| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 3,890,411 | IS1 (–) +9 bp | coding (176‑184/1248 nt) | tnaB → | tryptophan:H(+) symporter TnaB |
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| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 31 (1.000) | 30/490 | 0.1 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3890419 | 0 (0.000) | coding (184/1248 nt) | tnaB | tryptophan:H(+) symporter TnaB | |||||
TAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATT > NC_000913/3890166‑3890657 | taAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAAAAAAAATAGCCTTACTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGgttattgttat > 1:158150/1‑251 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cAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatcc > 1:203698‑M2/1‑30 (MQ=255) cAATGCTTCATTACGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagcgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgaattcagtccaagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcattcaacggccagccatccg < 2:41048‑M2/251‑222 (MQ=255) caccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTAtt > 2:151268‑M2/5‑251 (MQ=255) | TAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATT > NC_000913/3890166‑3890657 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |