| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,286,390 | Δ3,880 bp | [yejO]–yejO | [yejO], insH8, yejO | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2286390 | 2290269 | 3880 | 54 [0] | [0] 54 | [yejO]–yejO | [yejO],insH8,yejO |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2286389 | 0 (0.000) | 54 (0.830) | 52/476 | 0.1 | 100% | intergenic (+102/+1) | proL/yejO | tRNA‑Pro/adhesin‑like autotransporter YejO |
| ? | NC_000913 | 2290270 = | 0 (0.000) | intergenic (‑90/‑230) | yejO/narP | adhesin‑like autotransporter YejO/DNA‑binding transcriptional dual regulator NarP | |||||
GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAATTGCTGTTAAAAGCATTGGGTACAGAAAATACCCATAGCTCCATACCCGGAGTCAGTTTTTAAAAACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAAC > NC_000913/2290023‑2290513 | ataaatcagttagcgaaatatcttacttgcaatcggtgtggaaaacggtagtattagcagccacgagtcggcacgtagcgcagcctggtagcgcaccgtcatggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACt < 1:360107‑M2/3‑1 (MQ=255) aaatcagttagcgaaatatcttacttgcaatcggtgtggaaaacggtagtattagcagccacgagtcggcacgtagcgcagcctggtagcgcaccgtcatggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacanatcacagcctgtttattttctgttaACTGtt > 2:249888‑M2/246‑251 (MQ=255) atcagttagcgaaatatcttacttgcaatcggtgtggaaaacggtagtattagcagccacgagtcggcacgtagcgcagcctggtagcgcaccgtcatggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGttt > 2:114077‑M2/244‑250 (MQ=255) tagcgaaatatcttacttgcaatcggtgtggaaaacggtagtattagcagccacgagtcggcacgtagcgcagcctggtagcgcaccgtcatggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGaa > 2:386133‑M2/238‑250 (MQ=255) tacttgcaatcggtgtggaaaacggtagtattagcagccacgagtcggcacgtagcgcagcctggtagcgcaccgtcatggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTAtt < 1:490267‑M2/26‑1 (MQ=255) caatcggtgtggaaaacggtagtattagcagccacgagtcggcacgtagcgcagcctggtagcgcaccgtcatggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGc < 2:182078‑M2/17‑1 (MQ=255) caatcggtgtggaaaacggtagtattagcagccacgagtcggcacgtagcgcagcctggtagcgcaccgtcatggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGc > 1:182078‑M2/219‑235 (MQ=255) caatcggtgtggaaaacggtagtattagcagccacgagtcggcacgtagcgcagcctggtagcgcaccgtcatggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGtgattg > 1:262227‑M2/219‑251 (MQ=255) aatcggtgtggaaaacggtagtattagcagccacgagtcggcacgtagcgcagcctggtagcgcaccgtcatgggatgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGtgattg > 1:160466‑M2/218‑250 (MQ=255) atcggtgtggaaaacggtagtattagcagccacgagacggaacgtagcgcagcctgggagcgcaccgtcatggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaacaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttaaggttggtttttttatatctgcacttacttcgctaaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaAATNTTTAAAGAAATGCACCCGTATTGtgattgat > 2:218655‑M2/217‑251 (MQ=255) gtgtggaaaacgttagtattagccgccacgagtcggcacgtagcgcagcctggtagcgcaccgtcatggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctcgcgtgccgaccaaaaatcccaataaaaaaccaacccttgcggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttcttttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAATATTGTGATTGAttttt < 2:465781‑M2/39‑1 (MQ=255) cggtagtatgagcagccacgagtcggcacgtagcgcagcctggtagcgcaccgtcatggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGtttt < 2:154332‑M2/49‑1 (MQ=255) cggctcgtagcgcagcctggtagcgcaccgtcacggggtgacgggggtcggaggttaaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttctatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttcttttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCCCAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGACGCTgatgaaa > 2:289648‑M2/180‑247 (MQ=255) 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gtcatggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAAt > 2:94780‑M2/151‑224 (MQ=255) gtcatggggggtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaagaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCa < 2:328649‑M2/101‑1 (MQ=255) catggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTtga < 1:434908‑M2/55‑1 (MQ=255) catggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTtga > 2:434908‑M2/149‑203 (MQ=255) catggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCaaa < 1:474573‑M2/103‑1 (MQ=255) atggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcctctcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccgtacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAg < 2:386789‑M2/104‑1 (MQ=255) ggggtgtcgggggtcggaggttcaaatcccntcgtgccgaccaaaaatcccaagaaaaaaccaacccttacggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATTAAAATGATGCCAAAGc < 2:220066‑M2/105‑1 (MQ=255) 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cggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCg > 1:167311‑M2/76‑251 (MQ=255) ggttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGt > 2:259214‑M2/75‑251 (MQ=255) gttggtttttttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGtt < 1:386133‑M2/178‑1 (MQ=255) tttatatctgcaattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGAtttttt < 1:421126‑M2/40‑1 (MQ=255) 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aattaattcgataaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACa < 1:259214‑M2/198‑1 (MQ=255) aattcgataaaaagaccgtgacacaccacagccggtttattttctgttaACTGGTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGATAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAAt < 2:16707‑M2/202‑1 (MQ=255) aaacagaccgtgacacatcacagcctgtttattttctgttaACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCta > 2:66246‑M2/42‑250 (MQ=255) 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GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAATTGCTGTTAAAAGCATTGGGTACAGAAAATACCCATAGCTCCATACCCGGAGTCAGTTTTTAAAAACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAAC > NC_000913/2290023‑2290513 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |