| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,139,771 | 10483 bp→TG | [ptsA]–[eptC] | [ptsA], frwC, frwB, pflD, pflC, frwD, yijO, [eptC] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4139771 | 4150253 | 10483 | 66 [0] | [0] 67 | [ptsA]–[eptC] | [ptsA],frwC,frwB,pflD,pflC,frwD,yijO,[eptC] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4139770 | 0 (0.000) | 65 (0.690) +TG |
60/484 | 0.4 | 100% | coding (2452/2502 nt) | ptsA | putative PTS multiphosphoryl transfer protein PtsA |
| ? | NC_000913 | 4150254 = | 0 (0.000) | coding (12/1734 nt) | eptC | phosphoethanolamine transferase EptC | |||||
AGCACAGCGCCGCCAGAGAGGCCGCCCATAGCACCACGCCGATTACTGCGGCAATAATTTTAATCCGCTTCGGAAAGAGGAATACCGGGATCAACCACAGCGAACTGAATAACAGCGAGTCGCGAATGCCGTTAGTGCCACTATAACCACTGATGTAAATAATGGCCTGTAGCAGAGTAGAGAAAAACCAAAAGTAGAGCAGTGCCCAACCCAGGGCTTTCCAGCTAAAAAGAGGTTTAGCCTGGACTTCTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTGAAAAAATATCGCCGAATGTAACGACAATTCCTTAAGGATATCTGAAGGTATATTCAGAATTTGAATAAAATGCAGACAGAAATATATTGAAAACGAGGGTGTTAGAACAGAAGTATTTCAGAAAACCCTCGCGCAAAAGCACGAGGGTTTGCAGAAGAGGAAGATTAGCCGGTATTACGCATACCTGCCGCAATCCCGGCAATAGTGACCATTAACGCTTG > NC_000913/4150004‑4150503 | gctcatggtctgagcaaacagaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgt > 2:671187‑M2/251‑251 (MQ=255) catggtctgagcaaacagaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgcgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgtgtg < 1:547759‑M2/4‑1 (MQ=255) gtctgagcaaacagaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAAt < 2:533160‑M2/8‑1 (MQ=255) gagcaaacagaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCa < 1:140109‑M2/11‑1 (MQ=255) 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aaacagaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagctacagttccatgatgtttccttttacagttcccgttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgCGTGGAATGCATAgtt > 2:306331‑M2/236‑250 (MQ=255) agaatgcccgcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagaacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacggtagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccgtttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGaa < 1:727057‑M2/20‑1 (MQ=255) gaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAAc < 1:415041‑M2/21‑1 (MQ=255) catcaccactcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatagggactcctggctggcagagataatgctcgggtgagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTg < 2:20630‑M2/29‑1 (MQ=255) caccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTGaaa > 2:70554‑M2/219‑250 (MQ=255) caatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagtaccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGACCCTGTCTTGAAAAAat < 1:288999‑M2/36‑1 (MQ=255) gctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTGAAAAAATATCGc > 1:780230‑M2/211‑251 (MQ=255) ttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTGAAAAAATATCGCCg < 1:838532‑M2/43‑1 (MQ=255) gcgctgcagcacttcccagatgcactcatagcgggccgcgataatgctcgggttagttggcaccccggcaatggggaagatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccaggatgtttcctgtgacagttccagttcaggttgcagctggctggctatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTCAAAAAATATCTCCGAATGTAACg < 2:718676‑M2/52‑1 (MQ=255) 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AGCACAGCGCCGCCAGAGAGGCCGCCCATAGCACCACGCCGATTACTGCGGCAATAATTTTAATCCGCTTCGGAAAGAGGAATACCGGGATCAACCACAGCGAACTGAATAACAGCGAGTCGCGAATGCCGTTAGTGCCACTATAACCACTGATGTAAATAATGGCCTGTAGCAGAGTAGAGAAAAACCAAAAGTAGAGCAGTGCCCAACCCAGGGCTTTCCAGCTAAAAAGAGGTTTAGCCTGGACTTCTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTGAAAAAATATCGCCGAATGTAACGACAATTCCTTAAGGATATCTGAAGGTATATTCAGAATTTGAATAAAATGCAGACAGAAATATATTGAAAACGAGGGTGTTAGAACAGAAGTATTTCAGAAAACCCTCGCGCAAAAGCACGAGGGTTTGCAGAAGAGGAAGATTAGCCGGTATTACGCATACCTGCCGCAATCCCGGCAATAGTGACCATTAACGCTTG > NC_000913/4150004‑4150503 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |