| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,701,865 | Δ5,842 bp | [dppF]–dppA | [dppF], dppD, dppC, dppB, dppA | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3701865 | 3707706 | 5842 | 45 [0] | [2] 47 | [dppF]–dppA | [dppF],dppD,dppC,dppB,dppA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3701864 | 0 (0.000) | 45 (0.690) | 42/476 | 0.2 | 100% | coding (1005/1005 nt) | dppF | dipeptide ABC transporter ATP binding subunit DppF |
| ? | NC_000913 | 3707707 = | 0 (0.000) | intergenic (‑2/+909) | dppA/proK | dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein/tRNA‑Pro | |||||
ATCGTCATTACGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTTAACGCTGCGGATTTTCATCCTGATCAACAGCAAAACAAGCTACCAGTTGACCGCCGTAGTCTTTTAGCTGCGGCTGCAACTGGGTGCAGGGGCCGAAGCGCCGACGACAGCGGGCGTTGAAGGCGCAACCCGGCGGTGGATTCAGTGGGCTTGGTAGTTCACCGCTGAGCTTGATGCGCTCGCGGCGATCGTCCGGGTTCAGGCGCGGCGTCGCGGAAAGTAGCGCCTGAGTGTACGGATGGCG > NC_000913/3701616‑3702109 | aTCGTCATTACGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGCGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTat > 2:115242‑M1/1‑249 (MQ=255) gACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgg > 1:114104‑M1/1‑235 (MQ=255) gATTTGGGTTTCGTTTCGCGTATCGGTGCTGGGGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCACGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgcgat > 2:414747‑M1/1‑232 (MQ=255) aTTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattctgatg < 1:142723‑M1/251‑21 (MQ=255) 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tttcgtGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgtttt > 1:301193‑M1/1‑219 (MQ=255) aTCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaacccttt < 1:314244‑M1/250‑40 (MQ=255) ggTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccanttgtgatgtttgttgttttaaccctttgc > 2:223419‑M1/1‑208 (MQ=255) gTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCAGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagt < 2:177975‑M1/251‑45 (MQ=255) gtTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtc < 1:18148‑M1/251‑53 (MQ=255) ttCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgc < 2:282448‑M1/248‑55 (MQ=255) 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ccGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgagg < 1:95210‑M1/251‑102 (MQ=255) tatttccTGATCTATAAAGACGCACAACTGGAAACACTTCGCGGATTTCAAGCATGGCTGATTCTGATGTACGGAATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctacaattgagatgtttgttgttttaaccctttgcattgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttgtgcggcgg > 2:356039‑M1/3‑147 (MQ=255) tttCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtgggg > 2:12275‑M1/1‑145 (MQ=255) ccTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatg < 1:191399‑M1/251‑110 (MQ=255) aaaGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaat > 2:1439‑M1/1‑132 (MQ=255) acaACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaattaacatc > 2:260144‑M1/1‑124 (MQ=255) aaCTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactacttaacatcagt > 1:168635‑M1/1‑122 (MQ=255) aaCTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaattaacatcagt > 2:467112‑M1/1‑122 (MQ=255) cTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaattaacatcagtgt > 1:268878‑M1/1‑120 (MQ=255) aGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaattaacatcagtgtaacagtgcggat < 1:321216‑M1/240‑144 (MQ=255) aGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaattaacatcagtgtaacagtgcggat > 2:321216‑M1/1‑97 (MQ=255) cTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaattaacatcagtgtaacagtgcggatcctccataaaatgcccct > 2:474884‑M1/1‑90 (MQ=255) ctgctgTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgg < 1:294802‑M1/130‑47 (MQ=255) 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(MQ=255) gTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTTAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaattaacatcagtgtaacagtgcggatcctccataaaatgcccctcgtgacctacaatctgtcaacagaatgtgaaaacgtcaat < 1:130810‑M1/250‑202 (MQ=255) aGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGCGTattctgctccaattgcgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaattaacatcagtgtaacagtgcggatcctccataaaatgcccctcgtgacctacaatctgtcaacagaatgtgaaaacgtcaatacagcc > 1:267716‑M1/1‑44 (MQ=255) gATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaattaacatcagtgtaacagtgcggatcctccataaaatgcccctcgtgacctacaatctgtcaacagaatgtgaaaacgtcaatacagccaacc < 1:223419‑M1/251‑212 (MQ=255) aaaCCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgc < 1:188727‑M1/110‑79 (MQ=255) aaCCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaattaacatcagtgtaacagtgcggatcctccataaaatgcccctcgtgacctacaatctgtcaacagaatgtgaaaacgtcaatacagccaaccgggatttac > 2:155547‑M1/1‑31 (MQ=255) ggCCCCGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaattaacatcagtgtaacagtgcggatcctccataaaatgcccctcgtgacctacaatctgtcaacagaatgtgaaaacgtcaatacagccaaccgggatttacaccaacggtgaga < 2:472197‑M1/251‑234 (MQ=255) ccGGTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaattaacatcagtgtaacagtgcggatcctccataaaatgcccctcgtgacctacaatctgtcaacagaatgtgaaaacgtcaatacagccaaccgggatttacaccaacggtgagaatcc > 1:143278‑M1/1‑14 (MQ=255) gTTTTGTGAGTattctgctccaattgtgatgtttgttgttttaaccctttgcagtgggttgtcgctgcctgaccttttttgttttttgcccggtcgggtcaacgttatgaggtggggatgccgtactaattaacatcagtgtaacagtgcggatcctccataaaatgcccctcgtgacctacaatctgtcaacagaatgtgaaaacgtcaatacagccaaccgggatttacaccaacggtgagaatccaca < 1:306122‑M1/251‑241 (MQ=255) gTattctgatccaattgtgatgtttgttgttttaacactttgaagtgggttgtcgctgcctgacattttttgttttttgcccgttcgggtcaacgttatgaggcggggatgccgtactaattaacataagtgtaaaagtgcggatcctccataaactgcccctcgtgacctacaatctgtcaacagaatgtgaaaacgtcaatacagccaaccgggatttacaccaacggtgagaatccacacacaa > 2:75124‑M1/1‑2 (MQ=255) | ATCGTCATTACGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCGGATTTAAAGCCTGGCTGATTCTGCTGTACGGCATTTTGCTATGCTTGTCGCCACTGTTGAAGCTGATTGAGTAAACCGGAGCGCATGGCCCCGGTTTTGTGAGTTAACGCTGCGGATTTTCATCCTGATCAACAGCAAAACAAGCTACCAGTTGACCGCCGTAGTCTTTTAGCTGCGGCTGCAACTGGGTGCAGGGGCCGAAGCGCCGACGACAGCGGGCGTTGAAGGCGCAACCCGGCGGTGGATTCAGTGGGCTTGGTAGTTCACCGCTGAGCTTGATGCGCTCGCGGCGATCGTCCGGGTTCAGGCGCGGCGTCGCGGAAAGTAGCGCCTGAGTGTACGGATGGCG > NC_000913/3701616‑3702109 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |