| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,101,395 | Δ11,672 bp | wbbL–rfbB | wbbL, insH7, wbbL, wbbK, wbbJ, wbbI, wbbH, glf, rfbX, rfbC, rfbA, rfbD, rfbB | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2101395 | 2113066 | 11672 | 61 [0] | [0] 60 | wbbL–rfbB | wbbL,insH7,wbbL,wbbK,wbbJ,wbbI,wbbH,glf,rfbX,rfbC,rfbA,rfbD,rfbB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2101394 | 0 (0.000) | 60 (0.830) | 56/488 | 0.1 | 100% | intergenic (‑126/+2) | gnd/wbbL | 6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating/interrupted rhamnosyltransferase WbbL |
| ? | NC_000913 | 2113067 = | 0 (0.000) | intergenic (‑6/+367) | rfbB/galF | dTDP‑glucose 4,6‑dehydratase 1/UTP:glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase, low activity | |||||
TCTTCCGTCTTCTCACGGGAACGGTTGAAAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2101147‑2101394‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCATGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAACCCTACTGCTAACTCG > NC_000913/2113067‑2113312 TCTTCCGTCTTCTCACGGGAACGGTTGAAAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTT < 1:218142/250‑1 CCGTCTTCTCACGGGAACGGTTGAAAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCC > 1:527521/1‑251 TCTTCTCACGGGAACGGTTGAAAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCAT > 1:206933/1‑250 GAACGGTTGAAAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAG > 2:98205/1‑249 GTTGAAAATAGAGACGGTATAACCATGGTTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCTATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTCCTGCAGAGCATGC < 2:7218/251‑1 TGAAAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCT < 1:282191/250‑1 AAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCCCTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATCCTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTG > 1:287092/1‑250 GAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCCTAACGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGAGATCACCGCGCTGCATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTCTTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATA > 1:552564/1‑250 ACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCG > 1:257800/1‑251 TTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGT > 1:526829/1‑251 TGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATG < 2:339321/212‑1 TGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATG > 1:339321/1‑212 CACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGCATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTG > 2:576887/1‑251 GCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTT < 1:128324/251‑1 GCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCT < 1:181567/250‑1 ATACCGACTACGCCGCTCAGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGACTGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGAACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTCTTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTAC > 2:477325/1‑251 ACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACACAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTAC > 2:387484/1‑251 CTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTCCGGCTTTATTTATTCCATATTACTTC < 1:65891/168‑1 CTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTC > 2:65891/1‑168 GCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAG > 1:165604/1‑249 ATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACT > 1:352325/1‑251 GTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCgt < 1:406095/251‑3 GTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCAC < 1:98205/246‑1 TGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGC > 1:413954/1‑251 ggatATTACATACTCCTGGCAGGTGTGATCACCGCGCTGAAGGCTCTCTGCCGTGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAATTACTTATTAAATAATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATAAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCCCTGCGTGCATGCC < 2:441637/247‑1 ACATTCTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAAGGCTCGTGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTTCTTCAGAGCATGCTGGGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGTTTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCACCTGGCTTTACAGCTTCCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGAT < 1:301593/250‑1 CAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTT < 1:293136/250‑1 ATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCT > 1:496033/1‑132 ATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCT < 2:496033/132‑1 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TGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAA > 1:313243/1‑250 GCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAATTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAA < 2:150336/250‑1 gGGAATGGTCGCAAATAAGTATAAAAAGTACGTATTAAAGTATAAAAAACTTATCCATGCTTATCTGTTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTGCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTGACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCGCTAGCGCTAAACTTGAAAAATTCAAACG < 2:61626/249‑1 GGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCT > 1:364613/1‑251 GAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTA < 1:121516/251‑1 GAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGAATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGCATAATTCAAACGCT > 2:58288/1‑250 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AAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGATCTGGAAACAAGGAAAATCCTGG > 1:110654/1‑251 agAGCTTAGCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGAACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGAGCATGCCTCTGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATGGTCTTACCACTCCGCACTGGAACCAAGGAAAATCATGGA > 2:87304/3‑250 TATCCATGCTTATATGTTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTT < 2:78669/250‑1 ATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGCCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTG > 1:536021/1‑251 GCTTATATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAA > 2:71761/1‑250 TATATGCTTACGGTTTTTTTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAAGCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAA < 2:352325/249‑1 ATGCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAACCCT > 1:6304/1‑250 GCTTACGGCTTTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAATCCCTAC < 2:179114/250‑1 TACGGTTTTATTTATTCCATATTACTGCAGNGCATGCTGTTAAATAGGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAAGGCCCGCTACCGCCCCTGTCTTTACAGTTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAACCCTACTGC < 2:275209/250‑1 TTATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAACCCTACTGCTAACTCG < 1:71761/250‑1 TCTTCCGTCTTCTCACGGGAACGGTTGAAAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2101147‑2101394‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCATGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAACCCTACTGCTAACTCG > NC_000913/2113067‑2113312 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |