| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,279,050 | Δ82,373 bp | [ghxP]–[cadC] | 72 genes [ghxP], yjcE, yjcF, actP, yjcH, acs, ytcB, nrfA, nrfB, nrfC, nrfD, nrfE, nrfF, nrfG, gltP, yjcO, fdhF, mdtP, mdtO, mdtN, ytcA, yjcS, alsK, alsE, alsC, alsA, alsB, alsR, rpiB, yjdP, phnP, phnO, phnN, phnM, phnL, phnK, phnJ, phnI, phnH, phnG, phnF, phnD, phnC, yjdN, yjdM, rdcA, rdcB, proP, pmrR, basS, basR, eptA, adiC, adiY, adiA, melR, melA, melB, yjdF, fumB, dcuB, dcuR, dcuS, yjdI, yjdJ, ghoS, ghoT, lysU, dtpC, cadA, cadB, [cadC] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4279050 | 4361422 | 82373 | 44 [0] | [0] 44 | [ghxP]–[cadC] | [ghxP],yjcE,yjcF,actP,yjcH,acs,ytcB,nrfA,nrfB,nrfC,nrfD,nrfE,nrfF,nrfG,gltP,yjcO,fdhF,mdtP,mdtO,mdtN,ytcA,yjcS,alsK,alsE,alsC,alsA,alsB,alsR,rpiB,yjdP,phnP,phnO,phnN,phnM,phnL,phnK,phnJ,phnI,phnH,phnG,phnF,phnD,phnC,yjdN,yjdM,rdcA,rdcB,proP,pmrR,basS,basR,eptA,adiC,adiY,adiA,melR,melA,melB,yjdF,fumB,dcuB,dcuR,dcuS,yjdI,yjdJ,ghoS,ghoT,lysU,dtpC,cadA,cadB,[cadC] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4279049 | 0 (0.000) | 44 (0.720) | 41/484 | 0.5 | 100% | coding (571/1350 nt) | ghxP | guanine/hypoxanthine transporter GhxP |
| ? | NC_000913 | 4361423 = | 0 (0.000) | coding (512/1539 nt) | cadC | DNA‑binding transcriptional activator CadC | |||||
GCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTTCCCGGTGATTATGTCACTGGTAGGTCTGGCGGTGATCATCGGCCTGGAAAAACTGAAAGTCCCTGGTGGCATTCTGCTGACCATTATCGGTATCTCAATTGTCGGTTTGATCTTCGATCCTAACGTCCATTTCTCCGGCGTTTTCGCCATGCCTTCATTGAGCGATGAAAACGGCAATTCACTGATTGGCAGCCTGGACATTATGGGCGCGCTGAATCCTGTAGTCCTGCCAAGCGTTCTGGCGCTGGTGATGACGGCAGTATTTGATGCC > NC_000913/4278808‑4279294 | gcTGGGTGCCGGGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGGCACTGGTAGGTCatacctaac < 2:285763‑M1/251‑10 (MQ=255) tGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacg > 1:522544‑M1/1‑240 (MQ=255) ggTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgaca < 2:557426‑M1/251‑14 (MQ=255) gCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaac > 2:65255‑M1/1‑235 (MQ=255) ccGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTTCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacag < 1:467347‑M1/251‑18 (MQ=255) ccGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacag < 1:182124‑M1/251‑18 (MQ=255) tACGGTATTTTCGGCCCCGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCCCGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTACCGGTGTCGGTCGGGTGATTAAAACCCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGCCTTCGAGACCTCCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggt < 2:361506‑M1/250‑42 (MQ=255) ggTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCGCGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGGCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtg < 2:232024‑M1/251‑46 (MQ=255) aaTTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaa < 2:299162‑M1/250‑48 (MQ=255) aTTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatc < 1:250720‑M1/251‑50 (MQ=255) gTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGCCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaacggtagtgaatcgtttgcttttaactgggg > 2:562136‑M1/1‑183 (MQ=255) aGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggatt < 1:578621‑M1/251‑71 (MQ=255) gATTTTGCGCAACTTGCCTCACGTTGTGGTGCCCGGCACGGTGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAGCGGTGTCTGTCTGGTGAGTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCGGGGTGGCTTCGCTACCTTCCCGGTGGTTATTTCACTGGTAGGTCataccttacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttca < 2:57532‑M1/251‑76 (MQ=255) aTTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTAatacctaacgccaacaggaaaaacaaccataaccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttc > 1:515783‑M1/1‑175 (MQ=255) cgcAACTTGCCTCACTGTTTGTCGCTCGGCACGGGTAGTGGTATCGGTCTTTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGTTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCTCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaatgtagtgaatcgtttgcgtttaacgggggattgttcatgtggct < 2:515783‑M1/251‑83 (MQ=255) cAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgtt > 1:362772‑M1/1‑167 (MQ=255) aaCTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttg > 1:15178‑M1/1‑166 (MQ=255) aCTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgc < 1:445579‑M1/251‑87 (MQ=255) ccTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgt < 2:522544‑M1/251‑92 (MQ=255) tCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgt < 2:351363‑M1/209‑52 (MQ=255) tCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgt > 1:351363‑M1/1‑158 (MQ=255) cACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgtttt > 2:492764‑M1/1‑157 (MQ=255) aCGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttg > 2:257412‑M1/1‑156 (MQ=255) ggCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgtta < 1:257412‑M1/251‑103 (MQ=255) gcgcACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaa < 1:493546‑M1/251‑104 (MQ=255) ggATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggaggg > 1:542016‑M1/1‑135 (MQ=255) aTTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGGCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGGCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggcggcgttgcggtgttttgaaggttaagactgggggaggg > 2:301897‑M1/1‑133 (MQ=255) aTCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTTCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTTGTAGGTCatacctaacgacaacatgaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtgacgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatct < 1:543489‑M1/250‑124 (MQ=255) cTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggc > 1:539946‑M1/1‑121 (MQ=255) gctgctCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcc < 2:362772‑M1/251‑139 (MQ=255) gctCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcct < 2:542016‑M1/249‑140 (MQ=255) tCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtt > 2:253964‑M1/1‑108 (MQ=255) tCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtt < 1:253964‑M1/160‑53 (MQ=255) tGCCCCTAACGGTGTGGGTTTGGTGATTAAAACCCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatccccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggctttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctggtat < 1:492764‑M1/250‑147 (MQ=255) gTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGTTGGTCTGCCCGTGGCGCGGGGTGACTTCGCGACCTTCCGGGGGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaacccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaacgggggattgttcaggtggcgttgggtttttttgaatgttaagactgtgggggggagaatctgtggcggaaaccgcctctggtatagggggaggcgaagatag < 1:65255‑M1/251‑165 (MQ=255) gATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctggtatagggggaggcgaagatagcattatt > 1:80595‑M1/1‑80 (MQ=255) ttGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACCTCGCAACCTTCCCGGTGTTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacacaagaaaaaaaaaccatcccaaaaaggtagtgaatcgtttgcttttacctggggattgttcaggtggcgttgcggttttttgaatgttaagtctttgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctggtatagggggaggcgaagatagcattatttcctctccctct < 1:65130‑M1/249‑184 (MQ=255) aTGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccggctcttgtattgggggaggggaagatagcattatttactctccctcttcttc > 2:89386‑M1/1‑63 (MQ=255) ggtcgcccctttgcgctgggtgACTTCGCGCCCTTCCGGGTGTTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacagaaaaaaaaaccataccaaaaaggtagtgaatcttttgtttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgtaaagactgtgggagggagaatcggtgcagggaaccgcctctggtatagggggaggcgaagatagcattatttcctctccctcttcttcg < 1:89386‑M1/240‑190 (MQ=255) gcTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctgggatagggggaggcgaagatagcattatttcctctccctcttcttcgctgtaccagataacc > 1:239280‑M1/1‑47 (MQ=255) cTGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctggtatagggggaggcgaagatagcattatttcctctccctcttcttcgctgtaccagataaccg > 1:141729‑M1/1‑46 (MQ=255) tGGGTGACTTCGCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctggtatagggggaggcgaagatagcattatttcctctccctcttcttcgctgtaccagataaccgg > 1:151174‑M1/1‑45 (MQ=255) acttcgCGACCTTCCCGGTGGTTATGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctgggatagggggaggcgaagatagcattattttctttccctcttcttcgctgtaccagataaccggccccat > 2:340054‑M1/3‑39 (MQ=255) aGGTCatacctaacgacaacaggcaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctggtatagggggaggcgaagatagcattatttcctctccctcttcttcgctgtaccagataaccggcaccattaatttatagccgcgctttggtacactagcgat > 2:500518‑M1/1‑5 (MQ=255) | GCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTTCCCGGTGATTATGTCACTGGTAGGTCTGGCGGTGATCATCGGCCTGGAAAAACTGAAAGTCCCTGGTGGCATTCTGCTGACCATTATCGGTATCTCAATTGTCGGTTTGATCTTCGATCCTAACGTCCATTTCTCCGGCGTTTTCGCCATGCCTTCATTGAGCGATGAAAACGGCAATTCACTGATTGGCAGCCTGGACATTATGGGCGCGCTGAATCCTGTAGTCCTGCCAAGCGTTCTGGCGCTGGTGATGACGGCAGTATTTGATGCC > NC_000913/4278808‑4279294 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |