| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1799821 | 114 (1.050) | 3 (0.030) | 3/496 | 8.0 | 2.6% | coding (179/198 nt) | rpmI | 50S ribosomal subunit protein L35 |
| ? | NC_000913 | = 2094829 | 113 (1.040) | coding (295/591 nt) | hisH | imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
AGTTGACGGAACTGACGCTTACGTTGACGACGGTCACGGTAAGCATACTGACCAGCTTTGATAACAGCCTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAACTTCCACTTCGCATTGTTAATAAACGAAACAAAGGCGAACAAAGCCTGTGAAGCCCGAAGGCTC > NC_000913/1799571‑1800071 | aGTTGACGGAACTGACGCTTACGTTGACGACGGTCACGGTAAGCATACTGACCAGCTTTGATAACAGCCTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCGTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCAcg < 2:877132/251‑1 (MQ=255) aCGGACCTGACGCTTACGGTGACGACGGTCACGGTAAGCATACCGACAAGCTTGGATAACAGCCTGGAAGGCACCGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGTCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACCCCACTTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGGATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGAtt < 1:503965/251‑1 (MQ=255) aaCTGACGCTTACGTTGACGACGGTCACGGTAAGCATACTGACCAGCTTTGATAACAGCCTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCTTACGGCAGGCACGCGATTAcc > 2:852548/1‑250 (MQ=255) gacgGTCACGGTAAGCATACTGACCAGCTTTGATAACAGCCTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTgg > 1:680140/1‑250 (MQ=255) gTCACGGTAAGCATACTGACCAGCTTTGATAACAGCCTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAAcc > 1:455426/1‑251 (MQ=255) ggTAAGCATACTGACCAGCTTTGATAACAGCCTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGc > 2:133671/1‑251 (MQ=255) cATACTGACCAGCTTTGATAACAGCCTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCCCCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTACAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCgg > 1:19794/1‑251 (MQ=255) tACTGACAAGATTTGATAACAGCCTGGAAGGCAACGCGGCATACGCAAGAACGCGCATCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTGTCTTGTGACGTGCACGCGCAATACCACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGCATCTATATTCTAATTAAATAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTAAGGCAGGCACTAGATTACTAGTCCTAGATGGCTTTTGAAAACCATGACTTTCGGAc > 2:807299/1‑251 (MQ=255) aCTGACCAGCTTTGATAACAGCCTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGAc < 1:292959/250‑1 (MQ=255) aCTGACCAGCTTTGATAACAGCCTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACg < 1:650485/251‑1 (MQ=255) cTGACCAGCTTTGATAACAGCCTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGc > 2:41458/1‑251 (MQ=255) aGCTTTGATAACAGCATGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCTTGGCTTTCGGACGCAggcgc > 2:645146/1‑248 (MQ=255) aTAACAGCCTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGacgtttac < 1:880804/251‑1 (MQ=255) aaCAGCCTGGAAGGCACCGCGGTAGACGCGGGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGacgtttacgt < 2:455468/251‑1 (MQ=255) cAGCCTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCGTATGCGTACGGCAGGCTCGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACTCAGGTGacgtttacgttt < 2:338490/251‑1 (MQ=255) aGCCTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGATCGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTg < 1:741658/251‑1 (MQ=255) ccTGGAAGGCAACGCGGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGt < 1:13873/251‑1 (MQ=255) aCGCGGTATACGCGAGAACGCGCCCCGTAGTAGCCTTTCGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACCCCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAATCCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTgg < 1:597732/251‑1 (MQ=255) gcgGTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTc < 1:106844/251‑1 (MQ=255) ggTATACGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAg < 1:344169/251‑1 (MQ=255) aCGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTGAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGATAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAAtg < 1:792911/250‑1 (MQ=255) aCGCGAGAACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCa < 1:502615/197‑1 (MQ=255) gaACGCGCACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCa < 1:154965/251‑1 (MQ=255) gcACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAg < 1:799853/251‑1 (MQ=255) gcACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTAAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTTCCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCGTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAg < 2:710651/251‑1 (MQ=255) cACCGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGc > 1:808910/1‑251 (MQ=255) cccGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCg < 2:767397/250‑1 (MQ=255) cGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGa < 1:238663/237‑1 (MQ=255) cGTAGTAGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGa > 2:238663/1‑237 (MQ=255) gtagtaGCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCgtgc < 2:787264/251‑1 (MQ=255) agCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCgtgcttgtg > 2:84924/1‑251 (MQ=255) gCCTTTAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCgtgcttgtgc > 1:841046/1‑251 (MQ=255) cccgatcttttCAAAATTTTCTGGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTaa < 2:668573/243‑1 (MQ=255) tAGCTTGTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTaa < 1:795694/250‑1 (MQ=255) tGTTTCAAAATTTTCTTGTGCCGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTGCGGACGCAGGTGACGTTTACGTGTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAacca < 1:309306/250‑1 (MQ=255) gTTTCAAAATTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAACAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAaccacc > 2:667579/1‑251 (MQ=255) aTTTTCTTGTGACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCgg < 2:165496/251‑1 (MQ=255) tCTTGTGACGTGCACATGCAATAACACCGCGTTTTAAGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGttt < 2:528453/250‑1 (MQ=255) tgtgACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGtttt < 1:388926/248‑1 (MQ=255) gtgACGTGCACGTGCAATAACACCACGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTg > 2:104056/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |