| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,313,864 | Δ16,405 bp | yjdP–rdcB | 18 genes yjdP, phnP, phnO, phnN, phnM, phnL, phnK, phnJ, phnI, phnH, phnG, phnF, phnD, phnC, yjdN, yjdM, rdcA, rdcB |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4313864 | 4330268 | 16405 | 54 [0] | [0] 54 | yjdP–rdcB | yjdP,phnP,phnO,phnN,phnM,phnL,phnK,phnJ,phnI,phnH,phnG,phnF,phnD,phnC,yjdN,yjdM,rdcA,rdcB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4313863 | 0 (0.000) | 54 (0.790) | 52/490 | 0.2 | 100% | intergenic (+64/‑5) | rpiB/yjdP | allose‑6‑phosphate isomerase/ribose‑5‑phosphate isomerase B/protein YjdP |
| ? | NC_000913 | 4330269 = | 0 (0.000) | intergenic (+31/‑233) | rdcB/proP | regulator of diguanylate cyclase RdcB/osmolyte:H(+) symporter ProP | |||||
TCAGTGGTTTGCCTCTTCGACCGTTCCGACGGGCGGGGAGCATGCTGATTTTTTAAGTTGGCTGGGAAAGTGGACCACGGCAGATAAACAACCCGTTTGCTGGTCAGTGACCCAACGCTGGCAAACTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAATGGGCCAACTCTGCGAGGAAAGCTATGCTGAAAAGGA > NC_000913/4330025‑4330514 | tattccgcgcaactttcgcggcagcataacgacaccaacgtgctggcttttggttcacgagtggttggcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATc < 2:88051‑M2/5‑1 (MQ=255) gcaactttcgcggcagcataacgacaccaacgtgctggcttttggttcacgagtggttggcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGa > 2:389729‑M2/237‑250 (MQ=255) aactttcgcggcagcataacgacaccaacgtgctggcttttggttcacgagtggttggcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgatattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatcgagtttctttttgagtttgAAATCCATGTGTGAAGt > 1:22258‑M2/235‑251 (MQ=255) gggcagcataacgacaccaacgtgctggcttttggttcacgagtggttggcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATcaca < 2:4369‑M2/25‑1 (MQ=255) gcagcataacgacaccaacgtgctggcttttggttcacgagtggttggcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACaa > 2:236897‑M2/225‑250 (MQ=255) ataacgacaccaacgtgctggcttttggttcacgagtggttggcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTa > 2:459034‑M2/220‑250 (MQ=255) aacgacaccaacgtgctggcttttggttcacgagtggttggcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAac > 1:229110‑M2/218‑251 (MQ=255) ggcttttggttcacgagtggttggcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTaaaa < 1:552085‑M2/49‑1 (MQ=255) tggttcacgagtggttggcctcgaactggcaacaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCAtt > 1:115916‑M2/195‑251 (MQ=255) gttcacgagtggttggcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGtt < 1:209051‑M2/18‑1 (MQ=255) gttcacgagtggttggcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGtt > 2:209051‑M2/193‑210 (MQ=255) ttcacgagtggttggcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAAc > 1:289307‑M2/192‑251 (MQ=255) ggttggcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAAtt > 1:282583‑M2/183‑251 (MQ=255) tggcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCa < 1:358402‑M2/71‑1 (MQ=255) gcctcgaactggcaaaaatgattgtggatgggcggctggtcgcacagtatgaaggcggttgccagcaacaaagcctggaggcgataacggcactagagcagaggagaaattgcgattgatccacgaattgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATCTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCTCAATTCAGGc < 2:569782‑M2/74‑1 (MQ=255) cctcgaactggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCg < 1:340991‑M2/75‑1 (MQ=255) tcgaactggtaaaaccgattgcggatgcatggctgggcgcaaagtacgaaggcggtcgtcatcaccaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccaccacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagcggttctttttcaggttgAAATCCATGGGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTCGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTc > 2:8140‑M2/175‑251 (MQ=255) actggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACt < 1:236897‑M2/81‑1 (MQ=255) ctggcaaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTg > 2:244464‑M2/170‑251 (MQ=255) aaaaatgattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTg > 1:502767‑M2/165‑251 (MQ=255) gattgtggatgcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgaggaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGCAGCTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGt > 2:557795‑M2/159‑250 (MQ=255) gcgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTaa < 1:66618‑M2/103‑1 (MQ=255) cgtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAAc < 1:186714‑M2/104‑1 (MQ=255) gtggctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAAcc > 2:548483‑M2/147‑251 (MQ=255) gctgggcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgagtacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACACATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATAAACTGCCCAATTCAGGCATCAACTGGTTTGATTGAACATtcattaaacgtg > 2:529638‑M2/144‑246 (MQ=255) gcgcacagtacgaaggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGgtg < 1:516928‑M2/113‑1 (MQ=255) ggcggtcgtcatcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCt < 1:201070‑M2/127‑1 (MQ=255) cgtcatcaacaaagcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtcatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGTTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGCTTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGATACGCtt > 2:213890‑M2/119‑251 (MQ=255) atcaacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGtt > 1:354289‑M2/115‑250 (MQ=255) aacaacgcgtggaggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTAc > 1:392709‑M2/112‑249 (MQ=255) ggcgattacggcaatagagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGCCTTTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGTTTGTCCATTCCTTAACCGGAGGGGGTAAGCAAACCCGCTACGCTTTTTACAAAGATGGCATCctc > 1:54966‑M2/99‑250 (MQ=255) ggcgatcacggcaatcgagaaaaggagaacttgagattcatccactaattgcatggatgagaaatgattaatgaggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACAGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAAATTGCATCCTg > 2:146838‑M2/99‑251 (MQ=255) agagcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTcccc < 2:502767‑M2/168‑1 (MQ=255) agcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCtt < 2:552688‑M2/170‑1 (MQ=255) agcagcggagaaattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCtt > 1:540004‑M2/82‑251 (MQ=255) aattgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatcgagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTc > 2:219645‑M2/71‑251 (MQ=255) tgagattcatccactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTcgcg > 2:74301‑M2/68‑251 (MQ=255) cactacttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAGCCCGCTACGCTTGTTACAGTGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCt < 2:536150‑M2/195‑1 (MQ=255) cttgcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGt > 2:110148‑M2/52‑251 (MQ=255) gcatggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTg > 1:426154‑M2/49‑251 (MQ=255) ggatgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCgg > 1:175787‑M2/45‑250 (MQ=255) tgagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAAt > 2:335984‑M2/42‑251 (MQ=255) gagtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAATg > 2:360266‑M2/41‑251 (MQ=255) gtaatgattaatgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAATggg > 1:128048‑M2/39‑251 (MQ=255) atgtggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAATGGGCCAACTCTGc < 2:540004‑M2/223‑1 (MQ=255) ggatagagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATGCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAATGGGCCAACTCTGCGAg < 2:354289‑M2/226‑1 (MQ=255) agagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAATGGGCCAACTCTGCGAGGAAAg < 1:518069‑M2/231‑1 (MQ=255) gagtttctttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAATGGGCCAACTCTGCGAGGAAAGc < 2:289307‑M2/232‑1 (MQ=255) agtttcattttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAATGGGCCAACTCTGCGAGGAAAGCt < 2:128048‑M2/233‑1 (MQ=255) ttttgaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAATTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAATGGGCCAACTCTGCGAGGAAAGCTATGCTg < 1:423939‑M2/239‑1 (MQ=255) ggaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAATGGGCCAACTCTGCGAGGAAAGCTATGCTGaaaa < 2:199506‑M2/243‑1 (MQ=255) gaggttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAATGGGCCAACTCTGCGAGGAAAGCTATGCTGAAAAg < 2:36275‑M2/244‑1 (MQ=255) gttgAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAATGGGCCAACTCTGCGAGGAAAGCTATGCTGAAAAGGa > 1:311976‑M2/5‑250 (MQ=255) gttgAAATCACTGTGTGAAGTTGATCACAAATTTCAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGCCGTCAACTGGTTTGATTGTACCTTCCTTAACCGCAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTCCAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGCACTGGGCCCACTCTGCCAGGAAAGctacgctgcgacgga > 2:314682‑M2/5‑243 (MQ=255) | TCAGTGGTTTGCCTCTTCGACCGTTCCGACGGGCGGGGAGCATGCTGATTTTTTAAGTTGGCTGGGAAAGTGGACCACGGCAGATAAACAACCCGTTTGCTGGTCAGTGACCCAACGCTGGCAAACTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTTTTGCGGCCGTCGCGCTGATTTTTCTGGCGTTTGCGGAAATGGGCCAACTCTGCGAGGAAAGCTATGCTGAAAAGGA > NC_000913/4330025‑4330514 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |