| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 1,977,451 | (CTGGAAAGTTGCAG)1→2 | coding (394/579 nt) | flhC ← | DNA‑binding transcriptional dual regulator FlhC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 1977430 = | 5 (0.090) | 36 (0.650) | 33/474 | 0.6 | 91.3% | coding (415/579 nt) | flhC | DNA‑binding transcriptional dual regulator FlhC |
| ? | NC_000913 | = 1977443 | 2 (0.040) | coding (402/579 nt) | flhC | DNA‑binding transcriptional dual regulator FlhC | |||||
CGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTACGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACGTTTTGTTCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCAT > NC_000913/1977188‑1977679 | gggggcaaaaaaaagcagcgggacgtcgttcccgctgctggaatgttgcgcctcaccgtaccagttaaacagcctgtactctctgttcatccagcagttgggggataatatcggcaggattctgggaaagtttacgtctttttacggcccgggatggcggttgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaagttgcagc > 2:106609‑M1/243‑251 (MQ=255) aaCGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTACGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTgg < 1:492143/250‑1 (MQ=255) aaCGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTACGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGGATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTgg < 2:326812/250‑1 (MQ=255) tGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTACGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAg < 1:157821/250‑1 (MQ=255) gggggcAAAAAAAAGCAGCGGGACGTCGTTCCCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTACCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGGGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACGGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagc > 2:106609‑M2/2‑242 (MQ=255) accgcggctggaatgttgcgcctcaccgtatcagttaaacagcctgtactctctgttcatccagcagttgtgggataatatcggcaggattctgggaaagtttacgtctttttactgcccgggatggcggttgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagagtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTcaacaa > 1:357367‑M1/213‑251 (MQ=255) atgttgcgcctcaccgtatcagttaaacagcctgtactctctgttcatccagcagttgtgggataatatcggcaggattctgggaaagtttacgtctttttactgcccgggatggcggttgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACTAATg > 1:361993‑M1/201‑251 (MQ=255) 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gggAAAGTTTCCGTCTTTTTACGGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaagttgcagtaatccactttcgacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttga > 1:266657‑M2/1‑119 (MQ=255) ttttactgcccgggatggcggttgacctaagctgcaggcacagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCAtt < 1:225055‑M1/148‑1 (MQ=255) aaaGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTATTAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAagttgcagctggaaggttgcagtaatccactttcaacaaaccgcaccaatgtccaggcacgggttaatgccagcagtggtccttcttctgcttgtgggcactgttcaaggtataaacggtaggctttgatcaccg > 2:2902‑M2/1‑116 (MQ=255) aaaGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAAGTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGACCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTGCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGAACACCGCATCGACGCCAtt > 1:302769/1‑250 (MQ=255) ttacggcccgggatggcggttgacaaaagctgcaggcaaagctgccaaccggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACGTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCGCCGCATCGACGCCATTa > 2:254408‑M1/102‑250 (MQ=255) cccgggatggcgggtgacataagctgcaggcaaagctgccaacaggctggtgagcgtgggtaataaaattgccgccgcagcagttgcagctggaaAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAAc > 1:83968‑M1/96‑251 (MQ=255) 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CGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTACGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGGGAAAGTTTACGTCTTTTTACTGCCCGGGATGGCGGTTGACATAAGCTGCAGGCAAAGCTGCCAACAGGCTGGTGAGCGTGGGTAATAAAATTGCCGCCGCAGCAGTTGCAGCTGGAAAGTTGCAGTAATCCACTTTCAACAAACCGCACCAATGTCCAGGCACGGGTTAATGCCAGCAGTGGTCCTTCTTCTGCTTGTGGGCACTGTTCAAGGTATAAACGGTAGGCTTTGATCACCGCATCGACGCCATTACACAAACCGGTTTTCAGTAAAAACTGCCATGCATTACAGAACATCGAAGCATGAACGTTTTGTTCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCAT > NC_000913/1977188‑1977679 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |