| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,313,864 | Δ16,405 bp | yjdP–rdcB | 18 genes yjdP, phnP, phnO, phnN, phnM, phnL, phnK, phnJ, phnI, phnH, phnG, phnF, phnD, phnC, yjdN, yjdM, rdcA, rdcB |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4313864 | 4330268 | 16405 | 54 [0] | [0] 54 | yjdP–rdcB | yjdP,phnP,phnO,phnN,phnM,phnL,phnK,phnJ,phnI,phnH,phnG,phnF,phnD,phnC,yjdN,yjdM,rdcA,rdcB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4313863 | 0 (0.000) | 54 (0.790) | 52/490 | 0.2 | 100% | intergenic (+64/‑5) | rpiB/yjdP | allose‑6‑phosphate isomerase/ribose‑5‑phosphate isomerase B/protein YjdP |
| ? | NC_000913 | 4330269 = | 0 (0.000) | intergenic (+31/‑233) | rdcB/proP | regulator of diguanylate cyclase RdcB/osmolyte:H(+) symporter ProP | |||||
TATTCCGCGCAACTTTCGCGGCAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCGACGACACCATTGGCAATATTCAGCAGGCGATTAATGACGCTTATAACCCTGACCGTGGGCGAGACTATGAAGATTCGCGCGACGACGGCTGGCAGCGTGAAGTGAGCGACGATCGGCGCAGACAATATGACGACCGCCGCCGCCAGTTTGAAGATCGCCGCAGGCA > NC_000913/4313620‑4314109 | tATTCCGCGCAACTTTCGCGGCAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatc < 2:88051‑M1/249‑6 (MQ=255) gcAACTTTCGCGGCAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtga > 2:389729‑M1/1‑236 (MQ=255) aaCTTTCGCGGCAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGATATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATCGAGTTTCTTTTTGAGTTTGaaatccatgtgtgaagt > 1:22258‑M1/1‑234 (MQ=255) gggcAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcaca < 2:4369‑M1/250‑26 (MQ=255) gcagcaTAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaa > 2:236897‑M1/1‑224 (MQ=255) aTAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaattta > 2:459034‑M1/1‑219 (MQ=255) aaCGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaac > 1:229110‑M1/1‑217 (MQ=255) ggCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaa < 1:552085‑M1/249‑50 (MQ=255) tGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAACAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcatt > 1:115916‑M1/1‑194 (MQ=255) gTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagtt < 1:209051‑M1/210‑19 (MQ=255) gTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagtt > 2:209051‑M1/1‑192 (MQ=255) ttCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaac > 1:289307‑M1/1‑191 (MQ=255) ggTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaatt > 1:282583‑M1/1‑182 (MQ=255) tGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattca < 1:358402‑M1/250‑72 (MQ=255) gCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGGGCGGCTGGTCGCACAGTATGAAGGCGGTTGCCAGCAACAAAGCCTGGAGGCGATAACGGCACTAGAGCAGAGGAGAAATTGCGATTGATCCACGAATTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatctaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgctcaattcaggc < 2:569782‑M1/251‑75 (MQ=255) ccTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcg < 1:340991‑M1/251‑76 (MQ=255) tCGAACTGGTAAAACCGATTGCGGATGCATGGCTGGGCGCAAAGTACGAAGGCGGTCGTCATCACCAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACCACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGCGGTTCTTTTTCAGGTTGaaatccatgggtgaagttgatcacaaatttaaacactggtcgggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtc > 2:8140‑M1/1‑174 (MQ=255) aCTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaact < 1:236897‑M1/251‑82 (MQ=255) cTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactg > 2:244464‑M1/1‑169 (MQ=255) aaaaaTGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttg > 1:502767‑M1/1‑164 (MQ=255) gATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGGAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgcagctgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgt > 2:557795‑M1/1‑158 (MQ=255) gCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaa < 1:66618‑M1/251‑104 (MQ=255) cGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaac < 1:186714‑M1/251‑105 (MQ=255) gTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaacc > 2:548483‑M1/1‑146 (MQ=255) gCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGAGTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacacatttaaacactggtagggtaaaaaggtcataaactgcccaattcaggcatcaactggtttgattgaacattcattaaacgtg > 2:529638‑M1/1‑143 (MQ=255) gcgcACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtg < 1:516928‑M1/251‑114 (MQ=255) ggCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgct < 1:201070‑M1/251‑128 (MQ=255) cgtcATCAACAAAGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTCATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtaggttaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgcttgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgatacgctt > 2:213890‑M1/1‑118 (MQ=255) atcaACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgtt > 1:354289‑M1/1‑114 (MQ=255) aacaacGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttac > 1:392709‑M1/1‑111 (MQ=255) ggCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggcctttaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgtttgtccattccttaaccggagggggtaagcaaacccgctacgctttttacaaagatggcatcctc > 1:54966‑M1/1‑98 (MQ=255) ggCGATCACGGCAATCGAGAAAAGGAGAACTTGAGATTCATCCACTAATTGCATGGATGAGAAATGATTAATGAGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacacaggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagaaattgcatcctg > 2:146838‑M1/1‑98 (MQ=255) agagCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctcccc < 2:502767‑M1/251‑169 (MQ=255) agcagcGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctcccctt < 2:552688‑M1/251‑171 (MQ=255) agcagcGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctcccctt > 1:540004‑M1/1‑81 (MQ=255) aaTTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATCGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtc > 2:219645‑M1/1‑70 (MQ=255) tGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcg > 2:74301‑M1/1‑67 (MQ=255) cACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaagcccgctacgcttgttacagtgattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttct < 2:536150‑M1/251‑196 (MQ=255) ctTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgt > 2:110148‑M1/1‑51 (MQ=255) gCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttg > 1:426154‑M1/1‑48 (MQ=255) ggATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcgg > 1:175787‑M1/1‑44 (MQ=255) tGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcggaaat > 2:335984‑M1/1‑41 (MQ=255) gAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcggaaatg > 2:360266‑M1/1‑40 (MQ=255) gTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcggaaatggg > 1:128048‑M1/1‑38 (MQ=255) aTGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcggaaatgggccaactctgc < 2:540004‑M1/251‑224 (MQ=255) ggATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaatgcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcggaaatgggccaactctgcgag < 2:354289‑M1/250‑227 (MQ=255) agagTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcggaaatgggccaactctgcgaggaaag < 1:518069‑M1/251‑232 (MQ=255) gagTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcggaaatgggccaactctgcgaggaaagc < 2:289307‑M1/251‑233 (MQ=255) agTTTCATTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcggaaatgggccaactctgcgaggaaagct < 2:128048‑M1/251‑234 (MQ=255) ttttGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaattggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcggaaatgggccaactctgcgaggaaagctatgctg < 1:423939‑M1/250‑240 (MQ=255) ggaGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcggaaatgggccaactctgcgaggaaagctatgctgaaaa < 2:199506‑M1/250‑244 (MQ=255) gAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcggaaatgggccaactctgcgaggaaagctatgctgaaaag < 2:36275‑M1/251‑245 (MQ=255) gTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaaccggagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttacagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcggaaatgggccaactctgcgaggaaagctatgctgaaaagga > 1:311976‑M1/1‑4 (MQ=255) gTTGaaatcactgtgtgaagttgatcacaaatttcaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcagccgtcaactggtttgattgtaccttccttaaccgcagggtgtaagcaaacccgctacgcttgttccagagattgcatcctgcaattcccgctccccttttgcggccgtcgcgctgatttttctggcgtttgcggcactgggcccactctgccaggaaagctacgctgcgacgga > 2:314682‑M1/1‑4 (MQ=255) | TATTCCGCGCAACTTTCGCGGCAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCGACGACACCATTGGCAATATTCAGCAGGCGATTAATGACGCTTATAACCCTGACCGTGGGCGAGACTATGAAGATTCGCGCGACGACGGCTGGCAGCGTGAAGTGAGCGACGATCGGCGCAGACAATATGACGACCGCCGCCGCCAGTTTGAAGATCGCCGCAGGCA > NC_000913/4313620‑4314109 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |