Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 4,410,081 | 13624 bp→ATGC | yjfI–[ulaF] | 18 genes yjfI, yjfJ, yjfK, yjfL, yjfM, yjfC, aidB, yjfN, bsmA, yjfP, ulaR, ulaG, ulaA, ulaB, ulaC, ulaD, ulaE, [ulaF] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 4410081 | 4423704 | 13624 | 68 [0] | [0] 69 | yjfI–[ulaF] | yjfI,yjfJ,yjfK,yjfL,yjfM,yjfC,aidB,yjfN,bsmA,yjfP,ulaR,ulaG,ulaA,ulaB,ulaC,ulaD,ulaE,[ulaF] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4410080 | 0 (0.000) | 68 (0.950) +ATGC |
65/484 | 0.0 | 100% | intergenic (+74/‑53) | rlmB/yjfI | 23S rRNA 2'‑O‑ribose G2251 methyltransferase/DUF2170 domain‑containing protein YjfI |
? | NC_000913 | 4423705 = | 0 (0.000) | coding (6/687 nt) | ulaF | L‑ribulose‑5‑phosphate 4‑epimerase UlaF |
GACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAACAAAATATTGATGTAACAAATAGCGAGAACGCATTAATTATTAAAATGAATGATTATGGCGATTTGCAAATCAATATTCTTTTTACTTCCCGCCAAATGATTATCGAAACCTTTATTTGTCCGGTGAGTAGTATCAGCAATC > NC_000913/4409835‑4410325 | gACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgca < 2:322049‑M1/251‑6 (MQ=255) aCCGGACGCCTAGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGAGGAGTTGATCCGCAGCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTTCTTATGTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGAGTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaa < 2:440140‑M1/251‑7 (MQ=255) cGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaa < 1:4468‑M1/251‑13 (MQ=255) ccTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaa < 2:422973‑M1/251‑15 (MQ=255) tGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGAGGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaac > 2:306078‑M1/1‑235 (MQ=255) gcgcTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcagagctaaaacagc < 1:370371‑M1/251‑19 (MQ=255) gATGGGGGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCTTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGGTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatt < 1:482987‑M1/250‑26 (MQ=255) ggAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaac > 1:374658‑M1/1‑216 (MQ=255) gaaggtATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtagttgaagccaacatggagc < 2:159913‑M1/251‑43 (MQ=255) aggtATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCACGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCCGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggaatttgaagccaacatggagctg > 1:462603‑M1/1‑207 (MQ=255) ggtATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgc < 2:304830‑M1/251‑46 (MQ=255) gTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTTTCCAGCATCCCGAGGGCTGGAAGCGTTTCTTCCATGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGATTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCACAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGCActgcaaagctaaaacagcagggatttgaagccaacatggagctgctgcgct > 2:10636‑M1/1‑199 (MQ=255) cGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacg > 2:342187‑M1/1‑197 (MQ=255) cGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtga < 1:1063‑M1/251‑64 (MQ=255) cATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgaccttta < 1:375811‑M1/251‑70 (MQ=255) aTTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTTCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTCatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggggacctttac > 2:463603‑M1/1‑181 (MQ=255) tGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacc < 1:74716‑M1/250‑72 (MQ=255) cGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctgg < 1:463603‑M1/251‑75 (MQ=255) aGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggca > 1:422306‑M1/1‑172 (MQ=255) ttGATCAGCATCCCGATGGCTGGCAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacg > 1:107513‑M1/1‑170 (MQ=255) cccGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatc < 1:385531‑M1/251‑93 (MQ=255) cGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacctggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcg > 1:396757‑M1/1‑157 (MQ=255) aTGGCTGGAAGCTTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGAACGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTGTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgaccttttcctggggcaacgtcagcgctatcgacc < 2:496795‑M1/251‑97 (MQ=255) ggCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgc > 2:573724‑M1/1‑153 (MQ=255) gAAGCGGTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCTACCGGAATTTGCTTATTGGAAGCGGTGCGCCAGGGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTCCGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttgcctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacg < 2:3132‑M1/251‑104 (MQ=255) gCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTGatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgaccttttcctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgatcgcgg < 2:470981‑M1/251‑107 (MQ=255) tcttcCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctgg > 1:197066‑M1/1‑140 (MQ=255) tcCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggt < 2:2733‑M1/249‑113 (MQ=255) tcCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctgg < 1:360874‑M1/248‑112 (MQ=255) tcCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTATCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTACGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggccggtgaccttaccctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctgttgg > 2:456889‑M1/1‑137 (MQ=255) aCGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatca > 1:269051‑M1/1‑130 (MQ=255) cGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctat < 1:484743‑M1/215‑92 (MQ=255) cGGTTGCGACCGGAATTTACTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctat > 2:484743‑M1/1‑124 (MQ=255) ggTTGCGAACGGAATTTGCCTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTTTCAGAATTATGAAAAGCCATCCCGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagc < 1:342187‑M1/251‑129 (MQ=255) gCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcg > 1:398916‑M1/1‑119 (MQ=255) gACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgtt > 1:422272‑M1/1‑117 (MQ=255) gACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCCCAGAATTAGGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgtt < 2:102074‑M1/251‑135 (MQ=255) aCCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgngggctgggggggatcaagcccagcggcgttg > 2:267417‑M1/1‑116 (MQ=255) cGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggaatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcggcgctatcaaccgcgaacgcgggctgggggtgatcaagcccagcggcgttgcc > 2:126222‑M1/1‑114 (MQ=255) ggAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcct < 1:302164‑M1/251‑139 (MQ=255) gAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgccta < 1:557087‑M1/251‑140 (MQ=255) gCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGCATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgcacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaac > 1:200111‑M1/1‑106 (MQ=255) aaGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagc > 1:91091‑M1/1‑97 (MQ=255) aGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcg > 1:178553‑M1/1‑96 (MQ=255) gCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcgg < 1:526353‑M1/251‑157 (MQ=255) cgcCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGANAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgata < 2:265002‑M1/251‑163 (MQ=255) gcCAGCGCAGTTAATTTCTCAGAATGATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtattggaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatat < 2:246401‑M1/251‑164 (MQ=255) cgcAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatctggtgg > 2:448521‑M1/1‑83 (MQ=255) gcAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggt < 1:263612‑M1/251‑170 (MQ=255) aTTTCACAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTGGGATGGTTTTGTTTTGTCTATAGCTTGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtattttaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgaccgttacctggggctacgtcagcgctatcgtccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgat < 2:337335‑M1/251‑177 (MQ=255) cAGAATTATGAAAAGCCATCCATATTTGGATGGTTTTTTGTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatg < 2:195337‑M1/248‑180 (MQ=255) aTGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaagg < 1:271758‑M1/251‑190 (MQ=255) aaaaGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtgg < 2:425421‑M1/251‑193 (MQ=255) aaGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtg < 1:519127‑M1/251‑195 (MQ=255) aGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctgcgggtggacaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgacagcggccgatatggggggggttgctatgggcggcacggaggtgg > 2:580632‑M1/1‑56 (MQ=255) aGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATGACGGAaggcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtgg < 2:11887‑M1/251‑196 (MQ=255) aGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcggacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaacgcggccgctatggtggtggntggtatgaacggcaaggggggggaagggg > 2:282796‑M1/1‑48 (MQ=255) ttGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGGTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaccagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtat < 2:37830‑M1/250‑207 (MQ=255) tGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGCACGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctgggccaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcaggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgcaaccatgaaagcggccgatatgtcggggggtgatatgagcagcaaggcggagggagtggaggatcc > 2:311832‑M1/1‑43 (MQ=255) gTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatc > 1:93316‑M1/1‑37 (MQ=255) ttGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatcttccgac > 2:199732‑M1/1‑29 (MQ=255) gtatataggcgggaagaaaagtacgtaatgaaaagttaaaacaggaggtatttgaaggcaacatggagctgccgcgcttcgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatggagcgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcgtggttgcctacgaaaccatgaaagcggccggtatggtggtggttgatatgagcgtcaaggtggtggaaggggagtaccgcccatcttccggcact < 2:489455‑M1/230‑225 (MQ=255) cTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccctcttccgacactgc > 2:156109‑M1/1‑25 (MQ=255) taGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagataaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatcttccgacactgcga > 1:459408‑M1/1‑22 (MQ=255) aTTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatcttccgacactgcgacgcatctcgaactct > 1:161714‑M1/1‑8 (MQ=255) aTTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgacgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggaggaaggggagtatcgcccatcttccggcactgcgacgcatctcgaactcc > 2:168988‑M1/1‑8 (MQ=255) tACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgatcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatcttccgacactgcgacgcatctcgaaatctac > 1:450939‑M1/1‑6 (MQ=255) tACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtgggggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatcttccgacactgcgacgcatctcgaactctac > 1:163250‑M1/1‑6 (MQ=255) | GACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAACAAAATATTGATGTAACAAATAGCGAGAACGCATTAATTATTAAAATGAATGATTATGGCGATTTGCAAATCAATATTCTTTTTACTTCCCGCCAAATGATTATCGAAACCTTTATTTGTCCGGTGAGTAGTATCAGCAATC > NC_000913/4409835‑4410325 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |