| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 3,855,159 | Δ11,170 bp | [yidF]–yidE | [yidF], yidG, yidH, yidI, yidJ, yidK, yidL, glvB, glvC, yidP, yidE | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 3855159 | 3866328 | 11170 | 143 [2] | [2] 143 | [yidF]–yidE | [yidF],yidG,yidH,yidI,yidJ,yidK,yidL,glvB,glvC,yidP,yidE |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3855158 | 2 (0.010) | 141 (1.010) | 122/490 | 0.0 | 99.3% | coding (454/498 nt) | yidF | uncharacterized protein YidF |
| ? | NC_000913 | 3866329 = | 0 (0.000) | intergenic (‑56/+140) | yidE/ibpB | putative transport protein YidE/small heat shock protein IbpB | |||||
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ATTCCTGAATAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGG‑CAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATA‑CGCTGCGCTGC‑G‑ATGGGTT‑CAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGT‑AAACCGTTTACGAAGGTTGCGC > NC_000913/3866081‑3866578 | cctggcgggcactgctggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGa < 2:331715‑M2/2‑1 (MQ=255) ggcgggcacggctggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAg < 1:688778‑M2/4‑1 (MQ=255) ggcgggcacggctggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAg < 2:282166‑M2/4‑1 (MQ=255) ggcacggctggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGAtt > 1:433213‑M2/242‑251 (MQ=255) 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gcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATc > 1:697092‑M2/196‑251 (MQ=255) gtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCtt > 1:646255‑M2/194‑251 (MQ=255) gctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTa < 1:1076278‑M2/59‑1 (MQ=255) 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aaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGagta < 2:586161‑M2/89‑1 (MQ=255) aaccggtcaaggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCttaacc > 2:901920‑M2/162‑221 (MQ=255) accggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACggg > 1:138590‑M2/161‑196 (MQ=255) accggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACggg < 2:138590‑M2/36‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |