| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,499,401 | Δ12,725 bp | yhfL–[yhfZ] | yhfL, frlA, frlB, frlC, frlD, frlR, yhfS, yhfT, yhfU, php, yhfW, yhfX, yhfY, [yhfZ] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3499401 | 3512125 | 12725 | 72 [0] | [0] 73 | yhfL–[yhfZ] | yhfL,frlA,frlB,frlC,frlD,frlR,yhfS,yhfT,yhfU,php,yhfW,yhfX,yhfY,[yhfZ] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3499400 | 0 (0.000) | 72 (0.740) | 66/492 | 0.2 | 100% | intergenic (+199/‑48) | cysG/yhfL | siroheme synthase/DUF4223 domain‑containing lipoprotein YhfL |
| ? | NC_000913 | 3512126 = | 0 (0.000) | coding (219/906 nt) | yhfZ | putative DNA‑binding transcriptional regulator YhfZ | |||||
GCATAAGCCTTTTTGCGTGAGATAACTTTCCGCCGCTAGTCGCGAAACCACCGCCATGTCATACACGCCATTAAGCAGACACTCCACGCGAATATCCGCGCCACGCATGTGCGCATAGTAAAAAGGAATGCCATCAAACTGGGCTTTCAATCCGCTCGCCAGGCCTTCGTACAAACGGGTATAGGGCAAGGGCATTGCACATACCACGTTGTTGATATCCACATGAGTCAGCAATGCTTTGTTATCCATCTCGACCAGATAACTGCCATTGCGCCCACGGCGTTCAATCCGTATCGCTCCGCTTGATTCCAGCGTTTTCAACGCGGCCTGCGTCAGGCCAACGGATGAACGGCATTCATTTGCCAGCTCATCTATGGTTTTCAATCGATTACCGCACTTTTCACCCAACAAATAACGGGCCAGCGTCGTGATGACGACGCCTTCTTTTTTGATAAACGTTCGACGCATAATAAATTTTCAGTAAATTGAATATTTATATC > NC_000913/3511877‑3512376 | gtcgggttgttggcctgcgcgataaactgaantggttctccaaccattaatttaacccgggccagagaattctggccttcttaatgactctttttatatattcagcaaataaaacatagccccttaataaatattatctgctaatgggttatattcaccgttacagcgacttacaaaattaagtcattcgctcactgacgccaattaaatattcctgtatcgttcttaacgagcagtcttcgtatattcCt < 2:339596‑M2/2‑1 (MQ=255) cgggttgttggcctgcgcgataaactgaactggttctccaaccattaatttaacccgggccagagaattctggccttcttaatgactctttttatatattcagcaaataaaacatagccccttaataaatattatctgctaatgggttatattcaccgttacagcgacttacaaaattaagtcattcgctcactgacgccaattaaatattcctgtatcgttcttaacgagcagtcttcgtatattcCTCg > 1:736415‑M2/248‑251 (MQ=255) gaactggttctccaaccattaatttaacccgggccagagaattctggccttcttaatgactctttttatatattcagcaaataaaacatagccccttaataaatattatctgctaatgggttatattcaccgttacagcgacttacaaaattaagtcattcgctcactgacgccaattaaatattcctgtatcgttcttaacgagcagtcttcgtatattcCTCGACCAGATAACTGCCATTGCGCCCACg < 2:239526‑M2/30‑1 (MQ=255) gaactggttctccaaccattaatttaacccgggccagagaattctggccttcttaatgactctttttatatattcagcaaataaaacatagccccttaataaatattatctgctaatgggttatattcaccgttacagcgacttacaaaattaagtcattcgctcactgacgccaattaaatattcctgtatcgttcttaacgagcagtcttcgtatattcCTCGACCAGATAACTGCCATTGCGCCCACg > 2:252752‑M2/222‑251 (MQ=255) 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ttaatgactctttttatatattcagcaaataaaacatagccccttaataaatattatctgctaatgggttatattcaccgttacagcgacttacaaaattaagtcattcgctcactgacgccaattaaatattcctgtatcgttcttaacgagcagtcttcgtatattcCTCGACCAGATAACTGCCATTGCGCCCACGGCGTTCAATCCGTATCGCTCCGCTTGACTCCAGCGTTTTCAACGCGGCCTGc > 2:120716‑M2/170‑251 (MQ=255) atgactctttttatatattcagcaaataaaacatagccccttaataaatattatctgctaatgggttatattcaccgttacagcgacttacaaaattaagtcattcgctcactgacgccaattaaatattcctgtatcgttcttaacgagcagtcttcgtatattcCTCGACCAGATAACTGCCATTGCGCCCACGGCGTTCAATCCGTATCGCTCCGCTTGACTCCAGCGTTTTCAACGCGGCCTGCGTc > 1:746126‑M2/167‑251 (MQ=255) gactctttttatatattcagcaaataaaacatagccccttaataaatattatctgctaatgggttatattcaccgttacagcgacttacaaaattaagtcattcgctcactgacgccaattaaatattcctgtatcgttcttaacgagcagtcttcgtatattcCTCGACCAGATAACTGCCATTGCGCCCACGGCGTTCAATCCGTATCGCTCCGCTTGACTCCAGCGTTTTCAACGCGGCCTGCGTc > 2:497197‑M2/165‑249 (MQ=255) 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2:89904‑M2/212‑1 (MQ=255) tcctgtatcgttcttaacgagcagtcttcgtatattcCTCGACCAGATAACTGCCATTGCGCCCACGGCGTTCAATCCGTATCGCTCCGCTTGACTCCAGCGTTTTCAACGCGGCCTGCGTCAGGCCAACGGATGAACGGCATTCATTTGCCAGCTCATCTATGGTTTTCAATCGATTACCGCACTTTTCACCCAACAAATAACGGGCCAGCGTCGTGATGACGACGCCTTCTTTTTTGATAAACGTTCg > 2:94900‑M2/38‑250 (MQ=255) cctgtatcgttcttaacgagcagtcttcgtatattcCTCGACCAGATAACTGCCATTGCGCCCACGGCGTTCAATCCGTATCGCTCCGCTTGACTCCAGCGTTTTCAACGCGGCCTGCGTCAGGCCAACGGATGAACGGCATTCATTTGCCAGCTCATCTATGGTTTTCAATCGATTACCGCACTTTTCACCCAACAAATAACGGGCCAGCGTCGTGATGACGACGCCTTCTTTTTTGATAAACGTTCGAc < 1:252752‑M2/215‑1 (MQ=255) cgttcttaacgagcagtcttcgtatattcCTCGACCAGATAACTGCCATTGCGCCCACGGCGTTCAATCCGTATCGCTCCGCTTGACTCCAGCGTTTTCAACGCGGCCTGCGTCAGGCCAACGGATGAACGGCATTCATTTGCCAGCTCATCTATGGTTTTCAATCGATTACCGCACTTTTCACCCAACAAATAACGGGCCAGCGTCGTGATGACGACGCCTTCTTTTTTGATAAACGTTCGACGCataat > 2:764790‑M2/30‑251 (MQ=255) 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GCATAAGCCTTTTTGCGTGAGATAACTTTCCGCCGCTAGTCGCGAAACCACCGCCATGTCATACACGCCATTAAGCAGACACTCCACGCGAATATCCGCGCCACGCATGTGCGCATAGTAAAAAGGAATGCCATCAAACTGGGCTTTCAATCCGCTCGCCAGGCCTTCGTACAAACGGGTATAGGGCAAGGGCATTGCACATACCACGTTGTTGATATCCACATGAGTCAGCAATGCTTTGTTATCCATCTCGACCAGATAACTGCCATTGCGCCCACGGCGTTCAATCCGTATCGCTCCGCTTGATTCCAGCGTTTTCAACGCGGCCTGCGTCAGGCCAACGGATGAACGGCATTCATTTGCCAGCTCATCTATGGTTTTCAATCGATTACCGCACTTTTCACCCAACAAATAACGGGCCAGCGTCGTGATGACGACGCCTTCTTTTTTGATAAACGTTCGACGCATAATAAATTTTCAGTAAATTGAATATTTATATC > NC_000913/3511877‑3512376 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |