| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 167,401 | Δ5,915 bp | fhuA–[fhuB] | fhuA, fhuC, fhuD, [fhuB] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 167401 | 173315 | 5915 | 68 [0] | [0] 69 | fhuA–[fhuB] | fhuA,fhuC,fhuD,[fhuB] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 167400 | 0 (0.000) | 68 (0.690) | 66/492 | 0.2 | 100% | intergenic (+136/‑84) | mrcB/fhuA | peptidoglycan glycosyltransferase/peptidoglycan DD‑transpeptidase MrcB/ferrichrome outer membrane transporter/phage receptor |
| ? | NC_000913 | 173316 = | 0 (0.000) | coding (1855/1983 nt) | fhuB | iron(III) hydroxamate ABC transporter membrane subunit | |||||
CGATTACCCCGCTGTGCCGCCGCTGGCTGACCATTTTACCGCTGGGTGGTGATACCGCCCGAGCCGTAGGAATGGCGCTGACGCCGACGCGAATTGCGCTGCTGCTGTTAGCGGCTTGCCTGACGGCGACCGCGACGATGACTATTGGACCGTTGAGTTTTGTTGGTTTAATGGCACCGCATATTGCGCGGATGATGGGCTTTCGACGGACGATGCCACACATCGTAATTTCGGCGCTGGTGGGTGGTTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGCCCCGAATCGTAGGTCG > NC_000913/173068‑173562 | tgatcagtcttctcagccgcagcaacagccgcaacagcaacctgctcagcaagagcagaaagacagcgacggtgtagccggttggatcaaggatatgtttggtagtaattaacatctaagcgtgaaataccggatggcgagttgccatccggtaaaataacatcccatctaagatattaaccctttcttttcatctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcgaacctt < 1:302265‑M2/2‑1 (MQ=255) 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tcatctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcgaaccTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCg > 1:576538‑M2/59‑251 (MQ=255) catctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcgaaccTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGa < 1:452651‑M2/194‑1 (MQ=255) atctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcgaaccTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGGTAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGAt > 1:98859‑M2/57‑251 (MQ=255) ttattaacccttcaggaacgcacagattgcgtaccgcttgctaaccTTACTTCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCGGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACTCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTg < 2:694779‑M2/204‑1 (MQ=255) attaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcgaaccTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGgc < 1:386086‑M2/206‑1 (MQ=255) taacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcgaaccTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATACCCGATGCGACGCTGGcgcg > 1:690408‑M2/43‑251 (MQ=255) gctcagattgcgtaccgcttgcgaaccTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTCTTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGGTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGGCttatcggggctcc > 2:78925‑M2/28‑246 (MQ=255) agattgcgtaccgcttgcgaaccTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAAc > 1:485048‑M2/24‑251 (MQ=255) ttgcgtaccgcttgcgaaccTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTTTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGCCAACGGATGCCCGATGCGACCCTGGCGCGTCTTATCGGGCCACCAAACGGc > 1:10560‑M2/21‑251 (MQ=255) ttgcgtaccgcttgcgaaccTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACaaaccgc > 1:475690‑M2/21‑248 (MQ=255) gcgtaccgcttgcgaaccTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAATGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGccc < 1:433049‑M2/233‑1 (MQ=255) gcttgcgaaccttACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGGTGCTGGCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGCGCCGGTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTTCGCCTGGAAGGGTAAAACGTTTACGCGACCAATGATGCCCCCTGCGACGCCGGCGCGCCTTTTCGGGCCTCAAAAAGGCCCCCAATcc > 2:200446/12‑250 (MQ=255) cgaaccTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATTTTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTCCGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGGTGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTTAAAACGGCCCCCAATCGTaggg > 2:757365‑M2/7‑250 (MQ=255) aaccTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCCAATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGGTGGCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAACGGGCCCACAAAAGGCCCCGAATCGTAGGTCg > 1:97261‑M2/5‑251 (MQ=255) | CGATTACCCCGCTGTGCCGCCGCTGGCTGACCATTTTACCGCTGGGTGGTGATACCGCCCGAGCCGTAGGAATGGCGCTGACGCCGACGCGAATTGCGCTGCTGCTGTTAGCGGCTTGCCTGACGGCGACCGCGACGATGACTATTGGACCGTTGAGTTTTGTTGGTTTAATGGCACCGCATATTGCGCGGATGATGGGCTTTCGACGGACGATGCCACACATCGTAATTTCGGCGCTGGTGGGTGGTTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGCCCCGAATCGTAGGTCG > NC_000913/173068‑173562 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |