| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,016,437 | Δ2 bp :: IS186 (–) +8 bp :: Δ1 bp | coding (570‑577/687 nt) | fliH → | flagellar biosynthesis protein FliH |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2016437 = | 1 (0.020) | 75 (1.460) | 69/482 | 0.0 | 98.6% | coding (570/687 nt) | fliH | flagellar biosynthesis protein FliH |
| ? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2016444 | 2 (0.040) | 61 (1.190) | 59/484 | 0.1 | 96.7% | coding (577/687 nt) | fliH | flagellar biosynthesis protein FliH |
| ? | NC_000913 | = 2515615 | NA (NA) | noncoding (1343/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
ACTTGATAGTGTGATAGCGTCGCGCCTGATGCAGATGGCGCTGGAGGCGGCACGTCAGGTCATCGGTCAGACGCCAACGGTGGATAACTCGGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCAcc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2016200‑2016444‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATT < NC_000913/2515615‑2515374 cCTTGATAGTGTGATAGCGTCGCGCCTGATGCAGATGGCGCTGGAGGCGGCACGTCAGGTCATCGGTCAGACGCCAACGGTGGATAACTCGGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAA < 2:134807/250‑1ACTTGATAGTGTGATAGCGTCGCGCCGGATGCAGATGGCGCTGGAGGCGGCACGTCAGGAAATCGGTCAGACGCCAACGGTGGATAAATCGGCACTGATCAACCAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGCACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGCTATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGGGGGTCGATGCAACCATA > 2:310424/1‑250 ATAGTGTGATAGCGTCGCGCCTGATGCAGATGGCGCTGGAGGCGGCACGTCAGGTCATCGGTCAGACGCCAACGGTGGATAACTCGGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCT > 1:295003/1‑251 AGTGTGATAGCGTCGCGCCTGATGCAGATGGCGCTGGAGGCGGCACGTCAGGTCATCGGTCAGACGCCAACGGTGGATAACTCGGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCGCCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCTGCGCTACCTTAATTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTA < 2:265087/250‑1 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CATCGGTCAGACGCCAACGGTGGATAACTCGGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAATAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGAC < 2:295003/250‑1 ATCGGTCAGACGCCAACGGTGGATAACTCGGCACTGATCAAACCGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACG > 1:203047/1‑250 CGGTCAGACGCCAACGGTGGATAACTCGGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGAT < 2:49514/250‑1 GTCAGACGCCAACGGTGGATAACTCGGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCGCCCGGATGGTCTGCAACGTGTGGATGATATGCGCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTTCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCC < 1:199552/251‑1 GTCAGACGCCAACGGTGGATAACTCGGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCC > 2:63687/1‑251 CCAACGGTGGATAACTCAGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGCAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTC > 2:184001/1‑251 ggagAACTCGGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATT < 2:379983/246‑1 ATAACTCGGCACTGATCAAACAGATACAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTAGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCG > 2:361010/1‑251 AACTCGGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTT < 2:247585/251‑1 AACTCGGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTT > 1:466152/1‑251 CGGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGT < 1:269062/251‑1 GGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGCTCCCTCGTTAAGACGCTGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGT > 1:486791/1‑250 CAAACAGCTCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTC > 1:133046/1‑249 CAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTATCTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAG < 2:239953/251‑1 ACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGG > 1:7307/1‑250 ACAGATCCAACAGTTGTAGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCGACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGA < 1:540026/251‑1 AACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCC > 1:372687/1‑251 ACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCC > 1:24901/1‑251 GTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTTCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCGCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCccg < 1:266023/251‑4 AGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCCCAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGGTCGGCGCTCCCTTAAGGTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCA < 2:157924/251‑1 ACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTA > 2:381766/1‑250 CGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCTCCTGTAAGC < 1:184001/251‑1 TATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCTCCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTTGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTC < 2:118099/250‑1 CAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCC > 1:58073/1‑247 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CAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTT > 1:443570/1‑251 AGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCCACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTT > 1:446211/1‑250 AGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTT > 1:321503/1‑250 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> 2:410898/1‑223 ATGATATGCTCGGCGCTCCCTTAATTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCGCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGGTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTGTGTTATTCTCCACAACGAGGTAGTTCTTCTTTTCGGATCCG < 2:514130/251‑1 TCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTG > 2:116299/1‑251 ACCTTAAGTTTGCATGGCGGGCGCTTGCGGGGCGGTCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTGCTTTTCGGATCCGGCACGTCTTGGGGGG < 2:203047/249‑1 CTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAAT > 1:4476/1‑251 aggTTGCAGGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAG < 2:4476/248‑1 GTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCGGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGTATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGC < 1:310424/251‑1 CATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGG < 1:20526/251‑1 CTGGCGCTTGCGGGGAGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGACATCCAGCGATGGCTGGt > 2:282258/1‑250 GGCGCTTGCGGGGCGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGGCTGGATT > 1:394124/1‑251 CGCTTGCGGCGCGATCCCACCATAAGCGCTCACTTAAGGGTTGAACCATCTGACGACTGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTACGGCGATGCCTCGAGTTCTTCAATTGAGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCAACATGTAAGCTCCAGCTGACCATTTTTGTTATTCTCCACACCGCGTTAGTTCTTCTTTTCGGCTCCGGCACTTCTGGGGGGGTAATCCAGCGGTGGCTGGATTtt > 2:245331/1‑249 CGATCCCACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTCGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACACCGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGGCTGGCTTCTGTCGTCAATT > 2:410536/1‑250 ACTTGATAGTGTGATAGCGTCGCGCCTGATGCAGATGGCGCTGGAGGCGGCACGTCAGGTCATCGGTCAGACGCCAACGGTGGATAACTCGGCACTGATCAAACAGATCCAACAGTTGTTGCAGCAAGAACCGTTATTCAGCGGTAAACCACAGCTGCGCGTGCACCCGGATGATCTGCAACGTGTGGATGATATGCTCGGCGCTACCTTAAGTTTGCATGGCTGGCGCTTGCGGGGCGATCCCAcc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2016200‑2016444‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATT < NC_000913/2515615‑2515374 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |