| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 167,401 | Δ5,915 bp | fhuA–[fhuB] | fhuA, fhuC, fhuD, [fhuB] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 167401 | 173315 | 5915 | 72 [0] | [0] 73 | fhuA–[fhuB] | fhuA,fhuC,fhuD,[fhuB] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 167400 | 0 (0.000) | 72 (0.990) | 67/492 | 0.0 | 100% | intergenic (+136/‑84) | mrcB/fhuA | peptidoglycan glycosyltransferase/peptidoglycan DD‑transpeptidase MrcB/ferrichrome outer membrane transporter/phage receptor |
| ? | NC_000913 | 173316 = | 0 (0.000) | coding (1855/1983 nt) | fhuB | iron(III) hydroxamate ABC transporter membrane subunit | |||||
GATCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCAATGGCGCGTTCCAAAACTGCTCAGCCAAAACACTCACTGCGTAAAATCGCAGTTGTAGTAGCCACAGCGGTTAGCGGCATGTCTGTTTATGCACAGGCAGCGGTTGAACCGAAAGAAGACACTATCACCGTTACCGCTGCACCTGCGCCGCAAGAAAGCGCATGG > NC_000913/167154‑167648 | gATCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTACCCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAANGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttac > 2:254014‑M1/1‑247 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cAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattcc < 2:370249‑M1/251‑53 (MQ=255) gAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccg > 1:133395‑M1/1‑191 (MQ=255) gAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccg < 1:41742‑M1/251‑61 (MQ=255) 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gACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGCTATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGAAGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCACATCTAAGACATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTATATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggctggtgctgtttcaattccagataccggcggcgctgc > 1:356465‑M1/1‑181 (MQ=255) aGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtcaacc < 1:528387‑M1/251‑79 (MQ=255) ccGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtcaacctt < 1:91282‑M1/251‑81 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |