Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_000913 | 167,401 | Δ5,915 bp | fhuA–[fhuB] | fhuA, fhuC, fhuD, [fhuB] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_000913 | 167401 | 173315 | 5915 | 68 [0] | [0] 69 | fhuA–[fhuB] | fhuA,fhuC,fhuD,[fhuB] |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 167400 | 0 (0.000) | 68 (0.690) | 66/492 | 0.2 | 100% | intergenic (+136/‑84) | mrcB/fhuA | peptidoglycan glycosyltransferase/peptidoglycan DD‑transpeptidase MrcB/ferrichrome outer membrane transporter/phage receptor |
? | NC_000913 | 173316 = | 0 (0.000) | coding (1855/1983 nt) | fhuB | iron(III) hydroxamate ABC transporter membrane subunit |
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cGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctg > 1:549906‑M1/1‑179 (MQ=255) ggTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgt < 1:257987‑M1/251‑74 (MQ=255) gtAGCCGGTTGGAGCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggctgggctgctgtca < 2:735058‑M1/250‑76 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |