| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,701,865 | Δ5,842 bp | [dppF]–dppA | [dppF], dppD, dppC, dppB, dppA | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3701865 | 3707706 | 5842 | 45 [0] | [2] 47 | [dppF]–dppA | [dppF],dppD,dppC,dppB,dppA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3701864 | 0 (0.000) | 45 (0.690) | 42/476 | 0.2 | 100% | coding (1005/1005 nt) | dppF | dipeptide ABC transporter ATP binding subunit DppF |
| ? | NC_000913 | 3707707 = | 0 (0.000) | intergenic (‑2/+909) | dppA/proK | dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein/tRNA‑Pro | |||||
TCCCACTTTTCAGCGAGGCCCGGGATCACTTCGGTGGTGCCGATTTTAAATTCAACCAGACGGTTATAAAGCGGGACGGAAGAGGCGTCATAGGTGGTGCCGGAGGTAAACAGCTGCGGGTTAAACCCTTCCGGAGATCCTTCTGAGCAATAAACCAGAGTTTTAGCCTGAACACTTGCTGCGACGGTCATAGCCACCAGGCTGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAA > NC_000913/3707458‑3707951 | atcgtcattacgttgacgatttgggtttcgtttcgtgtatcggtgctggtgttctttcagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggcgcgcatggccccggttttgtgagtAt > 2:115242‑M2/250‑251 (MQ=255) gacgatttgggtttcgtttcgtgtatcggtgctggtgttctttcagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAAttgg > 1:114104‑M2/236‑250 (MQ=255) gatttgggtttcgtttcgcgtatcggtgctggggttctttcagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccacggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGCGAt > 2:414747‑M2/233‑251 (MQ=255) atttgggtttcgtttcgtgtatcggtgctggtgttctttcagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTCTGAtg < 1:142723‑M2/20‑1 (MQ=255) ttcgtttcgtgtatcggtgctggtgttctttcagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgttcctcattccgtttttcctgttctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgttagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTttgttg < 1:36191‑M2/27‑1 (MQ=255) cgtttcgtgtatcggtgctggtgttctttcagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacacctggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgantATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGttt > 2:230112‑M2/222‑251 (MQ=255) gtttcgtgtatcggtgctggtgttctttcagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGtttt < 1:258080‑M2/31‑1 (MQ=255) tttcgtgtatcggtgctggtgttctttcagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGtttt > 1:301193‑M2/220‑250 (MQ=255) atcggtgctggtgttctttcagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCttt < 1:314244‑M2/39‑1 (MQ=255) ggtgctggtgttctttcagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCANTTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGc > 2:223419‑M2/209‑249 (MQ=255) gtgctggtgttctttcagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccagttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGt < 2:177975‑M2/44‑1 (MQ=255) gttctttcagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTc < 1:18148‑M2/52‑1 (MQ=255) ttcagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGc < 2:282448‑M2/54‑1 (MQ=255) cagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCt > 2:55320‑M2/193‑251 (MQ=255) cagttgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCt > 1:354902‑M2/193‑251 (MQ=255) tgggaagcccgttatatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgatgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGAcc > 1:308777‑M2/189‑251 (MQ=255) atatggtattgtgtcgtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCttttttgtttttt < 2:465054‑M2/76‑1 (MQ=255) gtgcctcattccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCaa < 1:166011‑M2/91‑1 (MQ=255) ccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAgg > 1:210941‑M2/151‑251 (MQ=255) ccgtttttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAgg < 1:95210‑M2/101‑1 (MQ=255) tatttcctgatctataaagacgcacaactggaaacacttcgcggatttcaagcatggctgattctgatgtacggaattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTACAATTGAGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCATTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCgggtcaacgttgtgcggcgg > 2:356039‑M2/148‑242 (MQ=255) tttcctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTgggg > 2:12275‑M2/146‑251 (MQ=255) cctgatctataaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATg < 1:191399‑M2/109‑1 (MQ=255) aaagtcgcacaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAAt > 2:1439‑M2/133‑251 (MQ=255) acaactggaaaaacttcgcggatttaaagcctggctgattctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATc > 2:260144‑M2/125‑250 (MQ=255) 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ctgctgtacggcattttgctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTgg > 2:294802‑M2/85‑130 (MQ=255) gctatgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAg < 1:467112‑M2/184‑1 (MQ=255) atgcttgtcgccactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGa < 1:1439‑M2/185‑1 (MQ=255) cactgttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTc < 1:86962‑M2/198‑1 (MQ=255) gttgaagctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgttagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAAt < 1:130810‑M2/201‑1 (MQ=255) agctgattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgcgtATTCTGCTCCAATTGCGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGcc > 1:267716‑M2/45‑251 (MQ=255) gattgagtaaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAAcc < 1:223419‑M2/211‑1 (MQ=255) aaaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGc < 1:188727‑M2/78‑1 (MQ=255) aaccggagcgcatggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTac > 2:155547‑M2/32‑251 (MQ=255) ggccccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTgaga < 2:472197‑M2/233‑1 (MQ=255) ccggttttgtgagtATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATcc > 1:143278‑M2/15‑251 (MQ=255) 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TCCCACTTTTCAGCGAGGCCCGGGATCACTTCGGTGGTGCCGATTTTAAATTCAACCAGACGGTTATAAAGCGGGACGGAAGAGGCGTCATAGGTGGTGCCGGAGGTAAACAGCTGCGGGTTAAACCCTTCCGGAGATCCTTCTGAGCAATAAACCAGAGTTTTAGCCTGAACACTTGCTGCGACGGTCATAGCCACCAGGCTGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAA > NC_000913/3707458‑3707951 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |