Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_000913 | 167,401 | Δ5,915 bp | fhuA–[fhuB] | fhuA, fhuC, fhuD, [fhuB] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_000913 | 167401 | 173315 | 5915 | 60 [0] | [0] 60 | fhuA–[fhuB] | fhuA,fhuC,fhuD,[fhuB] |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 167400 | 0 (0.000) | 60 (0.920) | 52/490 | 0.1 | 100% | intergenic (+136/‑84) | mrcB/fhuA | peptidoglycan glycosyltransferase/peptidoglycan DD‑transpeptidase MrcB/ferrichrome outer membrane transporter/phage receptor |
? | NC_000913 | 173316 = | 0 (0.000) | coding (1855/1983 nt) | fhuB | iron(III) hydroxamate ABC transporter membrane subunit |
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gttgGGTAGTAATTAACATCCAATCGTGAANTGCCGGATGGCGGGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTTTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCTCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTGCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCTGCGCGCCATATTT < 2:239141/246‑1 TTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCGTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTA < 1:49002/250‑1 ATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTC < 1:295352/215‑1 ATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTC > 2:295352/1‑215 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ATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCC < 1:140017/251‑1 ATCCGGTAAAATAACATCCCATCAAATATATNAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTATCCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTTCGAACCTTACTGCTTGTGTTCGCTGACTGGTGTTGGCGGATGGTTCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGTCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTGTTTGTTGATAAAGCAGAGCCGTTAATTGTTCCATATAACGGCCCT < 2:250500/251‑1 GTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGCTGTTTATAAACCCTTAAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACATTTCTCCGCGCGCCCTATTTTATCTCTTTTATGAGGAAACAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGGCCCGTACG > 2:482301/1‑251 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ACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTCTCTATTTGTTGGGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGGCAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGgc > 1:216602/1‑249 CCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTTTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGACCGATGCGACGCTGGCGCGTCT > 2:414095/1‑251 CCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAACAGAGCCGGTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTAAGCCTGGACGGATCAAGCGTTTACGCGACAACGGATACCCGAGGCGACGCAGGCGCGTCT > 1:273643/1‑251 TCAGATTGGGTACCGATTGCGAACCTTACTGCTGGGGTTCGCTGATTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCAAGATCCCGGCGGGGATGCTGTCAACCTTTATCGGCGAGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTTATTTTTACATATAAAGGCCCTGTACGCCTGGAAGGATAAAGCGTTTAAGCGAAAACGGATGCCCGATGCGACGCAGGAGCGTGTTATTGGGCCTAaa > 2:180641/1‑248 CAGATTGCGTACCGCTTGAGAACCTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCCACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTTTCTATTTGTTTAGAAAGCATCGCCGTTAATTTTTCCATCTAACGGGCCTGTAAGCCTGGCCGGGTAAAGCGTTTACCCGACCACGGATGCCCGATTCGACGCTGGCGCGTCCTTTCGGGCCgccca > 2:442186/1‑245 GTACCTCTTGCGAATCGTACTGCGGGTGTTCGCTGACTGGGGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCTTACAAACGGCCCCG < 2:349709/251‑1 GCGAACCTTTCTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGCCCCGAATCGTAG < 1:70508/250‑1 gacCCTTCCTGCGGGTGTGCGCTGGCTGGTGGGGGCGGATGGTGCGGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCGGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGCCCCGAATCGTAGGTC < 2:216602/248‑1 atCCTTACTGCGGGTGTTCTCTGTTTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCATCCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCATAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGCCCCGAATCGTAGGTCG < 1:524877/249‑1 TTGATCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/167152‑167400 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAAACGGCCCCGAATCGTAGGTCG > NC_000913/173316‑173562 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |