| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,855,159 | Δ11,170 bp | [yidF]–yidE | [yidF], yidG, yidH, yidI, yidJ, yidK, yidL, glvB, glvC, yidP, yidE | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3855159 | 3866328 | 11170 | 143 [2] | [2] 143 | [yidF]–yidE | [yidF],yidG,yidH,yidI,yidJ,yidK,yidL,glvB,glvC,yidP,yidE |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3855158 | 2 (0.010) | 141 (1.010) | 122/490 | 0.0 | 99.3% | coding (454/498 nt) | yidF | uncharacterized protein YidF |
| ? | NC_000913 | 3866329 = | 0 (0.000) | intergenic (‑56/+140) | yidE/ibpB | putative transport protein YidE/small heat shock protein IbpB | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
CCTGGCGGGCACGGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTTATCAGATCACGCATCACCCGCATATGCGGTGCGGAGTAAGAATAAAACGCCTGATAGCCCGCACAAAGCACGCTGTCTGGCGTCTCCTGCCGAGCGTGCGGGCACAGGCGATGCCAGTCGCACGCCTGGCAGTCACAGCGCGGTTGCGGGTTTTCGCTGCCACACCATTTTTGTAAGGTGGCGTCAAAAAGCTCAATCGAGATACGACTGATATCTGCCCGCACCCAACACTCGAACAGGGCAATTAA > NC_000913/3854911‑3855407 | ccTGGCGGGCACTGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTga < 2:331715‑M1/250‑3 (MQ=255) 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cACGGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttg < 1:673590‑M1/251‑13 (MQ=255) gggcTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgcc < 2:459193‑M1/250‑15 (MQ=255) ggCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCCCGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgcct > 2:750063‑M1/1‑236 (MQ=255) 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cggcggTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGATGACCTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGCCCTTAATGGGCTTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGACATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgacgccgatttgccttataacgcacattat > 1:1054741‑M1/1‑221 (MQ=255) ggcggTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatc > 2:1055720‑M1/1‑220 (MQ=255) ggggtcTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatca < 2:37955‑M1/249‑33 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |