| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 1,977,451 | (CTGGAAAGTTGCAG)1→2 | coding (394/579 nt) | flhC ← | DNA‑binding transcriptional dual regulator FlhC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1977430 = | 5 (0.090) | 36 (0.650) | 33/474 | 0.6 | 91.3% | coding (415/579 nt) | flhC | DNA‑binding transcriptional dual regulator FlhC |
| ? | NC_000913 | = 1977443 | 2 (0.040) | coding (402/579 nt) | flhC | DNA‑binding transcriptional dual regulator FlhC | |||||
TGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTACGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACGTTTTGTTCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGG > NC_000913/1977202‑1977688 | tGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTACGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAg < 1:157821/250‑1 (MQ=255)gggggcAAAAAAAAGCAGCGGGACGTCGTTCCCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTACCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGGGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACGGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagc > 2:106609‑M2/2‑242 (MQ=255) accgcggctggaatgttgcgcctcaccgtatcagttaaacagcctgtactctctgttcatccagcagttgtgggataatatcggcaggattctgggaaagtttacgtctttttactgcccgggatggcggttgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagagtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTcaacaa > 1:357367‑M1/213‑251 (MQ=255) atgttgcgcctcaccgtatcagttaaacagcctgtactctctgttcatccagcagttgtgggataatatcggcaggattctgggaaagtttacgtctttttactgcccgggatggcggttgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACTAATg > 1:361993‑M1/201‑251 (MQ=255) aCCGCGGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGAGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaa > 1:357367‑M2/1‑212 (MQ=255) aTGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcactaatg > 1:361993‑M2/1‑200 (MQ=255) gtatcagttaaacagcctgtactctctgttcatccagcagttgtgggataatatcggcaggattctgggaaagtttacgtctttttactgcccgggatggcggttgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTa > 1:457377‑M1/186‑251 (MQ=255) ttaaacagcctgtactctctgttcatccagcagttgtgggataatatcggcaggattctgggaaagtttacgtctttttactgcccgggatggcggttgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGcc < 1:297706‑M1/71‑1 (MQ=255) gTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggtta > 1:457377‑M2/1‑185 (MQ=255) ttAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgcc < 1:297706‑M2/249‑72 (MQ=255) agttgtgggataatatcggcaggattctgggaaagtttacgtctttttactgcccgggatggcggttgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGt < 1:328980‑M1/104‑1 (MQ=255) agTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgt < 1:328980‑M2/251‑105 (MQ=255) gggaaagtttccgtctttttacggcccgggatggcggttgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCGACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGa > 1:266657‑M1/120‑248 (MQ=255) ggCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAATTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGGCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCg > 1:190904/1‑251 (MQ=255) aaagtttacgtctttttactgcccgggatggcggttgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtattaaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAGGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCg > 2:2902‑M1/117‑251 (MQ=255) acgtctttttactgcccggtatggcggttgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgatcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGTCTTTGATCACCGCAtcgtc > 2:340595‑M1/110‑249 (MQ=255) gggAAAGTTTCCGTCTTTTTACGGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcgacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttga > 1:266657‑M2/1‑119 (MQ=255) ttttactgcccgggatggcggttgacctaagctgcaggcacagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCAtt < 1:225055‑M1/148‑1 (MQ=255) aaaGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTATTAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaggttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccg > 2:2902‑M2/1‑116 (MQ=255) aaaGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAAGTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGACCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTGCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGAACACCGCATCGACGCCAtt > 1:302769/1‑250 (MQ=255) ttacggcccgggatggcggttgacaaaagctgcaggcaaagctgccaaccggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACGTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCGCCGCATCGACGCCATTa > 2:254408‑M1/102‑250 (MQ=255) cccgggatggcgggtgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAAc > 1:83968‑M1/96‑251 (MQ=255) aCGTCTTTTTACTGCCCGGTATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGATCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtagtctttgatcaccgcatcgtc > 2:340595‑M2/1‑109 (MQ=255) gggatggcggttgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACCAACCgg < 2:50612‑M1/159‑1 (MQ=255) ttttACTGCCCGGGATGGCGGTTGACCTAAGCTGCAGGCACAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccatt < 1:225055‑M2/251‑149 (MQ=255) ttACGGCCCGGGATGGCGGTTGACAAAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACCGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccacgttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcgccgcatcgacgccatta > 2:254408‑M2/1‑101 (MQ=255) gttgacataagctgcaggcaaggctgccagcaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTa > 1:570745‑M1/84‑251 (MQ=255) ttgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGAATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTa < 1:437222‑M1/168‑1 (MQ=255) cccGGGATGGCGGGTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaac > 1:83968‑M2/1‑95 (MQ=255) acataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTaaaa < 2:570642‑M1/171‑1 (MQ=255) gggATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacaccaaccgg < 2:50612‑M2/251‑160 (MQ=255) aaagcggcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaatggccgccgcagcagttgcagccggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCGTGTGGGCACTGTTCAAGTTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCTTCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTg > 2:316885‑M1/77‑251 (MQ=255) gTTGACATAAGCTGCAGGCAAGGCTGCCAGCAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagta > 1:570745‑M2/1‑83 (MQ=255) ttGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggaataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagta < 1:437222‑M2/250‑169 (MQ=255) aCATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaa < 2:570642‑M2/250‑172 (MQ=255) aaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTAc < 2:96856‑M1/186‑1 (MQ=255) aaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACa > 1:50612‑M1/65‑251 (MQ=255) aagctgccaacagggtggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAg > 1:130417‑M1/64‑251 (MQ=255) agctgccaacaggctggtgagcttgggtaataaaaatgccgccgcagcagttgcatctggaaAGTTGCAGCGGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCGGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCTCGGTTCAAGGTAGAAACTGTAGGCTTTGAACACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAATCTGCCATGCATTACAGa > 2:561162‑M1/63‑251 (MQ=255) agctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGAGGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGa > 1:450603‑M1/63‑251 (MQ=255) aaagCGGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATGGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCCGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcgtgtgggcactgttcaagttataaacggtaggctttgatcaccgcttcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactg > 2:316885‑M2/2‑76 (MQ=255) gccaacaggctggggagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACAt > 2:225055‑M1/59‑251 (MQ=255) caggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAACACTGCCATGCATTACAGACCATCGa < 2:477806‑M1/196‑1 (MQ=255) aggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGTCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACAGCGAAGc > 1:498497‑M1/53‑251 (MQ=255) aaaGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattaca > 1:50612‑M2/1‑64 (MQ=255) aaaGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattac < 2:96856‑M2/250‑187 (MQ=255) aaGCTGCCAACAGGGTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattacag > 1:130417‑M2/1‑63 (MQ=255) aGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCTTGGGTAATAAAAATGCCGCCGCAGCAGTTGCATCTGGAAagttgcagcgggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccggcagtggtccttcttctgcttgtgggctcggttcaaggtagaaactgtaggctttgaacaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaatctgccatgcattacaga > 2:561162‑M2/1‑62 (MQ=255) aGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgaggccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattacaga > 1:450603‑M2/1‑62 (MQ=255) tgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACg < 2:513350‑M1/206‑1 (MQ=255) gCCAACAGGCTGGGGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattacagaacat > 2:225055‑M2/1‑58 (MQ=255) ggtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACGtttt > 2:94995‑M1/42‑251 (MQ=255) cgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACGtttt > 1:513350‑M1/42‑251 (MQ=255) cAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaacactgccatgcattacagaccatcga < 2:477806‑M2/249‑197 (MQ=255) aGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtggtcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattacagaacagcgaagc > 1:498497‑M2/1‑52 (MQ=255) aataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACGTTTTGTTccc < 1:19024‑M1/216‑1 (MQ=255) tGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattacagaacatcgaagcatgaacg < 2:513350‑M2/251‑207 (MQ=255) aaaatggccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTGTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACGTTTTGTTCCCAGGt > 2:68418‑M1/32‑251 (MQ=255) ggtGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattacagaacatcgaagcatgaacgtttt > 2:94995‑M2/2‑41 (MQ=255) cGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattacagaacatcgaagcatgaacgtttt > 1:513350‑M2/1‑41 (MQ=255) ccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGATGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACAGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTATTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTCCAGAACATCGAAGCATGATCGTTTTGTTCCCAGGTcataaccc < 2:184457‑M1/228‑4 (MQ=255) aataaAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattacagaacatcgaagcatgaacgttttgttccc < 1:19024‑M2/250‑217 (MQ=255) gcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACGTTTTGTTCCCAGGTCATAAACCAGTc < 1:91746‑M1/232‑1 (MQ=255) aagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGTGAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACGTTTTGTTCCCAGGTCATAAACCAGTCg > 1:460316‑M1/19‑251 (MQ=255) agcagttgcagctggaaAGGTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACGTTTTGTTCCCAGGTCATAAACCAGTCgg > 2:274673‑M1/18‑251 (MQ=255) aaaaTGGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggtgttcagtaaaaactgccatgcattacagaacatcgaagcatgaacgttttgttcccaggt > 2:68418‑M2/1‑31 (MQ=255) cagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACGTTTTGTTCCCAGGTCATAACCCAGTCGGtt > 2:437222‑M1/16‑251 (MQ=255) ccgcAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagatggaaagttgcagtaatccactttcaacaaacagcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttattctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattccagaacatcgaagcatgatcgttttgttcccaggtcataaccc < 2:184457‑M2/249‑229 (MQ=255) tggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAACCCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACGTTTTGTTCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGgc < 2:122058‑M1/245‑1 (MQ=255) gcagcaGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattacagaacatcgaagcatgaacgttttgttcccaggtcataaaccagtc < 1:91746‑M2/251‑233 (MQ=255) aagcagtTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacgtgaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattacagaacatcgaagcatgaacgttttgttcccaggtcataaaccagtcg > 1:460316‑M2/2‑18 (MQ=255) agcagTTGCAGCTGGAAaggtgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattacagaacatcgaagcatgaacgttttgttcccaggtcataaaccagtcgg > 2:274673‑M2/1‑17 (MQ=255) cagTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaaaccggttttcagtaaaaactgccatgcattacagaacatcgaagcatgaacgttttgttcccaggtcataacccagtcggtt > 2:437222‑M2/1‑15 (MQ=255) tggaaagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccgcatcgacgccattacacaacccggttttcagtaaaaactgccatgcattacagaacatcgaagcatgaacgttttgttcccaggtcataaaccagtcggttgagaatggc < 2:122058‑M2/250‑246 (MQ=255) | TGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTACGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACGTTTTGTTCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGG > NC_000913/1977202‑1977688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |