| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,498,768 | 9486 bp→CCC | [pyrS]–fryB | [pyrS], pyrR, ypdC, fryA, ypdE, ypdF, fryC, fryB | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2498768 | 2508253 | 9486 | 65 [0] | [0] 64 | [pyrS]–fryB | [pyrS],pyrR,ypdC,fryA,ypdE,ypdF,fryC,fryB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2498767 | 0 (0.000) | 64 (0.660) +CCC |
57/486 | 0.3 | 100% | coding (97/1698 nt) | pyrS | sensor histidine kinase PyrS |
| ? | NC_000913 | 2508254 = | 0 (0.000) | intergenic (‑12/+207) | fryB/glk | putative PTS enzyme IIB component FryB/glucokinase | |||||
GTGATTCGAAACGTTCGTTATCTTCCGGGGTAACTGCCACGGAGTGGATGATGATGGTCGCTTCGGCGATATCCTGCGCCGTCAGGCGATTCTGGATACCGTCCGCGCCCTGGGTTTCAATTTTCACTTCATAACCGGCTTCTACCGCCGCTTCTTCCAGCGCCTGAGCGGCCATAAAGGTGTGAGCCAGGCCCATCGGGCAGGCACATAAGGCAATCAGTTTCTTACTCATCGTTAATTCCTCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGT > NC_000913/2508011‑2508494 | gcattatcaagagatgcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaccggcctgctggtcatcagccttcaggttccctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAg < 2:558132‑M2/7‑1 (MQ=255) gagatgcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggtttcctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgccggttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGAc < 1:448122‑M2/18‑1 (MQ=255) gagatgcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGAc < 2:200201‑M2/18‑1 (MQ=255) atgcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCCGTGATAGTTGACg > 1:300594‑M2/231‑249 (MQ=255) gcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTg > 1:212942‑M2/229‑251 (MQ=255) cattgttaataccccatttatctaccaacccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcccccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGa < 2:300594‑M2/24‑1 (MQ=255) aataccccatttatctatcaatccccttttaaaattggggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgccggttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTa < 2:10605‑M2/29‑1 (MQ=255) aatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTAt < 1:501042‑M2/30‑1 (MQ=255) tacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaattcttatcttcctgttctttctcatccggatccgcctttttcgcccccCGGTCAGTGTTAGTTGCCGAGTGGAATtatta > 2:196374‑M2/219‑248 (MQ=255) catttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGc < 1:180399‑M2/38‑1 (MQ=255) tctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAAc > 1:685495‑M2/208‑250 (MQ=255) atcatcccccttttaaaagtgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcagcagctttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcaagaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAAt < 2:520006‑M2/47‑1 (MQ=255) caatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttctcgcccCGTTCAGTGATAGTTGCCGGGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAAtcc > 2:15518‑M2/203‑250 (MQ=255) 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cttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagagttaatgcttatttgcctgttctttctcatccgtacccgcctgtttcgcgcccCGTTCCGTGATagttgatgagggtaattatgaaccgggcatttctccgtgggaatg > 2:429113‑M2/196‑229 (MQ=255) aaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGa < 1:92278‑M2/60‑1 (MQ=255) gtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGGTAGTTGACGAGGGAAATTATGAACGTGCCAAACAAATCGCCGTTACCAGACAaata > 1:91535‑M2/185‑250 (MQ=255) aacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGGAATTATGAACGGGCAAAACAAATCGCCGGTACCAGACAAATAATGCATTTACTGgaga > 2:410400‑M2/169‑250 (MQ=255) acggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAAt > 2:223348‑M2/168‑251 (MQ=255) cggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggccgcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTTCTGGAGAAtt > 2:614867‑M2/167‑251 (MQ=255) gctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATc < 1:714139‑M2/89‑1 (MQ=255) gtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcggtcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttttttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCCGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGGGCAAAACAAAACGCCGTTACCAGACAAAAAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTg > 1:636722‑M2/157‑251 (MQ=255) cagctttcagggtacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcaagaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgaccgggcagcgttaatgcttacctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACgg < 2:225457‑M2/100‑1 (MQ=255) ccttagggttccctaacataaaggtttaatcnttattcagagtcccccggccacgaaatattcaccatgcggcgggcggtcttcaatcgggcagcgttaatgcttaccggcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAg < 2:367475‑M2/103‑1 (MQ=255) gttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctggtctttctcatccgtatccccctgtttcgcgcccAGTTCAGTTATAGTTGAAGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAACCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCACGATGTACGGAAGTGTGACg > 2:480767‑M2/142‑251 (MQ=255) atcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTaa > 1:346114‑M2/135‑221 (MQ=255) atcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgcgggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCg < 1:15518‑M2/117‑1 (MQ=255) ancatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTaa < 2:346114‑M2/87‑1 (MQ=255) atagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcgtcggtcgggccgcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttagcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGAGCAAAAAAAATCGCCGTTACCAGACAAAAAATGCAATTAATGGAGAAGTAATCCCGCTGAACGGGAGGGGgacgcagggagacc > 2:455637‑M2/132‑245 (MQ=255) 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atccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGa < 1:756793‑M2/131‑1 (MQ=255) atccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgtgaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGa < 1:39904‑M2/131‑1 (MQ=255) atccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatactgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGAATTTACTGGAGCATTAATCCCGCGGTACGGCAGTGTGACGCAGGTAGAACTTGTGAgggg > 2:138609‑M2/121‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |