| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,410,081 | 13624 bp→ATGC | yjfI–[ulaF] | 18 genes yjfI, yjfJ, yjfK, yjfL, yjfM, yjfC, aidB, yjfN, bsmA, yjfP, ulaR, ulaG, ulaA, ulaB, ulaC, ulaD, ulaE, [ulaF] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4410081 | 4423704 | 13624 | 68 [0] | [0] 69 | yjfI–[ulaF] | yjfI,yjfJ,yjfK,yjfL,yjfM,yjfC,aidB,yjfN,bsmA,yjfP,ulaR,ulaG,ulaA,ulaB,ulaC,ulaD,ulaE,[ulaF] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4410080 | 0 (0.000) | 68 (0.950) +ATGC |
65/484 | 0.0 | 100% | intergenic (+74/‑53) | rlmB/yjfI | 23S rRNA 2'‑O‑ribose G2251 methyltransferase/DUF2170 domain‑containing protein YjfI |
| ? | NC_000913 | 4423705 = | 0 (0.000) | coding (6/687 nt) | ulaF | L‑ribulose‑5‑phosphate 4‑epimerase UlaF | |||||
ATCGGGCATATCGTCGCGGTACATGTGAAAGACACCAAACCTGGCGTCTTCAAAAACGTGCCGTTTGGCGAAGGTGTAGTGGATTTCGAACGTTGTTTCGAAACGCTCAAACAGAGTGGCTATTGCGGGCCGTACCTGATTGAGATGTGGAGCGAAACGGCGGAAGACCCGGCGGCAGAAGTGGCGAAAGCGCGTGATTGGGTGAAAGCGCGCATGGCGAAAGCGGGCATGGTGGAGGCGGCATAATGCAAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATATGAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAACTCTACCGTCGT > NC_000913/4423455‑4423951 | gaccggacgcctggcgctggtgatgggtgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgca < 2:322049‑M2/1‑1 (MQ=255) accggacgcctagcgctggtgatgggtgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgaggagttgatccgcagcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaattttcttatgtgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagagttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcaa < 2:440140‑M2/2‑1 (MQ=255) cgcctggcgctggtgatgggtgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTaa < 1:4468‑M2/8‑1 (MQ=255) cctggcgctggtgatgggtgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTaaaa < 2:422973‑M2/10‑1 (MQ=255) 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ATCGGGCATATCGTCGCGGTACATGTGAAAGACACCAAACCTGGCGTCTTCAAAAACGTGCCGTTTGGCGAAGGTGTAGTGGATTTCGAACGTTGTTTCGAAACGCTCAAACAGAGTGGCTATTGCGGGCCGTACCTGATTGAGATGTGGAGCGAAACGGCGGAAGACCCGGCGGCAGAAGTGGCGAAAGCGCGTGATTGGGTGAAAGCGCGCATGGCGAAAGCGGGCATGGTGGAGGCGGCATAATGCAAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATATGAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAACTCTACCGTCGT > NC_000913/4423455‑4423951 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |