| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,279,050 | Δ82,373 bp | [ghxP]–[cadC] | 72 genes [ghxP], yjcE, yjcF, actP, yjcH, acs, ytcB, nrfA, nrfB, nrfC, nrfD, nrfE, nrfF, nrfG, gltP, yjcO, fdhF, mdtP, mdtO, mdtN, ytcA, yjcS, alsK, alsE, alsC, alsA, alsB, alsR, rpiB, yjdP, phnP, phnO, phnN, phnM, phnL, phnK, phnJ, phnI, phnH, phnG, phnF, phnD, phnC, yjdN, yjdM, rdcA, rdcB, proP, pmrR, basS, basR, eptA, adiC, adiY, adiA, melR, melA, melB, yjdF, fumB, dcuB, dcuR, dcuS, yjdI, yjdJ, ghoS, ghoT, lysU, dtpC, cadA, cadB, [cadC] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4279050 | 4361422 | 82373 | 40 [0] | [0] 37 | [ghxP]–[cadC] | [ghxP],yjcE,yjcF,actP,yjcH,acs,ytcB,nrfA,nrfB,nrfC,nrfD,nrfE,nrfF,nrfG,gltP,yjcO,fdhF,mdtP,mdtO,mdtN,ytcA,yjcS,alsK,alsE,alsC,alsA,alsB,alsR,rpiB,yjdP,phnP,phnO,phnN,phnM,phnL,phnK,phnJ,phnI,phnH,phnG,phnF,phnD,phnC,yjdN,yjdM,rdcA,rdcB,proP,pmrR,basS,basR,eptA,adiC,adiY,adiA,melR,melA,melB,yjdF,fumB,dcuB,dcuR,dcuS,yjdI,yjdJ,ghoS,ghoT,lysU,dtpC,cadA,cadB,[cadC] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4279049 | 0 (0.000) | 37 (0.670) | 35/490 | 0.2 | 100% | coding (571/1350 nt) | ghxP | guanine/hypoxanthine transporter GhxP |
| ? | NC_000913 | 4361423 = | 0 (0.000) | coding (512/1539 nt) | cadC | DNA‑binding transcriptional activator CadC | |||||
GTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGC‑CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTTCCCGGTGATTATGTCACTGGTAGGTCTGGCGGTGATCATCGGCCTGGAAAAACTGAAAGTCCCTGGTGGCATTCTGCTGACCATTATCGGTATCTCAATTGTCGGTTTGATCTTCGATCCTAACGTCCATTTCTCCGGCGTTTTCGCCATGCCTTCATTGAGCGATGAAAACGGCAATTCACTGATTGGCAGCCTGGACATTATGGGCGCGCTGAATCCTGTAGTCCTGCCAAGCGT > NC_000913/4278797‑4279260 | gTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGC‑CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTc > 1:375945/1‑251 (MQ=255) tACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGC‑CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTc > 2:82111/1‑250 (MQ=255) aCCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGC‑CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCat < 1:166092‑M1/251‑3 (MQ=255) gTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGC‑CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacc < 1:212986‑M1/250‑6 (MQ=255) gTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGC‑CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatac > 1:72787‑M1/1‑245 (MQ=255) gTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGC‑CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTGGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatac < 2:72787‑M1/249‑5 (MQ=255) ccGTGGTCCAGATGGGTGTGTTGTTTGCGTAAATTTCCGCTCA‑GGGTATCCGTAGCTGTATCTTGCGCAATTTGCCTCCCTGTGTGGCGCATGGCACGGGGATTGGGATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCTGTTGAGGTTCTGCCCGGTGCGCTGAGTGATTTCTGGACCTCCACGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTcatacctaacgacaacagg < 2:175244/250‑19 (MQ=255) tGATGCGTGTGCTGTTTACGCTAATTTCTGC‑CAAGGGTATCCGTAGTTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCAAGGCACGGGGATTGGTCTAGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGCTGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGAGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaccc > 2:201382‑M1/1‑223 (MQ=255) aTGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGC‑CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccat > 2:316497‑M1/1‑221 (MQ=255) aCGGTAATTTCTGC‑CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtg > 1:71638‑M1/1‑206 (MQ=255) ggTAATTTCTGC‑CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccataccccaaaggtagtga > 2:122880‑M1/1‑204 (MQ=255) tCTGC‑CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCACCTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTATGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCataactaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaacggcagtgaatcgtttg > 2:397945‑M1/1‑197 (MQ=255) tctgccgagggtatccgtaGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGGTTGGTATCGGTCTGTTCATGCTGCTCATTGCCGCGTACGGTGTCGGGCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGAGGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCAGCCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggataaaaaaccagacccaaaagggagtgaatcgttt < 2:35245‑M1/242‑54 (MQ=255) cGGGTATCCGTAGCTGGATTGTGCGCAACTTGCCTCACGGGGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCTCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGGCTGGCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTG‑TT‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacttcagcgggataaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaa < 1:180046‑M1/251‑62 (MQ=255) gggTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGGCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaac < 1:166202‑M1/251‑63 (MQ=255) aTCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggg > 1:410237‑M1/1‑185 (MQ=255) aGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgt > 1:255715‑M1/1‑179 (MQ=255) cTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTACCGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttc > 2:420358‑M1/1‑177 (MQ=255) ggATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcag < 1:58050‑M1/251‑77 (MQ=255) accttGCCTCTCGGTGTGGCGCACGGCAGCTGGACTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAAAGGTGTCGGTCTGGTGATTCAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacagggaaaaaaaccataaccaaacggtagtgaatctattgcttttaaatggggtatgttcaggtggcgttgcg > 2:245151‑M1/3‑164 (MQ=255) aCTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGAATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggcacaaaaaccatacccacaaggaagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcgg > 2:20109‑M1/1‑163 (MQ=255) cTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggg > 2:121093‑M1/1‑162 (MQ=255) tGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcgg < 1:121093‑M1/248‑89 (MQ=255) gCCTCACTGTGTGGCGCACGTCACGGGGATGGGTATCGGTCTGTTCCTGCGGCTCATTGCCGCGAACGGTGTCGGTCTGGTGAGTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCTGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtgtgcgtttaacttgggattgttcatgtggcgttgcggtgtt < 1:165305‑M1/251‑93 (MQ=255) gtgtGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgt < 1:25299‑M1/251‑101 (MQ=255) gggggcgcgcgtaacgggtgttggtatgggtctggtcctgctTCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCACTTGATGGTCTGCCCGTTTCGCTGGGTGAGTTCGCGACCTTCCCGGTGAT‑‑TGGCACTGGTAGGTCaaacctaacgacaacagtaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgtt < 2:893‑M1/231‑102 (MQ=255) gtgGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgtt > 2:144797‑M1/1‑149 (MQ=255) ggcacggGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgg > 1:134648‑M1/1‑140 (MQ=255) gggATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggaggga < 2:321969‑M1/251‑118 (MQ=255) aTCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggggttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtg < 1:397945‑M1/251‑127 (MQ=255) tCGGTCTGTTCCTGCTGCTCAGTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtg < 2:154945‑M1/250‑127 (MQ=255) tCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaacca < 2:28633‑M1/149‑30 (MQ=255) tCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaacca > 1:28633‑M1/1‑120 (MQ=255) tCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgattgttaagactgtgggagggagaatctgtggccggatccg > 2:28751‑M1/1‑115 (MQ=255) tgctCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaactacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgttatcggttaactggggattgttc < 2:192417‑M1/183‑75 (MQ=255) tgctCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttc > 1:192417‑M1/1‑109 (MQ=255) tCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCAGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGATGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggaagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctgggt > 1:88757‑M1/1‑106 (MQ=255) tGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGA‑‑GTGTCACTGGGAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcggttgcttttcactggggataggtcaggtagcgttgcggtgttttgaatgttaagactgggggagggaggatctgtggcaggaaacgccgctggtatggg > 1:419315‑M1/1‑102 (MQ=255) aaaaaCCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGA‑‑ATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccataccaaaaaggtagtgaatcgtttgctttaaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagtctgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctggtatagggggaggctaagatagcattatttcctct < 1:316497‑M1/251‑178 (MQ=255) gTGATTCCGCCACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACGGGTAGGTCatcccaaacgacaacagaaaaaaaacccatccccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaacgggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggggggaaaatctgtggcaggaaccgcctctggtatagggggaggcgaagatagcattatttcctctccctcttcttcgctgtaccagataaccggcacca < 1:300976‑M1/251‑212 (MQ=255) | GTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGC‑CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTTCCCGGTGATTATGTCACTGGTAGGTCTGGCGGTGATCATCGGCCTGGAAAAACTGAAAGTCCCTGGTGGCATTCTGCTGACCATTATCGGTATCTCAATTGTCGGTTTGATCTTCGATCCTAACGTCCATTTCTCCGGCGTTTTCGCCATGCCTTCATTGAGCGATGAAAACGGCAATTCACTGATTGGCAGCCTGGACATTATGGGCGCGCTGAATCCTGTAGTCCTGCCAAGCGT > NC_000913/4278797‑4279260 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |