| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,465,392 | Δ16,810 bp | [ydbA]–[ynbD] | [ydbA], insD2, insC2, ydbA, insI2, ydbA, pdxI, ydbD, ynbA, ynbB, ynbC, [ynbD] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1465392 | 1482201 | 16810 | 26 [0] | [0] 26 | [ydbA]–[ynbD] | [ydbA],insD2,insC2,ydbA,insI2,ydbA,pdxI,ydbD,ynbA,ynbB,ynbC,[ynbD] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1465391 | 0 (0.000) | 26 (0.400) | 25/478 | 0.9 | 100% | intergenic (‑161/‑1) | ynbG/ydbA | uncharacterized protein YnbG/putative outer membrane protein, N‑terminal fragment |
| ? | NC_000913 | 1482202 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/+53) | ynbD/azoR | phosphatase domain‑containing protein YnbD/FMN dependent NADH:quinone oxidoreductase | |||||
TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGGAAAGTATGTTTGATTAGATAATAATCTACTGGCAATATTGGATGTCTTCTATGTTTTAAATAACTAATTGGTCGGGTTAGTGCATCCGGCTTTCTTTATATTCGCCAGAAGGATTTATTATGCAAAGGAAAACTCTATTGTCGGCCTGTATTGCATTAGCTCTGAGTGGTCAGGGTTGGGCGGCAGATATCACAGAGGTAGAAACCACCACAGGTGAAAAGAAAAATACCAATGTGACTTGTCCGGCAGACCCAGGAAAACTCAGTCCGGAAGAGCTTAAACGCTTACCCTCTGAATGCTCTCCTTTAGTCGAACAAAACCTGATGCCATGGCTTTCCACAGGCGCTGCTGCGTTAATCAC > NC_000913/1465149‑1465633 | ttttttCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGGAAAGTATGTTTGATTAGATAATAATCTACTGGCAATATTGGATGTCTTCTATGTTTTAAATAACTAATTGGTCGGGTTAGTGCATCCGGCTTTCTTTATATTCGCCAGAAGGATTTATTgtggattg > 1:91005‑M1/1‑243 (MQ=255) 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2:477707‑M1/1‑41 (MQ=255) atTCGCCAGAAGGATTTATTgtggattgagatgtggaatgaatatctaaagtccacatcaagaccgtgtccggttatgcagaaacaatgctgtcgatggctgcttttgcgtcagactgtgctttcgctgccatttccggaccgtatgcgatcccttcggcgaagacaaatttcacatcggtaatgccgataaagccgaggcacttggacagatacggcgtcaccagggccgttggtccaactttgtcgctc > 2:459818‑M1/1‑20 (MQ=255) gCCAGAAGGATTTCTTgtggattgagatgtggactgaatctatacagtccacatcaagaacgtgtccgggtatgcagaaacaatgctgtcgatggctgcttttgcgtcagactgtgctttcgctgccatttccggaacgtctgcgatcccttcggcgaagacacatttcacatcggtaatgccgataacgccgaggaacgtggacagatacggagcgaccaggtccgttggtgcctctttgtggatcccgc > 2:488664‑M1/1‑16 (MQ=255) gCCAGAAGGATTTATTgtggattgagatgtggactgaatatctacagtccacatcaagaccgtgtccggttatgcagaaacaatgctgtcgatggctgcttttgcgtcagactgtgctttcgctgccatttccggaccgtatgcgatcccttcggcgaagacaaatttcacatcggtaatgccgataaagccgaggaacgtggacagatacggcgtcaccaggtccgttggtccatctttgtggatcccgc > 2:39202‑M1/1‑16 (MQ=255) 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TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGGAAAGTATGTTTGATTAGATAATAATCTACTGGCAATATTGGATGTCTTCTATGTTTTAAATAACTAATTGGTCGGGTTAGTGCATCCGGCTTTCTTTATATTCGCCAGAAGGATTTATTATGCAAAGGAAAACTCTATTGTCGGCCTGTATTGCATTAGCTCTGAGTGGTCAGGGTTGGGCGGCAGATATCACAGAGGTAGAAACCACCACAGGTGAAAAGAAAAATACCAATGTGACTTGTCCGGCAGACCCAGGAAAACTCAGTCCGGAAGAGCTTAAACGCTTACCCTCTGAATGCTCTCCTTTAGTCGAACAAAACCTGATGCCATGGCTTTCCACAGGCGCTGCTGCGTTAATCAC > NC_000913/1465149‑1465633 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |