:149610/300‑1 GCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGAGCAATCCTTCTAGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCCTCAGTTACGCGAAGAGGAAGGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTATGGATTATGTGAGTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCC < 1:456114/300‑1 GCTGCGCTTATGGAACGTTTAGAATTTATTAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGTCACTGCTTCATTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTGGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCGCTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCAATAACCC < 2:874279/300‑1 CTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGACGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTACCCCATTACAAGCCCGCTGTCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCA > 2:493027/1‑300 TTTAGAATTGATCAATCCTTCTTGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATG < 2:692325/300‑1 TTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATG < 1:852528/300‑1 GATCAATCTTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGATGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGGTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTT < 2:376704/300‑1 GATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCNCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAATTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGCTATTCCCGTGGCGAGTGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTT > 2:793809/1‑300 GATCAATCCCTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGACTTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTGTGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATGTTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCCTTACAAGCACGTTGCCGCAGATATTCCCGTAGCGAGTGATACCCCAACGCATTATGCGGGTGCtactggtt > 2:318273/1‑292 GCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAA < 1:330266/300‑1 GCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTGCAGTTACGCTAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGTTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAA < 2:855012/300‑1 AAAATACCCGTTCTGCAATGCTTCAGTTACGCGGAGAGGAATGGTCTGAATGCTTTTTTTGGTTGCTAGATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGACTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGAGGAGGGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAATCCCGCTGCCGCAGATAGTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGT < 2:417952/300‑1 AAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGATGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGT < 2:409231/300‑1 ATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAAC < 1:38616/300‑1 TGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGTTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCGGCCGTTAACC < 1:378495/300‑1 TGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACC < 1:138545/300‑1 AAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTCTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCA < 1:134883/300‑1 AGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGGGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAAACGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCA < 1:596789/300‑1 TCTGAATTCTTTTTTTGTTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATG < 1:536588/300‑1 TCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGATTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATG < 1:509372/300‑1 TCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTCTTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATG < 2:841561/300‑1 TCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATG < 2:850744/300‑1 TCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATG < 1:3344/300‑1 ATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTC < 2:254185/300‑1 TTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTCTGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCA < 2:768060/300‑1 TTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGC < 2:521590/300‑1 TCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAG > 1:789705/1‑300 TGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTC < 2:680114/300‑1 TGGATTATGTGATTATTAAGTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTC < 2:680108/300‑1 TGGATTATGTGATTATGAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACGCCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTC < 2:280955/300‑1 GGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTANAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCC > 1:653785/1‑300 GGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTANAATGCTCGAACGCCTATGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCC > 1:656104/1‑300 TTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGAC < 1:8907/300‑1 TTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGAC < 2:503941/300‑1 AATTTAACTCCAGAAAGCGAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAGCTGTTAGCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTC < 1:787425/300‑1 ACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACC > 1:366727/1‑300 AGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTAAACACCGTAACAATATTCATTGGATTTGCCCCTATACTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTC < 2:7893/300‑1 AGTGAACACCGTCACAATATTCAGTGGATTTGCCCACATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCCGATATTCCCGTGGCGAGCGATACCCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTACCCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCAAGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTACGGCCTCCGCACCGCCGTGCTCTTCGGTTCAAGTCtaaca > 2:346908/1‑295 AGTGAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCACGTCCCAAC > 2:865251/1‑300 GAACACCGTAACAATATTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATC < 1:115128/300‑1 ATTCAGNGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTANAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAACTGGCGT < 2:730303/300‑1 TCGTTGTTTTTGGTGTGATTCAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAA‑CGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1245146‑1245444 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAACTGGCGT > NC_000913/1467910‑1468203 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |