| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 3,890,411 | IS1 (–) +9 bp | coding (176‑184/1248 nt) | tnaB → | tryptophan:H(+) symporter TnaB |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 31 (1.000) | 30/490 | 0.1 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3890419 | 0 (0.000) | coding (184/1248 nt) | tnaB | tryptophan:H(+) symporter TnaB | |||||
GGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCA‑TCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAA‑CATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAA‑CGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTA > NC_000913/3890169‑3890664 | ggATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAg < 2:63877/251‑1 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1:119681‑M2/22‑251 (MQ=255) cAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatcc > 1:203698‑M2/1‑30 (MQ=255) cAATGCTTCATTACGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagcgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgaattcagtccaagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcattcaacggccagccatccg < 2:41048‑M2/251‑222 (MQ=255) caccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCA‑TCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAA‑CATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAA‑CGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTAtt > 2:151268‑M2/5‑251 (MQ=255) ccctttaattaGAAGAAAATTTAAATTACCCCGTCGGTTCCATTTTTAA‑ACCAACCCCCAAAGAGTTAACGGGTAAC‑CCTGGAAACATTAGCAGCGTTATGCCTGTGGCCTTCGTTCTCATTATCCTCCCTTATTCTAAAATCGCTGTGAATGGGTTAATCATT‑GTGAAAACAAAATCAA‑GGAGTTGGTGTATCACGCTATTCCTCGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATtgt < 1:193027/244‑1 (MQ=255) gttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCA‑TCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAA‑CATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAA‑CGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGt < 2:246445/251‑1 (MQ=255) aGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtg > 1:303055‑M2/1‑2 (MQ=255) | GGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCA‑TCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAA‑CATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAA‑CGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTA > NC_000913/3890169‑3890664 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |