Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 3,411,645 | 9722 bp→A | yhdJ–[yhdY] | yhdJ, yhdU, envR, acrE, acrF, yhdV, yhdX, [yhdY] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 3411645 | 3421366 | 9722 | 60 [0] | [0] 62 | yhdJ–[yhdY] | yhdJ,yhdU,envR,acrE,acrF,yhdV,yhdX,[yhdY] |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3411644 | 0 (0.000) | 60 (0.830) +A |
55/490 | 0.1 | 100% | intergenic (+77/‑9) | fis/yhdJ | DNA‑binding transcriptional dual regulator Fis/DNA adenine methyltransferase |
? | NC_000913 | 3421367 = | 0 (0.000) | coding (43/1104 nt) | yhdY | putative ABC transporter membrane subunit YhdY |
GATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3411406‑3411644 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CATAACTCAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCTTTACCCACACGACCAACGCT > NC_000913/3421367‑3421616 | GATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTta > 1:447168/1‑247 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ACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGANATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAA < 2:253188/250‑1 CTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAA > 1:223975/1‑250 GCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCT > 1:457637/1‑251 ACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACTTAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCT < 2:452098/251‑1 GCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGA < 1:494585/251‑1 CCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGTGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAAGTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTGGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTGTTTTATAGGTTTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCA < 2:194303/251‑1 GTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAAT < 1:249536/250‑1 CATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAA‑TCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCT > 1:13896/1‑251 cCCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGANGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCAT < 2:293789/250‑1 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CAGACCCGTGCTGCGCTTATGATGGGCATCANCCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCGTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTGTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCATCTGGAGCAATAGCCTGCTGTCTATTGGCTGCATATGGTTGATGTG < 2:273380/251‑1 CAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTG > 1:510157/1‑251 GACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAAGACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGG < 1:104395/251‑1 gtgaTGCGATGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGTTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCGGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATTGAGAAGCGCCTTTTGTATAGGTGTCACAAAGGACATACCTGAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTG < 2:336064/247‑1 GCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAA‑TCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATC < 2:13896/251‑1 GCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATTTGGGAACTGATC < 2:218573/249‑1 GATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAAGTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTGTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTG < 2:25417/250‑1 GGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTG < 1:569216/250‑1 CATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGCTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGGGTGGGTGCGAAACAATCTGTTCTCCAGCTGGGGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGGTGTGGGTACTGTACCCACAGTTGCTTAACT > 2:3722/1‑251 ATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTG < 1:151237/251‑1 GTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTT < 2:223975/251‑1 AAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGCGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTG > 1:245753/1‑251 AAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTG < 2:368642/196‑1 AAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTG > 1:368642/1‑196 ATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTG < 1:425810/251‑1 AAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTC > 1:483373/1‑250 ATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAACAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAACGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATACCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGC > 1:208810/1‑251 ATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGC > 1:130621/1‑251 CGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTAGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAAATGGGTTGGCTCAACGCGTG > 1:69960/1‑251 ATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGCCTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTACCTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCG > 2:62597/1‑250 TAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGCCTGCAC > 1:390949/1‑251 gCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGTCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAA < 1:494288/249‑1 AGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGC > 1:517356/1‑251 GTTAGCTACATGCTTGATTAAACAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGAGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGATGATGTGGGAACTGATCCCACCTTTGCTGAACTAGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCG > 2:449809/1‑251 AGCTAAATGCTTGATTAATAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTG > 2:481877/1‑251 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AAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCT < 2:447168/250‑1 AAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCC < 1:563321/249‑1 GCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGG > 1:226916/1‑251 TTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCCTGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACACAGGACATAACTTAAGCAGCGCGATGGAGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGAATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTAGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGACGGTGCCTGTTGGGg > 1:459908/1‑250 GATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGC > 1:291496/1‑136 GATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGC < 2:291496/136‑1 AAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCC > 1:372283/1‑251 AAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCC > 2:353529/1‑251 GCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAAC > 1:417123/1‑251 GGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGG > 1:417905/1‑251 GCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGT > 1:312890/1‑251 CCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATG < 1:212518/251‑1 TTTATAGGTGTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCT < 1:94385/250‑1 GTCACAACGGACATAAATTAAGCCGCGCGCTGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTATCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGTTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGGGCCGACTGCACAAAAGACGGTGCCTGTTGGGGCTTCATCCACGTACGATNTGGTCAGATTAATAATGGGCTTTACCAACAC > 2:271814/1‑251 GTCACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCTAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTACCTTGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCTTTACCCtca < 1:51892/250‑4 CACAAAGGACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTATCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGGGGGAACTGAACCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCATGCTAAATGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACGGCACAAAAGCCGATGCCTGGTGGGTCTTCATCCACGAACTATTTGGTCAGGTTATGTAGGGGCTTTACCCcaacgc > 2:548116/1‑245 ACATAACTTACGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAGCTGATCCCCCCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCTTTACCCACACGACCAACGCT < 1:4547/251‑1 ACATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCTTTACCCACACGACCAACGCT > 1:12047/1‑251 | GATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3411406‑3411644 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CATAACTCAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCTTTACCCACACGACCAACGCT > NC_000913/3421367‑3421616 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |