| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | NC_000913 | 167,401 | Δ5,915 bp | fhuA–[fhuB] | fhuA, fhuC, fhuD, [fhuB] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 167401 | 173315 | 5915 | 72 [0] | [0] 73 | fhuA–[fhuB] | fhuA,fhuC,fhuD,[fhuB] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 167400 | 0 (0.000) | 72 (0.990) | 67/492 | 0.0 | 100% | intergenic (+136/‑84) | mrcB/fhuA | peptidoglycan glycosyltransferase/peptidoglycan DD‑transpeptidase MrcB/ferrichrome outer membrane transporter/phage receptor |
| ? | NC_000913 | 173316 = | 0 (0.000) | coding (1855/1983 nt) | fhuB | iron(III) hydroxamate ABC transporter membrane subunit | |||||
GATCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/167154‑167400‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGCCCCGAATCGTAGGTCGG > NC_000913/173316‑173563 aATCAGTCTCCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCCTCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTAC < 2:73043/250‑1GATCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTACCCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAANGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTAC > 2:254014/1‑251GATCAGACTTCTCAGCCGCAGCACCAGCCGCAAAAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGCTGGCTCACGGATATGATTGGTAGTAATTAACATCTACGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGAAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGATGTTTATTACCCCTTCAGGAACGCTACGATTGCGTACCGCTAGCGAACCTTAC > 2:189988/1‑251 ATCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTATCGCTTGCGAACCTTcct > 1:201886/1‑248 TCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGT < 1:58102/249‑1 tCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGAACAGCAAGAGCAGAAAGACAACGACGGAGTAGCCGGTTGGATCCAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCGAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTACTGGTGTTggttgac > 2:352074/2‑244 GCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGG > 1:240799/1‑251 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GCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTT < 1:265500/250‑1 CTCAGCAAGAGCAGAAAGGCAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCC > 2:478129/1‑251 CAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACAGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACACTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCAT > 1:39183/1‑251 CAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCC < 2:370249/251‑1 GAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCG > 1:133395/1‑251 GAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCG < 1:41742/251‑1 AAAGACAGCGACGGAGTAGCCGGTTGGATCACGGATATGTTTGGTAGTACTTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGCTATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGG > 2:366072/1‑251 AGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTTTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGGGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCG > 1:215112/1‑251 AGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGCAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTAAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCTCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGC > 2:171677/1‑251 GACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGCTATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGAAGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCACATCTAAGACATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTATATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGCTGGTGCTGTTTCAATTCCAGATACCGGCGGCGCTGC > 1:356465/1‑251 AGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACC < 1:528387/251‑1 CCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTT < 1:91282/251‑1 cgggTGGATCAAGGATATGTTTGGGAGTAATTAACATCTAAGCGTGGAATCCCGGATGGCGAGTTGCCAGCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAGCCCTTTCTTTTCATCTTGTTGCTTATTAACCCTCCAGGAACGCTCAGATTGGGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGTATCGTGCTGTTTCCTTTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCgtg < 2:20131/247‑4 TGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGTTGTGGGCGGTTGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGAGCGGCTGTCAGCCTTTATtt > 2:383739/1‑249 AAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACCTCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCNGCGGGGCTGCCGGCAACCTTTATCGGCTCGC > 2:287875/1‑251 AGGATATGGTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATCCCGTATGGCGAGTTGCAATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCGTTTCATCTGGTTGTTTATTTACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTCCCGCGTGCGAACCTTACTGCGGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCC < 2:21680/251‑1 ATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATAT < 1:530020/250‑1 GGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATC < 1:539238/250‑1 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ATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCCTATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGAAGAGCCGTTAATTTTTCC > 1:562651/1‑251 ATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCC > 1:3746/1‑251 CGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACAGCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATAT < 1:248126/251‑1 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CATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAA > 1:397983/1‑250 ATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTTCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCGGCTGTCAAACTTTATCGGCGCGCCATATTTTTTCTCTTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTCATTTTTCCATATAACAGCCCTGTACGCCTGGACGGGTAAAGCGTTTAC > 2:392495/1‑251 TCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATA > 1:246673/1‑204 TCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAAGTTTTCCATATA < 2:246673/204‑1 TTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGAT < 1:242790/248‑1 TCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTAAACCTTTATCGGCGCGCCATCTTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCCTATAACGGACCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGATCACGGATGCCCG > 1:423585/1‑251 CATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCG < 2:138082/250‑1 tGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCTTACCGCTTGCGAACCTTACCGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTCCGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGC < 2:517897/248‑1 GGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGC < 1:403856/249‑1 GGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAAAGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCGTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGAT < 1:256583/247‑1 GTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGTTGTGGGCGGATGGTGCTGTGTCCATTCCAGTTCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGAC < 2:312505/251‑1 TATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTTTTGAGAAAGCAGAACCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGAGACAACGGATGCCCGATGCGACGCCGGC > 1:560955/1‑251 ATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTACGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTTTCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTAAGACTGGACGGCTAAAGCGTTTACGCGACCACCGATGCCCGATGCGACGCTGGCG > 1:444702/1‑251 ACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGGTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGAAGCTGGCGCGgc > 1:555279/1‑249 CAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATC < 1:287875/250‑1 AGGATCGCGCAGATTGAGTTCCGCTTGCGAACCTTCCTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGG < 2:17694/251‑1 GCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTAC > 1:414916/1‑251 CTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGCCGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTAC > 1:101137/1‑250 TGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGGCTTTTCGGGCCTACAAACGGCC > 2:463616/1‑251 CGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGGGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGTTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTGTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGCCCC < 2:182717/251‑1 TACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCCGCGCGCCATATTTTATCTATTTTTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGCCCCG > 1:339102/1‑250 gGCGATCCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGGGGGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGTCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAATCGGCCCCGAATCGT < 2:53302/248‑1 TGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGCCCCGAATCGTA < 1:266340/250‑1 GAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCTGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGTGTCTTTTCGGGCCTACAAACGGCCCCGCATCGTAGGgc > 1:400593/1‑249 AACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTTTTTGTTGAGAAAACAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGCCCCGAATCCTAGGTCG > 1:216370/1‑251 ACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGCCCCGAATCGTAGGTCGG < 1:503059/251‑1 GATCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/167154‑167400‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGCCCCGAATCGTAGGTCGG > NC_000913/173316‑173563 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |