| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 167,401 | Δ5,915 bp | fhuA–[fhuB] | fhuA, fhuC, fhuD, [fhuB] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 167401 | 173315 | 5915 | 60 [0] | [0] 60 | fhuA–[fhuB] | fhuA,fhuC,fhuD,[fhuB] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 167400 | 0 (0.000) | 60 (0.920) | 52/490 | 0.1 | 100% | intergenic (+136/‑84) | mrcB/fhuA | peptidoglycan glycosyltransferase/peptidoglycan DD‑transpeptidase MrcB/ferrichrome outer membrane transporter/phage receptor |
| ? | NC_000913 | 173316 = | 0 (0.000) | coding (1855/1983 nt) | fhuB | iron(III) hydroxamate ABC transporter membrane subunit | |||||
TTGATCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCAATGGCGCGTTCCAAAACTGCTCAGCCAAAACACTCACTGCGTAAAATCGCAGTTGTAGTAGCCACAGCGGTTAGCGGCATGTCTGTTTATGCACAGGCAGCGGTTGAACCGAAAGAAGACACTATCACCGTTACCGCTGCACCTGCGCCGCAAGAAAGCGCATG > NC_000913/167152‑167647 | ttGATCAGTCTTCCCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCt < 2:394478‑M1/250‑2 (MQ=255) ttctCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtg > 1:185435‑M1/1‑239 (MQ=255) tctcAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgt > 2:492557‑M1/1‑238 (MQ=255) gCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgct < 1:521070‑M1/251‑19 (MQ=255) 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aCCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtcaacctttatcggcgcgccatattttctctatttgttgggaaagcagagccgttaatttttccatataacggccctgtacgcctggacggataaagcgtttacgcggcaacggatgcccgatgcgacgctggcgcggc > 1:216602‑M1/1‑40 (MQ=255) cccTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtcaacctttatcggcgcgccatattttatctattttttgagaaagcagagccgttaatttttccatataacggccctgtacgcctggacggataaagcgtttacgcgacaacggatgaccgatgcgacgctggcgcgtct > 2:414095‑M1/1‑39 (MQ=255) cccTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtcaacctttatcggcgcgccatattttatctatttgttgagaaaacagagccggtaatttttccatataacggccctgtaagcctggacggatcaagcgtttacgcgacaacggatacccgaggcgacgcaggcgcgtct > 1:273643‑M1/1‑39 (MQ=255) tCAGATTGGGTACCGATTGCGAACCttactgctggggttcgctgattggtgtgggcggatggtgctgtttccattcaagatcccggcggggatgctgtcaacctttatcggcgagccatattttatctatttgttgagaaagcagagccgtttatttttacatataaaggccctgtacgcctggaaggataaagcgtttaagcgaaaacggatgcccgatgcgacgcaggagcgtgttattgggcctaaa > 2:180641‑M1/1‑25 (MQ=255) cAGATTGCGTACCGCTTGAGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtccacctttatcggcgcgccatattttttctatttgtttagaaagcatcgccgttaatttttccatctaacgggcctgtaagcctggccgggtaaagcgtttacccgaccacggatgcccgattcgacgctggcgcgtcctttcgggccgccca > 2:442186‑M1/1‑24 (MQ=255) gTACCTCTTGCGAATCgtactgcgggtgttcgctgactggggtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtcaacctttatcggcgcgccatattttatctatttgttgagaaagcagagccgttaatttttccatataacggccctgtacgcctggacggataaagcgtttacgcgacaacggatgcccgatgcgacgctggcgcgtcttatcgggcttacaaacggccccg < 2:349709‑M1/251‑236 (MQ=255) gCGAACCtttctgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtcaacctttatcggcgcgccatattttatctatttgttgagaaagcagagccgttaatttttccatataacggccctgtacgcctggacggataaagcgtttacgcgacaacggatgcccgatgcgacgctggcgcgtcttatcgggcctacaaacggccccgaatcgtag < 1:70508‑M1/250‑244 (MQ=255) gacccttcctgcgggtgtgcgctggctggtgggggcggatggtgcggtttccattccagatcccggcggggctgcggtcaacctttatcggcgcgccatattttatctatttgttgagaaagcagagccgttaatttttccatataacggccctgtacgcctggacggataaagcgtttacgcgacaacggatgcccgatgcgacgctggcgcgtcttatcgggcctacaaacggccccgaatcgtaggtc < 2:216602‑M1/248‑247 (MQ=255) atccttactgcgggtgttctctgtttggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtcatcctttatcggcgcgccatattttatctatttgttgagaaagcatagccgttaatttttccatataacggccctgtacgcctggacggataaagcgtttacgcgacaacggatgcccgatgcgacgctggcgcgtcttatcgggcctacaaacggccccgaatcgtaggtcg < 1:524877‑M1/249‑248 (MQ=255) | TTGATCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCAATGGCGCGTTCCAAAACTGCTCAGCCAAAACACTCACTGCGTAAAATCGCAGTTGTAGTAGCCACAGCGGTTAGCGGCATGTCTGTTTATGCACAGGCAGCGGTTGAACCGAAAGAAGACACTATCACCGTTACCGCTGCACCTGCGCCGCAAGAAAGCGCATG > NC_000913/167152‑167647 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |